MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 78069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019697	GCG	2	6	63	68	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384226
2	NC_019697	AAG	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
3	NC_019697	GAT	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384226
4	NC_019697	GCT	2	6	368	373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
5	NC_019697	TTA	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384226
6	NC_019697	CGA	2	6	515	520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384226
7	NC_019697	GAA	2	6	534	539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
8	NC_019697	AGA	2	6	545	550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
9	NC_019697	AAG	2	6	556	561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
10	NC_019697	TCG	2	6	736	741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
11	NC_019697	GTC	2	6	832	837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
12	NC_019697	TGG	2	6	854	859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384226
13	NC_019697	ACG	2	6	865	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384226
14	NC_019697	ATT	2	6	936	941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384226
15	NC_019697	GCT	2	6	945	950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
16	NC_019697	TTA	2	6	981	986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384226
17	NC_019697	TGA	2	6	1153	1158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384226
18	NC_019697	AGC	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384226
19	NC_019697	AAG	2	6	1192	1197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
20	NC_019697	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
21	NC_019697	TCG	2	6	1330	1335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
22	NC_019697	TCC	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384226
23	NC_019697	CGA	3	9	1456	1464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384226
24	NC_019697	AGA	2	6	1481	1486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384226
25	NC_019697	CTG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
26	NC_019697	GTG	2	6	1525	1530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384226
27	NC_019697	GGA	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384226
28	NC_019697	TCG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384226
29	NC_019697	CAT	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384226
30	NC_019697	TTA	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384226
31	NC_019697	AGA	2	6	2023	2028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019697	CTG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019697	TTC	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384227
34	NC_019697	AGT	2	6	2439	2444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384227
35	NC_019697	TAA	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384227
36	NC_019697	GTC	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384227
37	NC_019697	GTC	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384227
38	NC_019697	GGC	2	6	2602	2607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384227
39	NC_019697	TGG	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384227
40	NC_019697	GCA	3	9	2695	2703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384227
41	NC_019697	CAT	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384227
42	NC_019697	CAA	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384227
43	NC_019697	AAT	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384227
44	NC_019697	GTT	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019697	CGA	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384228
46	NC_019697	GGC	2	6	3488	3493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384228
47	NC_019697	CGA	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384228
48	NC_019697	GTT	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384228
49	NC_019697	GCG	2	6	3662	3667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384228
50	NC_019697	CGG	2	6	3715	3720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384228
51	NC_019697	ATG	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384228
52	NC_019697	CGG	2	6	3820	3825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384228
53	NC_019697	CCG	2	6	3871	3876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384228
54	NC_019697	ACC	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384228
55	NC_019697	AAT	2	6	4140	4145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384228
56	NC_019697	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434384229
57	NC_019697	AGG	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384229
58	NC_019697	TCG	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384229
59	NC_019697	GGC	2	6	4564	4569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384229
60	NC_019697	AAT	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384229
61	NC_019697	ATC	2	6	4621	4626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384229
62	NC_019697	GGA	2	6	4652	4657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384229
63	NC_019697	AAT	2	6	4771	4776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384230
64	NC_019697	CTT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384230
65	NC_019697	TGC	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384230
66	NC_019697	GAT	2	6	5014	5019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384230
67	NC_019697	CTG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384230
68	NC_019697	TCA	2	6	5161	5166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384230
69	NC_019697	CCT	3	9	5194	5202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384230
70	NC_019697	CGT	2	6	5222	5227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384230
71	NC_019697	GGC	2	6	5248	5253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434384230
72	NC_019697	TAA	2	6	5315	5320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384230
73	NC_019697	CCG	2	6	5373	5378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384230
74	NC_019697	AAT	2	6	5523	5528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384230
75	NC_019697	AAT	2	6	5646	5651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384230
76	NC_019697	CTC	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_019697	GCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019697	TCT	2	6	6052	6057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384231
79	NC_019697	GCT	2	6	6270	6275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384231
80	NC_019697	GTC	2	6	6280	6285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384231
81	NC_019697	CTG	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384232
82	NC_019697	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384232
83	NC_019697	TCT	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384232
84	NC_019697	TAA	2	6	6612	6617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384232
85	NC_019697	GAT	2	6	6716	6721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384232
86	NC_019697	TCA	2	6	6778	6783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384232
87	NC_019697	GCT	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384232
88	NC_019697	TGC	2	6	6875	6880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384232
89	NC_019697	TTA	2	6	6895	6900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434384232
90	NC_019697	CTG	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384233
91	NC_019697	ACC	2	6	7291	7296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384233
92	NC_019697	CTT	3	9	7427	7435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384233
93	NC_019697	CTT	2	6	7448	7453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384233
94	NC_019697	AGC	2	6	7591	7596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384233
95	NC_019697	CGA	2	6	7613	7618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384233
96	NC_019697	ATA	2	6	7645	7650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384233
97	NC_019697	AAT	2	6	7654	7659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384233
98	NC_019697	CAA	3	9	7746	7754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384233
99	NC_019697	ATA	2	6	7870	7875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384233
100	NC_019697	GGT	2	6	7903	7908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434384233
101	NC_019697	TTC	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384233
102	NC_019697	GGA	2	6	7995	8000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434384234
103	NC_019697	CTT	2	6	8277	8282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384234
104	NC_019697	CTA	2	6	8636	8641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384234
105	NC_019697	GCT	2	6	8896	8901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384235
106	NC_019697	AAT	2	6	8940	8945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384235
107	NC_019697	CAA	2	6	8999	9004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434384235
108	NC_019697	TAA	2	6	9027	9032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384235
109	NC_019697	AAT	2	6	9091	9096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384235
110	NC_019697	TTC	2	6	9144	9149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384235
111	NC_019697	AGC	2	6	9169	9174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384235
112	NC_019697	CTG	2	6	9353	9358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384235
113	NC_019697	CTC	2	6	9381	9386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434384235
114	NC_019697	GAA	2	6	9454	9459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019697	AAT	2	6	9462	9467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019697	TTG	3	9	9514	9522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434384236
117	NC_019697	CAC	2	6	9585	9590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384236
118	NC_019697	CAC	2	6	9595	9600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384236
119	NC_019697	CTA	2	6	9645	9650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384236
120	NC_019697	AAT	2	6	9672	9677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434384236
121	NC_019697	GCC	2	6	9718	9723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384236
122	NC_019697	GTA	2	6	9850	9855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384236
123	NC_019697	CTT	2	6	9915	9920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434384236
124	NC_019697	ATG	2	6	10001	10006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384236
125	NC_019697	GCC	3	9	10153	10161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434384237
126	NC_019697	TGC	2	6	10183	10188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384237
127	NC_019697	GAC	2	6	10198	10203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434384237
128	NC_019697	GAT	2	6	10206	10211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434384237
129	NC_019697	TAA	2	6	10339	10344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019697	TAA	3	9	10537	10545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019697	AGT	2	6	10566	10571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_019697	CCA	3	9	21642	21650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434384243
252	NC_019697	TCA	2	6	21679	21684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434384243
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255	NC_019697	TCG	2	6	22014	22019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434384243
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