MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019695	TCAAC	2	10	4640	4649	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019695	GAAAC	2	10	7154	7163	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019695	TAGGA	2	10	7262	7271	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019695	CTTAT	2	10	16927	16936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019695	CTCTG	2	10	41117	41126	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_019695	TGCGT	2	10	60080	60089	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019695	TGTGG	2	10	79615	79624	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019695	GCTTG	2	10	81927	81936	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019695	TTAAG	2	10	98487	98496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019695	AGGAT	2	10	119354	119363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019695	CAGAG	2	10	132834	132843	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019695	ATAAA	2	10	134128	134137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019695	GAAAT	2	10	140258	140267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019695	TTGAG	2	10	148833	148842	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019695	TTTAA	2	10	160528	160537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019695	GACAA	2	10	160662	160671	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019695	AGGTA	2	10	176542	176551	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019695	CCGCA	2	10	196843	196852	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_019695	GAATT	2	10	203742	203751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019695	ACCAA	2	10	204356	204365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_019695	TTGCT	2	10	210264	210273	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019695	TTACA	2	10	210466	210475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019695	TAAGA	2	10	222865	222874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019695	ATTTA	2	10	265766	265775	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019695	CATAA	2	10	268150	268159	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019695	TAAAA	2	10	280662	280671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019695	CTAGA	2	10	290647	290656	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019695	TAAAT	2	10	296837	296846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019695	AATCT	2	10	298616	298625	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019695	GTGTT	2	10	304415	304424	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019695	TTCAA	2	10	321278	321287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019695	CAACA	2	10	338674	338683	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019695	TCCTG	2	10	355144	355153	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_019695	AGCAG	2	10	376225	376234	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019695	AAATA	2	10	406359	406368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019695	GTGGG	2	10	423068	423077	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019695	GTTTT	2	10	429761	429770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019695	TGTGC	2	10	466231	466240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_019695	TTAAA	2	10	466590	466599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019695	ATGAC	2	10	475608	475617	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019695	TATCG	2	10	475947	475956	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019695	TAGCT	2	10	479087	479096	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019695	AGGAG	2	10	480530	480539	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019695	CACAC	2	10	484171	484180	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_019695	ACTAT	2	10	495328	495337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019695	TAACT	2	10	495470	495479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019695	ATACA	2	10	517224	517233	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019695	ATCAC	2	10	517289	517298	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019695	AGAAA	2	10	518805	518814	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019695	AATCT	2	10	520094	520103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_019695	TATTG	2	10	520356	520365	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019695	AATGC	2	10	520561	520570	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019695	ATTCT	2	10	520768	520777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_019695	TGATA	2	10	523374	523383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019695	ACTCA	2	10	529294	529303	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_019695	AAAAT	2	10	533523	533532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019695	GACAT	2	10	535669	535678	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019695	TGAAG	2	10	548128	548137	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019695	TCTTT	2	10	561934	561943	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019695	AGAGT	2	10	577576	577585	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019695	TGAGT	2	10	585702	585711	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019695	GTGAG	2	10	603042	603051	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019695	TTTGC	2	10	604902	604911	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019695	AAGCT	2	10	606431	606440	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019695	ACTAC	2	10	615321	615330	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_019695	TCTAA	2	10	618514	618523	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019695	AAATC	2	10	626957	626966	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019695	CAAGC	2	10	627071	627080	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_019695	ATTAA	2	10	653510	653519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019695	AGTTT	2	10	657910	657919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019695	TCATT	2	10	690777	690786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_019695	TGACA	2	10	699653	699662	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019695	ATTTA	2	10	701885	701894	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019695	CTATT	2	10	709702	709711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019695	TAAGC	2	10	726111	726120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019695	GAATT	2	10	730500	730509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019695	TTTGT	2	10	752010	752019	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019695	TAAAG	2	10	759654	759663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019695	AATTG	2	10	766196	766205	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019695	CAATT	2	10	774432	774441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_019695	GTCAA	2	10	807444	807453	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019695	CAATT	2	10	813649	813658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019695	AAGAA	2	10	825120	825129	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019695	AGGTG	2	10	841110	841119	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019695	ACAAG	2	10	844330	844339	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_019695	CATAT	2	10	859013	859022	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_019695	ACGCA	2	10	859193	859202	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_019695	TTCGC	2	10	859228	859237	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_019695	AGTAA	2	10	872883	872892	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019695	AAGTA	2	10	874376	874385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019695	TTAAA	2	10	875969	875978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019695	TCAAT	2	10	880380	880389	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019695	TCTAT	2	10	883055	883064	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019695	CAATT	2	10	895329	895338	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019695	TTGGC	2	10	921088	921097	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_019695	TGCCA	2	10	922080	922089	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019695	ACAAA	2	10	933812	933821	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019695	ACTCA	2	10	941847	941856	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_019695	TAATT	2	10	953116	953125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019695	CCAGC	2	10	953168	953177	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_019695	CATCT	2	10	959803	959812	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_019695	TCAAA	2	10	960403	960412	