MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 3377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019695	CCAAA	2	10	867	876	60 %	0 %	0 %	40 %	428205074
2	NC_019695	GCGTC	2	10	7927	7936	0 %	20 %	40 %	40 %	428205080
3	NC_019695	TAGTT	2	10	11500	11509	20 %	60 %	20 %	0 %	428205083
4	NC_019695	TAAAT	2	10	12166	12175	60 %	40 %	0 %	0 %	428205083
5	NC_019695	ATCTA	2	10	17124	17133	40 %	40 %	0 %	20 %	428205087
6	NC_019695	TCTGC	2	10	18783	18792	0 %	40 %	20 %	40 %	428205088
7	NC_019695	CAGTC	2	10	19848	19857	20 %	20 %	20 %	40 %	428205089
8	NC_019695	CTTTG	2	10	21236	21245	0 %	60 %	20 %	20 %	428205089
9	NC_019695	TGGCT	2	10	21289	21298	0 %	40 %	40 %	20 %	428205089
10	NC_019695	GTCAA	2	10	25217	25226	40 %	20 %	20 %	20 %	428205092
11	NC_019695	TAACT	2	10	25955	25964	40 %	40 %	0 %	20 %	428205093
12	NC_019695	GAAAT	2	10	26542	26551	60 %	20 %	20 %	0 %	428205094
13	NC_019695	CGTGA	2	10	29208	29217	20 %	20 %	40 %	20 %	428205096
14	NC_019695	CCCCG	2	10	34560	34569	0 %	0 %	20 %	80 %	428205099
15	NC_019695	CCGCT	2	10	35361	35370	0 %	20 %	20 %	60 %	428205099
16	NC_019695	GAAAC	2	10	37779	37788	60 %	0 %	20 %	20 %	428205100
17	NC_019695	ACCTC	2	10	39506	39515	20 %	20 %	0 %	60 %	428205102
18	NC_019695	GATTT	2	10	43596	43605	20 %	60 %	20 %	0 %	428205107
19	NC_019695	GTTCC	2	10	44226	44235	0 %	40 %	20 %	40 %	428205107
20	NC_019695	TCCTT	2	10	44622	44631	0 %	60 %	0 %	40 %	428205108
21	NC_019695	AAGTA	2	10	45040	45049	60 %	20 %	20 %	0 %	428205109
22	NC_019695	TAGCC	2	10	45792	45801	20 %	20 %	20 %	40 %	428205109
23	NC_019695	CCCGC	2	10	49004	49013	0 %	0 %	20 %	80 %	428205111
24	NC_019695	GTTTG	2	10	49150	49159	0 %	60 %	40 %	0 %	428205111
25	NC_019695	CGAGC	2	10	51520	51529	20 %	0 %	40 %	40 %	428205112
26	NC_019695	CTGGT	2	10	51634	51643	0 %	40 %	40 %	20 %	428205113
27	NC_019695	ATAGA	2	10	52673	52682	60 %	20 %	20 %	0 %	428205114
28	NC_019695	ATCGT	2	10	57575	57584	20 %	40 %	20 %	20 %	428205119
29	NC_019695	TCATC	2	10	58365	58374	20 %	40 %	0 %	40 %	428205119
30	NC_019695	TCAAT	2	10	59281	59290	40 %	40 %	0 %	20 %	428205121
31	NC_019695	CAACT	2	10	59585	59594	40 %	20 %	0 %	40 %	428205121
32	NC_019695	TTTGA	2	10	61894	61903	20 %	60 %	20 %	0 %	428205123
33	NC_019695	TGCCT	2	10	62548	62557	0 %	40 %	20 %	40 %	428205123
34	NC_019695	GAATT	2	10	62721	62730	40 %	40 %	20 %	0 %	428205123
35	NC_019695	GCCAA	2	10	66855	66864	40 %	0 %	20 %	40 %	428205129
36	NC_019695	TCTTA	2	10	68053	68062	20 %	60 %	0 %	20 %	428205130
37	NC_019695	CGGTG	2	10	70149	70158	0 %	20 %	60 %	20 %	428205131
38	NC_019695	TGAGT	2	10	72197	72206	20 %	40 %	40 %	0 %	428205132
39	NC_019695	AATCT	2	10	76510	76519	40 %	40 %	0 %	20 %	428205136
40	NC_019695	GGTTT	2	10	83303	83312	0 %	60 %	40 %	0 %	428205141
