MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.02

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019698	CTAAT	2	10	218	227	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019698	ATCGA	2	10	1124	1133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019698	TAATT	2	10	1399	1408	40 %	60 %	0 %	0 %	434389903
4	NC_019698	GAACG	2	10	3979	3988	40 %	0 %	40 %	20 %	434389906
5	NC_019698	CAAAA	2	10	4310	4319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019698	CAAGT	2	10	5672	5681	40 %	20 %	20 %	20 %	434389907
7	NC_019698	CCGCT	2	10	9225	9234	0 %	20 %	20 %	60 %	434389910
8	NC_019698	CTCAT	2	10	10375	10384	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_019698	CCTTT	2	10	12988	12997	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_019698	AATTA	2	10	15424	15433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019698	TAATC	2	10	16459	16468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019698	GAAAT	2	10	16569	16578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019698	ATGAG	2	10	16737	16746	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019698	CTTAA	2	10	17492	17501	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019698	GCAGG	2	10	19433	19442	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019698	AAAAT	2	10	25585	25594	80 %	20 %	0 %	0 %	434389918
17	NC_019698	TCGAT	2	10	28814	28823	20 %	40 %	20 %	20 %	434389920
18	NC_019698	TCACT	2	10	29618	29627	20 %	40 %	0 %	40 %	434389920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.