MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 plasmid pCHRO.02

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019696	GCT	2	6	137	142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019696	AGC	2	6	158	163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019696	CCA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_019696	GTG	2	6	286	291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019696	ACT	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019696	TAG	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210483
7	NC_019696	TAC	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210483
8	NC_019696	ACT	2	6	561	566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210483
9	NC_019696	ATT	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428210483
10	NC_019696	CCA	2	6	651	656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210483
11	NC_019696	ATT	2	6	697	702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019696	TTC	2	6	738	743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428210484
13	NC_019696	ATC	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210484
14	NC_019696	ACC	2	6	788	793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428210484
15	NC_019696	CTC	3	9	861	869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428210484
16	NC_019696	TTC	2	6	880	885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428210484
17	NC_019696	TAG	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210484
18	NC_019696	CAG	2	6	1031	1036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210484
19	NC_019696	CTA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210484
20	NC_019696	TGC	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210484
21	NC_019696	CTG	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210484
22	NC_019696	CAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210484
23	NC_019696	GCA	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428210484
24	NC_019696	CGC	2	6	1435	1440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428210484
25	NC_019696	TGC	2	6	1479	1484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428210484
26	NC_019696	CAT	2	6	1508	1513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428210484
27	NC_019696	GAT	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428210484
28	NC_019696	ACT	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019696	TAT	2	6	2086	2091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019696	CAA	2	6	2188	2193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019696	CAA	2	6	2326	2331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019696	TTG	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019696	CGC	2	6	2420	2425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019696	CTA	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019696	GCT	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.