MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chamaesiphon minutus PCC 6605

Total Repeats: 13431

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019697	AGA	2	6	2023	2028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019697	CTG	2	6	2115	2120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019697	GTT	2	6	2990	2995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019697	CTC	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_019697	GCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019697	GAA	2	6	9454	9459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019697	AAT	2	6	9462	9467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019697	TAA	2	6	10339	10344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019697	TAA	3	9	10537	10545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019697	AGT	2	6	10566	10571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019697	AGT	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019697	AAT	2	6	11452	11457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019697	TAA	2	6	11489	11494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019697	CGC	2	6	11518	11523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019697	CGC	2	6	11600	11605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019697	CAT	2	6	11681	11686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019697	GCC	3	9	11733	11741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019697	CGC	2	6	11790	11795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_019697	CGC	2	6	11865	11870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019697	AAG	2	6	13068	13073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019697	GCA	2	6	13189	13194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019697	GAA	2	6	13241	13246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019697	GAT	2	6	13496	13501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019697	AGA	2	6	13534	13539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019697	ACT	2	6	13543	13548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019697	TCG	2	6	13559	13564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019697	ATT	2	6	13672	13677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019697	GTT	2	6	13700	13705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019697	GCG	2	6	13808	13813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019697	ACA	2	6	13819	13824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019697	CTG	2	6	13873	13878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019697	TAA	2	6	17873	17878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019697	TCT	2	6	20442	20447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019697	TTA	2	6	25450	25455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019697	TAG	2	6	25497	25502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019697	AGG	2	6	25530	25535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019697	ATT	2	6	28044	28049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019697	TAA	2	6	28140	28145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019697	AGT	2	6	29813	29818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019697	GTG	2	6	31738	31743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019697	ATA	2	6	31824	31829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019697	TAA	2	6	32900	32905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019697	ACC	2	6	32936	32941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019697	CAG	2	6	32955	32960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019697	TGG	2	6	35276	35281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019697	GTT	2	6	35349	35354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019697	CGC	2	6	35416	35421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019697	CTC	2	6	35643	35648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019697	GCG	2	6	35652	35657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019697	TTC	2	6	36729	36734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019697	CTC	2	6	36742	36747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019697	CGA	2	6	36827	36832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019697	TCT	2	6	36894	36899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019697	TGG	2	6	36911	36916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019697	ATT	2	6	38770	38775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019697	CTA	2	6	38847	38852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019697	TCA	2	6	38929	38934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019697	CCA	2	6	38969	38974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019697	GCG	2	6	39076	39081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019697	AGA	2	6	39143	39148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019697	AGG	2	6	39254	39259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019697	TAA	3	9	39591	39599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019697	CAG	2	6	41535	41540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019697	ATT	2	6	41549	41554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019697	TAG	2	6	41606	41611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019697	TCC	2	6	41632	41637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_019697	TAC	2	6	41675	41680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019697	TAA	2	6	43087	43092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019697	TGA	2	6	43128	43133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019697	CAC	2	6	43134	43139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019697	TAG	2	6	43631	43636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019697	TCA	2	6	43677	43682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019697	ACT	2	6	43761	43766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019697	TTC	2	6	43778	43783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019697	AAT	2	6	47927	47932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019697	GTC	2	6	48548	48553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019697	TAA	2	6	48640	48645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019697	ATA	2	6	48752	48757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019697	GCT	2	6	48774	48779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019697	ATT	2	6	48859	48864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019697	TGC	2	6	49676	49681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019697	AGT	2	6	49709	49714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019697	AAG	2	6	51265	51270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019697	GTC	2	6	51352	51357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019697	TAA	2	6	51376	51381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019697	CGT	2	6	51390	51395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019697	ATA	2	6	51459	51464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019697	GAT	2	6	55724	55729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019697	ACT	2	6	55740	55745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019697	CTA	2	6	55747	55752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019697	GGA	2	6	57039	57044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019697	CAA	2	6	57083	57088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019697	AGT	2	6	57144	57149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019697	TCA	2	6	57152	57157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019697	TAA	2	6	61091	61096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019697	ATA	2	6	61196	61201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019697	TGG	2	6	61302	61307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019697	CTA	2	6	61327	61332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019697	TAG	2	6	61390	61395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019697	CGG	2	6	61399	61404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019697	GTC	2	6	61431	61436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019697	CAT	2	6	61437	61442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019697	GGC	2	6	62727	62732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019697	GGC	2	6	63285	63290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019697	AGT	2	6	63311	63316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019697	GTA	2	6	63743	63748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019697	CGC	2	6	63840	63845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_019697	ATT	2	6	63847	63852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019697	ATG	2	6	65525	65530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019697	ATA	2	6	66904	66909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019697	CAC	2	6	66927	66932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_019697	ACT	2	6	66975	66980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019697	ATT	2	6	67829	67834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019697	TCC	2	6	68604	68609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019697	ACT	2	6	68628	68633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019697	AAT	2	6	69605	69610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019697	CAG	2	6	69629	69634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019697	CGG	2	6	69687	69692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019697	GCT	2	6	69701	69706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019697	AAT	2	6	69738	69743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019697	TGT	2	6	70812	70817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019697	ATA	2	6	70821	70826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019697	ATT	2	6	72492	72497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019697	AAT	2	6	74315	74320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019697	TTC	2	6	74641	74646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019697	TAA	2	6	75878	75883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019697	CCT	2	6	75974	75979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_019697	CCA	2	6	76062	76067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019697	GCC	2	6	76302	76307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019697	GTA	2	6	77328	77333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019697	ATA	2	6	81583	81588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019697	TAT	2	6	84131	84136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019697	GTT	2	6	84746	84751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019697	CTT	2	6	84838	84843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019697	AAG	2	6	84845	84850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019697	GTT	2	6	85627	85632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019697	AAC	2	6	85699	85704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019697	CTG	2	6	87835	87840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_019697	GAG	2	6	87926	87931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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