MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 18606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019695	GCTC	2	8	378	385	0 %	25 %	25 %	50 %	428205074
2	NC_019695	GTAT	2	8	458	465	25 %	50 %	25 %	0 %	428205074
3	NC_019695	ACGA	2	8	672	679	50 %	0 %	25 %	25 %	428205074
4	NC_019695	GATT	2	8	919	926	25 %	50 %	25 %	0 %	428205074
5	NC_019695	GAGC	2	8	1827	1834	25 %	0 %	50 %	25 %	428205075
6	NC_019695	GTAG	2	8	1860	1867	25 %	25 %	50 %	0 %	428205075
7	NC_019695	GCTC	2	8	2023	2030	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019695	AATC	2	8	3220	3227	50 %	25 %	0 %	25 %	428205076
9	NC_019695	TTAC	2	8	3608	3615	25 %	50 %	0 %	25 %	428205076
10	NC_019695	TTCG	2	8	3843	3850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019695	ATCG	2	8	4003	4010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019695	TCTA	2	8	4086	4093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019695	GTTT	2	8	4341	4348	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019695	GAAA	2	8	4719	4726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019695	ACAA	2	8	4731	4738	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019695	CTGG	2	8	5051	5058	0 %	25 %	50 %	25 %	428205078
17	NC_019695	ACCT	2	8	5425	5432	25 %	25 %	0 %	50 %	428205078
18	NC_019695	TAGT	2	8	5810	5817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019695	CGGG	2	8	5858	5865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019695	ATCG	2	8	6586	6593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019695	TTCT	2	8	7126	7133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019695	GATT	2	8	7911	7918	25 %	50 %	25 %	0 %	428205080
23	NC_019695	CGTG	2	8	8146	8153	0 %	25 %	50 %	25 %	428205080
24	NC_019695	AGTA	2	8	8313	8320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019695	CAGA	2	8	8321	8328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_019695	CTGT	2	8	8343	8350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019695	AGAA	2	8	8582	8589	75 %	0 %	25 %	0 %	428205081
28	NC_019695	CCGA	2	8	8823	8830	25 %	0 %	25 %	50 %	428205081
29	NC_019695	AATT	2	8	9181	9188	50 %	50 %	0 %	0 %	428205081
30	NC_019695	AGAA	2	8	9489	9496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019695	AATT	2	8	9651	9658	50 %	50 %	0 %	0 %	428205082
32	NC_019695	TCAG	2	8	9814	9821	25 %	25 %	25 %	25 %	428205082
33	NC_019695	CAAT	2	8	10389	10396	50 %	25 %	0 %	25 %	428205082
34	NC_019695	TGGT	2	8	10808	10815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019695	CAAC	2	8	11475	11482	50 %	0 %	0 %	50 %	428205083
36	NC_019695	AGTC	2	8	11935	11942	25 %	25 %	25 %	25 %	428205083
37	NC_019695	TCAG	2	8	12042	12049	25 %	25 %	25 %	25 %	428205083
38	NC_019695	TGGC	2	8	12116	12123	0 %	25 %	50 %	25 %	428205083
39	NC_019695	GGCT	2	8	12157	12164	0 %	25 %	50 %	25 %	428205083
40	NC_019695	CGTG	2	8	12307	12314	0 %	25 %	50 %	25 %	428205083
41	NC_019695	TTTA	2	8	12586	12593	25 %	75 %	0 %	0 %	428205083
42	NC_019695	CAAC	2	8	12714	12721	50 %	0 %	0 %	50 %	428205083
43	NC_019695	TACC	2	8	13005	13012	25 %	25 %	0 %	50 %	428205083
44	NC_019695	TAAC	2	8	13683	13690	50 %	25 %	0 %	25 %	428205084
45	NC_019695	AGAA	2	8	13715	13722	75 %	0 %	25 %	0 %	428205084
46	NC_019695	ATGA	2	8	14094	14101	50 %	25 %	25 %	0 %	428205085
