MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605 plasmid pCHA6605.02

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019698	ATCG	2	8	503	510	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019698	TCGA	2	8	537	544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019698	TACT	2	8	2241	2248	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019698	CGGA	2	8	4320	4327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019698	CCTT	2	8	7453	7460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019698	GAGG	2	8	7705	7712	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019698	TCGA	2	8	8768	8775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019698	CGAT	2	8	10772	10779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019698	AACG	2	8	10843	10850	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019698	CGAT	2	8	11314	11321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019698	CGAT	2	8	11342	11349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019698	GAAA	2	8	11452	11459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019698	ATCT	2	8	15387	15394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019698	TAAT	2	8	15621	15628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019698	ACTT	2	8	15678	15685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019698	AGAA	2	8	16356	16363	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019698	GAAA	2	8	16399	16406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019698	AAAT	2	8	16542	16549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019698	AGAA	2	8	16903	16910	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019698	ATCG	2	8	16967	16974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019698	CAAT	2	8	17154	17161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019698	ATCT	2	8	17215	17222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019698	CGAT	2	8	17263	17270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019698	TAAG	2	8	17295	17302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019698	TCTA	2	8	17479	17486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019698	AGTC	2	8	17542	17549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019698	GCGA	2	8	19125	19132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019698	TTAA	2	8	19322	19329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019698	CGAT	2	8	19701	19708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019698	AGTT	2	8	20140	20147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019698	AATT	2	8	20567	20574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019698	AATT	2	8	20926	20933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019698	TCGA	2	8	21426	21433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019698	TCTA	2	8	21844	21851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019698	ACAA	2	8	21932	21939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019698	CTTA	2	8	22994	23001	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019698	AGTT	2	8	26182	26189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019698	CGAT	2	8	26194	26201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019698	ACCT	2	8	26257	26264	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019698	AATA	2	8	26754	26761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.