41	NC_019695	CGGTA	2	10	84036	84045	20 %	20 %	40 %	20 %	428205141
42	NC_019695	CACAT	2	10	84419	84428	40 %	20 %	0 %	40 %	428205142
43	NC_019695	AAGAG	2	10	88715	88724	60 %	0 %	40 %	0 %	428205147
44	NC_019695	GTATC	2	10	90954	90963	20 %	40 %	20 %	20 %	428205150
45	NC_019695	GAATT	2	10	94220	94229	40 %	40 %	20 %	0 %	428205151
46	NC_019695	GAACT	2	10	94622	94631	40 %	20 %	20 %	20 %	428205151
47	NC_019695	CTGCA	2	10	95361	95370	20 %	20 %	20 %	40 %	428205151
48	NC_019695	GGTAC	2	10	97566	97575	20 %	20 %	40 %	20 %	428205152
49	NC_019695	TTGTG	2	10	97849	97858	0 %	60 %	40 %	0 %	428205152
50	NC_019695	TACTC	2	10	98207	98216	20 %	40 %	0 %	40 %	428205153
51	NC_019695	TGTTT	2	10	100505	100514	0 %	80 %	20 %	0 %	428205155
52	NC_019695	GCTCG	2	10	102192	102201	0 %	20 %	40 %	40 %	428205156
53	NC_019695	AGGTT	2	10	102914	102923	20 %	40 %	40 %	0 %	428205157
54	NC_019695	TGAGT	2	10	107655	107664	20 %	40 %	40 %	0 %	428205163
55	NC_019695	CTGCG	2	10	108551	108560	0 %	20 %	40 %	40 %	428205164
56	NC_019695	GCTTA	2	10	108907	108916	20 %	40 %	20 %	20 %	428205164
57	NC_019695	AAGAT	2	10	109506	109515	60 %	20 %	20 %	0 %	428205164
58	NC_019695	CGAAC	2	10	112200	112209	40 %	0 %	20 %	40 %	428205166
59	NC_019695	TATTG	2	10	116959	116968	20 %	60 %	20 %	0 %	428205169
60	NC_019695	AATGA	2	10	118471	118480	60 %	20 %	20 %	0 %	428205170
61	NC_019695	ATTAC	2	10	119906	119915	40 %	40 %	0 %	20 %	428205171
62	NC_019695	ACTGG	2	10	123330	123339	20 %	20 %	40 %	20 %	428205174
63	NC_019695	CCTTT	2	10	123443	123452	0 %	60 %	0 %	40 %	428205174
64	NC_019695	TACAG	2	10	124164	124173	40 %	20 %	20 %	20 %	428205174
65	NC_019695	ACAGT	2	10	125947	125956	40 %	20 %	20 %	20 %	428205175
66	NC_019695	GATTG	2	10	126966	126975	20 %	40 %	40 %	0 %	428205176
67	NC_019695	GAATA	2	10	127062	127071	60 %	20 %	20 %	0 %	428205176
68	NC_019695	AGAAA	2	10	128375	128384	80 %	0 %	20 %	0 %	428205177
69	NC_019695	ATATG	2	10	128843	128852	40 %	40 %	20 %	0 %	428205177
70	NC_019695	ATAAC	2	10	131548	131557	60 %	20 %	0 %	20 %	428205180
71	NC_019695	ACCTG	2	10	136677	136686	20 %	20 %	20 %	40 %	428205187
72	NC_019695	GAGCA	2	10	141388	141397	40 %	0 %	40 %	20 %	428205190
73	NC_019695	AATTT	2	10	142071	142080	40 %	60 %	0 %	0 %	428205190
74	NC_019695	ATATT	2	10	142255	142264	40 %	60 %	0 %	0 %	428205190
75	NC_019695	GTTAA	2	10	149960	149969	40 %	40 %	20 %	0 %	428205192
76	NC_019695	TCGAT	2	10	153940	153949	20 %	40 %	20 %	20 %	428205195
77	NC_019695	GCAAA	2	10	154070	154079	60 %	0 %	20 %	20 %	428205195
78	NC_019695	AGATG	2	10	154895	154904	40 %	20 %	40 %	0 %	428205196
79	NC_019695	TTTGG	2	10	159171	159180	0 %	60 %	40 %	0 %	428205199
80	NC_019695	GATTG	2	10	159356	159365	20 %	40 %	40 %	0 %	428205199
81	NC_019695	GAAGG	2	10	160349	160358	40 %	0 %	60 %	0 %	428205199