47	NC_019695	AAAG	2	8	14416	14423	75 %	0 %	25 %	0 %	428205085
48	NC_019695	TTGG	2	8	14680	14687	0 %	50 %	50 %	0 %	428205085
49	NC_019695	TTTA	2	8	14808	14815	25 %	75 %	0 %	0 %	428205085
50	NC_019695	TAAA	2	8	15025	15032	75 %	25 %	0 %	0 %	428205085
51	NC_019695	GCTA	2	8	15551	15558	25 %	25 %	25 %	25 %	428205085
52	NC_019695	CGAG	2	8	15611	15618	25 %	0 %	50 %	25 %	428205085
53	NC_019695	ATTT	2	8	16066	16073	25 %	75 %	0 %	0 %	428205086
54	NC_019695	CTCG	2	8	16138	16145	0 %	25 %	25 %	50 %	428205086
55	NC_019695	AGTT	2	8	16422	16429	25 %	50 %	25 %	0 %	428205086
56	NC_019695	CAAT	2	8	16599	16606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019695	CGAG	2	8	17039	17046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019695	CAAG	2	8	17155	17162	50 %	0 %	25 %	25 %	428205087
59	NC_019695	AGCA	2	8	17360	17367	50 %	0 %	25 %	25 %	428205087
60	NC_019695	AGAT	2	8	17999	18006	50 %	25 %	25 %	0 %	428205087
61	NC_019695	ATAA	2	8	18331	18338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019695	AGAA	2	8	18873	18880	75 %	0 %	25 %	0 %	428205088
63	NC_019695	CGTC	2	8	19313	19320	0 %	25 %	25 %	50 %	428205088
64	NC_019695	CAGC	2	8	20169	20176	25 %	0 %	25 %	50 %	428205089
65	NC_019695	AAGC	2	8	20188	20195	50 %	0 %	25 %	25 %	428205089
66	NC_019695	TCGG	2	8	20450	20457	0 %	25 %	50 %	25 %	428205089
67	NC_019695	CACG	2	8	20794	20801	25 %	0 %	25 %	50 %	428205089
68	NC_019695	GGTT	2	8	21026	21033	0 %	50 %	50 %	0 %	428205089
69	NC_019695	AAGT	2	8	21449	21456	50 %	25 %	25 %	0 %	428205089
70	NC_019695	CATA	2	8	21569	21576	50 %	25 %	0 %	25 %	428205089
71	NC_019695	GGAT	2	8	21707	21714	25 %	25 %	50 %	0 %	428205089
72	NC_019695	GATT	2	8	21955	21962	25 %	50 %	25 %	0 %	428205089
73	NC_019695	ATCT	2	8	22411	22418	25 %	50 %	0 %	25 %	428205090
74	NC_019695	CAGC	2	8	22503	22510	25 %	0 %	25 %	50 %	428205090
75	NC_019695	TGAA	2	8	22645	22652	50 %	25 %	25 %	0 %	428205090
76	NC_019695	CGAT	2	8	22831	22838	25 %	25 %	25 %	25 %	428205090
77	NC_019695	ATCG	2	8	22839	22846	25 %	25 %	25 %	25 %	428205090
78	NC_019695	GGAA	2	8	22895	22902	50 %	0 %	50 %	0 %	428205090
79	NC_019695	CAAG	2	8	23145	23152	50 %	0 %	25 %	25 %	428205090
80	NC_019695	TCAA	2	8	23158	23165	50 %	25 %	0 %	25 %	428205090
81	NC_019695	CCAA	2	8	23410	23417	50 %	0 %	0 %	50 %	428205090
82	NC_019695	GACG	2	8	23597	23604	25 %	0 %	50 %	25 %	428205090
83	NC_019695	TCAA	2	8	23839	23846	50 %	25 %	0 %	25 %	428205090
84	NC_019695	AGAA	2	8	23875	23882	75 %	0 %	25 %	0 %	428205090
85	NC_019695	AATT	2	8	24382	24389	50 %	50 %	0 %	0 %	428205091
86	NC_019695	GCAA	2	8	24408	24415	50 %	0 %	25 %	25 %	428205091
87	NC_019695	GATG	2	8	24741	24748	25 %	25 %	50 %	0 %	428205092
88	NC_019695	CGAT	2	8	24863	24870	25 %	25 %	25 %	25 %	428205092
89	NC_019695	CAAG	2	8	24918	24925	50 %	0 %	25 %	25 %	428205092
90	NC_019695	ATTT	2	8	25270	25277	25 %	75 %	0 %	0 %	428205092
91	NC_019695	TCAT	2	8	25729	25736	25 %	50 %	0 %	25 %	428205093
92	NC_019695	GTCA	2	8	26153	26160	25 %	25 %	25 %	25 %	428205093
93	NC_019695	TAAG	2	8	26845	26852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019695	TTGG	2	8	26884	26891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019695	CGAT	2	8	27238	27245	25 %	25 %	25 %	25 %	428205095