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019695	CTGGG	2	10	960772	960781	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019695	ATCAA	2	10	963833	963842	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019695	TGGTT	2	10	964784	964793	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019695	TTTTG	2	10	967833	967842	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019695	GGGTA	2	10	976127	976136	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019695	TGATG	2	10	984551	984560	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019695	GCCCT	2	10	984702	984711	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_019695	TTTAG	2	10	1005016	1005025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019695	TTAAA	2	10	1007630	1007639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019695	GCAGT	2	10	1013501	1013510	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019695	GTATT	2	10	1015138	1015147	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019695	AACTT	2	10	1018896	1018905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019695	ATTAA	2	10	1025051	1025060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019695	ATTTA	2	10	1033496	1033505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019695	AGAGG	2	10	1051067	1051076	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019695	GAGAA	2	10	1054693	1054702	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019695	CTTTA	2	10	1056980	1056989	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019695	ACGAT	2	10	1057460	1057469	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019695	AGATG	2	10	1058230	1058239	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019695	TTATG	2	10	1058424	1058433	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019695	CACAC	2	10	1068433	1068442	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_019695	GCTCA	2	10	1077529	1077538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019695	ACGCA	2	10	1083854	1083863	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_019695	TTCGC	2	10	1083889	1083898	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019695	GTTTT	2	10	1096116	1096125	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019695	CTTGC	2	10	1109735	1109744	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_019695	AAAAG	2	10	1118234	1118243	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019695	CGATT	2	10	1118331	1118340	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019695	AAGTT	2	10	1124521	1124530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019695	GAGAG	2	10	1138771	1138780	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019695	GAAAA	2	10	1144199	1144208	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019695	CAAAT	2	10	1147471	1147480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019695	ATTTC	2	10	1158204	1158213	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019695	TTTTG	2	10	1172111	1172120	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019695	AAATC	2	10	1179265	1179274	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019695	ATTAC	3	15	1195944	1195958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019695	GTATG	2	10	1196115	1196124	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019695	TACCT	2	10	1207621	1207630	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_019695	CTTTT	2	10	1221495	1221504	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019695	TTAAC	2	10	1221811	1221820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019695	CTGGT	2	10	1225061	1225070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019695	GTAAG	2	10	1234799	1234808	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019695	AATAC	2	10	1234871	1234880	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019695	TACAT	2	10	1259041	1259050	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019695	TCGAT	2	10	1259169	1259178	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_019695	CTACT	2	10	1260360	1260369	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_019695	CAAAA	2	10	1267512	1267521	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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152	NC_019695	TTTAC	2	10	1301326	1301335	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_019695	GGTGT	2	10	1306180	1306189	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_019695	ATCAA	2	10	1321485	1321494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_019695	GTTTC	2	10	1326368	1326377	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_019695	AAATT	2	10	1341635	1341644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019695	AACTT	2	10	1347460	1347469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_019695	TAATT	2	10	1351956	1351965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019695	ATCGC	2	10	1359638	1359647	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_019695	AAAAG	2	10	1371855	1371864	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019695	TTTAC	2	10	1375344	1375353	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_019695	AAGCA	2	10	1378317	1378326	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_019695	GTTTT	2	10	1383643	1383652	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_019695	TCGCG	2	10	1393234	1393243	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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173	NC_019695	ACAAA	2	10	1413316	1413325	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_019695	TTAAG	2	10	1425024	1425033	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_019695	TTAAG	2	10	1458357	1458366	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_019695	CTAAA	2	10	1480348	1480357	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_019695	AGATA	2	10	1483213	1483222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_019695	TAACC	2	10	1511182	1511191	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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186	NC_019695	TCGTT	2	10	1528690	1528699	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_019695	TAAAC	2	10	1553369	1553378	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_019695	TTAAA	2	10	1565914	1565923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_019695	CTACA	2	10	1589799	1589808	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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263	NC_019695	AGAAC	2	10	2028262	2028271	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_019695	AATTA	2	10	2125757	2125766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_019695	AATTC	2	10	2169394	2169403	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_019695	ATCGC	2	10	2233454	2233463	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_019695	GTATG	2	10	2236855	2236864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
286	NC_019695	AGTCA	2	10	2247948	2247957	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_019695	CTTGT	2	10	2258732	2258741	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_019695	CCTTC	2	10	2259403	2259412	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
289	NC_019695	CAAAT	2	10	2260931	2260940	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_019695	CTTTT	2	10	2285012	2285021	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_019695	ACATT	2	10	2285283	2285292	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_019695	GTAGC	2	10	2285317	2285326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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299	NC_019695	CTTAT	2	10	2300952	2300961	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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303	NC_019695	AGTAG	2	10	2315773	2315782	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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346	NC_019695	AATTT	2	10	2591005	2591014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_019695	CTATG	2	10	3057157	3057166	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
403	NC_019695	ATACA	2	10	3059275	3059284	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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405	NC_019695	CTTGA	2	10	3061249	3061258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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410	NC_019695	ATAAA	2	10	3091281	3091290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_019695	AATTG	2	10	3177414	3177423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_019695	CTTAG	2	10	3186002	3186011	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
421	NC_019695	CAATT	2	10	3186040	3186049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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