82	NC_019695	GGAAA	2	10	162202	162211	60 %	0 %	40 %	0 %	428205201
83	NC_019695	TACCT	2	10	163662	163671	20 %	40 %	0 %	40 %	428205203
84	NC_019695	AAGCC	2	10	163960	163969	40 %	0 %	20 %	40 %	428205203
85	NC_019695	TTGGT	2	10	165314	165323	0 %	60 %	40 %	0 %	428205204
86	NC_019695	TTTCA	2	10	165870	165879	20 %	60 %	0 %	20 %	428205205
87	NC_019695	GGTGC	2	10	168759	168768	0 %	20 %	60 %	20 %	428205207
88	NC_019695	AGGAG	2	10	169391	169400	40 %	0 %	60 %	0 %	428205207
89	NC_019695	CTACC	2	10	171260	171269	20 %	20 %	0 %	60 %	428205210
90	NC_019695	GTTTG	2	10	172374	172383	0 %	60 %	40 %	0 %	428205211
91	NC_019695	CAACT	2	10	174082	174091	40 %	20 %	0 %	40 %	428205212
92	NC_019695	TCAAA	2	10	176980	176989	60 %	20 %	0 %	20 %	428205214
93	NC_019695	AGCAA	2	10	180158	180167	60 %	0 %	20 %	20 %	428205216
94	NC_019695	AGCCA	2	10	181769	181778	40 %	0 %	20 %	40 %	428205218
95	NC_019695	AAGTA	2	10	182061	182070	60 %	20 %	20 %	0 %	428205219
96	NC_019695	TATGC	2	10	185696	185705	20 %	40 %	20 %	20 %	428205221
97	NC_019695	AGAGG	2	10	186705	186714	40 %	0 %	60 %	0 %	428205222
98	NC_019695	TTATC	2	10	187491	187500	20 %	60 %	0 %	20 %	428205223
99	NC_019695	TGGGG	2	10	189981	189990	0 %	20 %	80 %	0 %	428205225
100	NC_019695	CGATC	2	10	191912	191921	20 %	20 %	20 %	40 %	428205227
101	NC_019695	GTTTG	2	10	194140	194149	0 %	60 %	40 %	0 %	428205229
102	NC_019695	CTTCA	2	10	197056	197065	20 %	40 %	0 %	40 %	428205231
103	NC_019695	CGTCA	2	10	197916	197925	20 %	20 %	20 %	40 %	428205231
104	NC_019695	GTACC	2	10	200525	200534	20 %	20 %	20 %	40 %	428205234
105	NC_019695	ACTTT	2	10	203127	203136	20 %	60 %	0 %	20 %	428205236
106	NC_019695	TTTGT	2	10	204668	204677	0 %	80 %	20 %	0 %	428205237
107	NC_019695	TTTCA	2	10	204794	204803	20 %	60 %	0 %	20 %	428205237
108	NC_019695	CCAGA	2	10	205723	205732	40 %	0 %	20 %	40 %	428205238
109	NC_019695	ATTGA	2	10	206215	206224	40 %	40 %	20 %	0 %	428205239
110	NC_019695	CGGCG	2	10	207101	207110	0 %	0 %	60 %	40 %	428205241
111	NC_019695	CAATT	2	10	207222	207231	40 %	40 %	0 %	20 %	428205241
112	NC_019695	ATCGC	2	10	209672	209681	20 %	20 %	20 %	40 %	428205244
113	NC_019695	TGGAT	2	10	209721	209730	20 %	40 %	40 %	0 %	428205244
114	NC_019695	ATGCC	2	10	209733	209742	20 %	20 %	20 %	40 %	428205244
115	NC_019695	GACGC	2	10	218245	218254	20 %	0 %	40 %	40 %	428205261
116	NC_019695	GATCG	2	10	221236	221245	20 %	20 %	40 %	20 %	428205266
117	NC_019695	GCCTA	2	10	223281	223290	20 %	20 %	20 %	40 %	428205268
118	NC_019695	CTTAG	2	10	223590	223599	20 %	40 %	20 %	20 %	428205269
119	NC_019695	TGTCG	2	10	225004	225013	0 %	40 %	40 %	20 %	428205270
120	NC_019695	TAACT	2	10	227908	227917	40 %	40 %	0 %	20 %	428205272
121	NC_019695	ACGTA	2	10	230091	230100	40 %	20 %	20 %	20 %	428205274