96	NC_019695	AAAG	2	8	27350	27357	75 %	0 %	25 %	0 %	428205095
97	NC_019695	GATG	2	8	27626	27633	25 %	25 %	50 %	0 %	428205095
98	NC_019695	ATCC	2	8	27699	27706	25 %	25 %	0 %	50 %	428205095
99	NC_019695	AGAA	2	8	28353	28360	75 %	0 %	25 %	0 %	428205095
100	NC_019695	TGTT	2	8	28767	28774	0 %	75 %	25 %	0 %	428205096
101	NC_019695	TCTA	2	8	30189	30196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019695	TCAT	2	8	30562	30569	25 %	50 %	0 %	25 %	428205097
103	NC_019695	CGAC	2	8	30602	30609	25 %	0 %	25 %	50 %	428205097
104	NC_019695	GTTT	2	8	30783	30790	0 %	75 %	25 %	0 %	428205097
105	NC_019695	CACG	2	8	31533	31540	25 %	0 %	25 %	50 %	428205097
106	NC_019695	CCTG	2	8	31785	31792	0 %	25 %	25 %	50 %	428205097
107	NC_019695	CTTT	2	8	31909	31916	0 %	75 %	0 %	25 %	428205097
108	NC_019695	CTCG	2	8	32384	32391	0 %	25 %	25 %	50 %	428205097
109	NC_019695	GTGC	2	8	32469	32476	0 %	25 %	50 %	25 %	428205097
110	NC_019695	TTGC	2	8	33909	33916	0 %	50 %	25 %	25 %	428205097
111	NC_019695	ACCA	2	8	34066	34073	50 %	0 %	0 %	50 %	428205097
112	NC_019695	GTTG	2	8	34445	34452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019695	GTTA	2	8	34703	34710	25 %	50 %	25 %	0 %	428205099
114	NC_019695	CAGA	2	8	34736	34743	50 %	0 %	25 %	25 %	428205099
115	NC_019695	AACC	2	8	35040	35047	50 %	0 %	0 %	50 %	428205099
116	NC_019695	GCAA	2	8	35250	35257	50 %	0 %	25 %	25 %	428205099
117	NC_019695	TCAA	2	8	35511	35518	50 %	25 %	0 %	25 %	428205099
118	NC_019695	GATC	2	8	35761	35768	25 %	25 %	25 %	25 %	428205099
119	NC_019695	AACC	2	8	35782	35789	50 %	0 %	0 %	50 %	428205099
120	NC_019695	AGTT	2	8	36084	36091	25 %	50 %	25 %	0 %	428205099
121	NC_019695	AGCT	2	8	36124	36131	25 %	25 %	25 %	25 %	428205099
122	NC_019695	GGGA	2	8	36378	36385	25 %	0 %	75 %	0 %	428205099
123	NC_019695	TGGT	2	8	36903	36910	0 %	50 %	50 %	0 %	428205099
124	NC_019695	GGAT	2	8	37688	37695	25 %	25 %	50 %	0 %	428205100
125	NC_019695	GTAC	2	8	37813	37820	25 %	25 %	25 %	25 %	428205100
126	NC_019695	TGAC	2	8	37832	37839	25 %	25 %	25 %	25 %	428205100
127	NC_019695	ACCA	2	8	38020	38027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019695	TTGG	2	8	38133	38140	0 %	50 %	50 %	0 %	428205101
129	NC_019695	CGGG	2	8	38871	38878	0 %	0 %	75 %	25 %	428205101
130	NC_019695	ATCA	2	8	39291	39298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_019695	AGTC	2	8	39681	39688	25 %	25 %	25 %	25 %	428205102
132	NC_019695	AAAT	2	8	39854	39861	75 %	25 %	0 %	0 %	428205102
133	NC_019695	TATT	2	8	40078	40085	25 %	75 %	0 %	0 %	428205103
134	NC_019695	TCCT	2	8	41018	41025	0 %	50 %	0 %	50 %	428205105
135	NC_019695	TTGT	2	8	41427	41434	0 %	75 %	25 %	0 %	428205106
136	NC_019695	CGGG	2	8	43317	43324	0 %	0 %	75 %	25 %	428205107
137	NC_019695	ATCG	2	8	43466	43473	25 %	25 %	25 %	25 %	428205107
138	NC_019695	AGGA	2	8	44238	44245	50 %	0 %	50 %	0 %	428205107
139	NC_019695	AGTT	2	8	44996	45003	25 %	50 %	25 %	0 %	428205109
140	NC_019695	GAAC	2	8	45050	45057	50 %	0 %	25 %	25 %	428205109
141	NC_019695	CTTG	2	8	45476	45483	0 %	50 %	25 %	25 %	428205109
142	NC_019695	CCAG	2	8	46098	46105	25 %	0 %	25 %	50 %	428205109
143	NC_019695	AACG	2	8	46179	46186	50 %	0 %	25 %	25 %	428205109
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