122	NC_019695	CAAGA	2	10	232711	232720	60 %	0 %	20 %	20 %	428205277
123	NC_019695	GAATG	2	10	233910	233919	40 %	20 %	40 %	0 %	428205278
124	NC_019695	ACTTG	2	10	242100	242109	20 %	40 %	20 %	20 %	428205285
125	NC_019695	CCGTT	2	10	242428	242437	0 %	40 %	20 %	40 %	428205285
126	NC_019695	GGCTT	2	10	246934	246943	0 %	40 %	40 %	20 %	428205286
127	NC_019695	TAGCA	2	10	248091	248100	40 %	20 %	20 %	20 %	428205286
128	NC_019695	AGTAC	2	10	248494	248503	40 %	20 %	20 %	20 %	428205287
129	NC_019695	TCGCC	2	10	252000	252009	0 %	20 %	20 %	60 %	428205288
130	NC_019695	ATTGT	2	10	259601	259610	20 %	60 %	20 %	0 %	428205295
131	NC_019695	CCTTG	2	10	260095	260104	0 %	40 %	20 %	40 %	428205296
132	NC_019695	CTCAA	2	10	261096	261105	40 %	20 %	0 %	40 %	428205297
133	NC_019695	TCGAG	2	10	261541	261550	20 %	20 %	40 %	20 %	428205297
134	NC_019695	CATAT	2	10	264941	264950	40 %	40 %	0 %	20 %	428205301
135	NC_019695	TCTTG	2	10	265418	265427	0 %	60 %	20 %	20 %	428205301
136	NC_019695	ATACA	2	10	269762	269771	60 %	20 %	0 %	20 %	428205304
137	NC_019695	ATTTT	2	10	271338	271347	20 %	80 %	0 %	0 %	428205305
138	NC_019695	AAATC	2	10	271790	271799	60 %	20 %	0 %	20 %	428205305
139	NC_019695	GCATT	2	10	272329	272338	20 %	40 %	20 %	20 %	428205306
140	NC_019695	ACGCT	2	10	274285	274294	20 %	20 %	20 %	40 %	428205308
141	NC_019695	TCTCG	2	10	274459	274468	0 %	40 %	20 %	40 %	428205308
142	NC_019695	CCTTT	2	10	274860	274869	0 %	60 %	0 %	40 %	428205308
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147	NC_019695	TTGGA	2	10	288543	288552	20 %	40 %	40 %	0 %	428205320
148	NC_019695	CAGAT	2	10	288814	288823	40 %	20 %	20 %	20 %	428205320
149	NC_019695	ACTCA	2	10	290761	290770	40 %	20 %	0 %	40 %	428205322
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151	NC_019695	GCTAA	2	10	294574	294583	40 %	20 %	20 %	20 %	428205325
152	NC_019695	GAACC	2	10	297208	297217	40 %	0 %	20 %	40 %	428205328
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167	NC_019695	CCGAT	2	10	316672	316681	20 %	20 %	20 %	40 %	428205348
168	NC_019695	TTCGC	2	10	316752	316761	0 %	40 %	20 %	40 %	428205348
169	NC_019695	GCGAG	2	10	318593	318602	20 %	0 %	60 %	20 %	428205348
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172	NC_019695	AGGTT	2	10	323049	323058	20 %	40 %	40 %	0 %	428205353
173	NC_019695	GGGAA	2	10	323907	323916	40 %	0 %	60 %	0 %	428205356
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177	NC_019695	CCCCA	2	10	328676	328685	20 %	0 %	0 %	80 %	428205360
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387	NC_019695	CGATC	2	10	688299	688308	20 %	20 %	20 %	40 %	428205676
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389	NC_019695	CGCTA	2	10	689161	689170	20 %	20 %	20 %	40 %	428205677
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