MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 79057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019695	CAG	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019695	GGT	2	6	82	87	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019695	CTT	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205074
4	NC_019695	TAC	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205074
5	NC_019695	CAA	2	6	425	430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205074
6	NC_019695	GCC	2	6	437	442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205074
7	NC_019695	GTC	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
8	NC_019695	TGC	2	6	506	511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
9	NC_019695	GGC	2	6	567	572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205074
10	NC_019695	TGC	2	6	734	739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
11	NC_019695	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205074
12	NC_019695	GAT	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
13	NC_019695	AAG	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205074
14	NC_019695	GCC	2	6	938	943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205074
15	NC_019695	GCT	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
16	NC_019695	TGA	2	6	1183	1188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
17	NC_019695	GTC	2	6	1191	1196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205074
18	NC_019695	ATG	2	6	1207	1212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205074
19	NC_019695	GAA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205074
20	NC_019695	ACC	2	6	1350	1355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205074
21	NC_019695	GTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019695	CTT	2	6	1691	1696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205075
23	NC_019695	GCA	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205075
24	NC_019695	TAC	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205075
25	NC_019695	CCG	2	6	1903	1908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205075
26	NC_019695	CAA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205075
27	NC_019695	CGA	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205075
28	NC_019695	ACG	2	6	2142	2147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
29	NC_019695	GGC	2	6	2224	2229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205076
30	NC_019695	AAC	2	6	2427	2432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205076
31	NC_019695	AGC	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
32	NC_019695	GAG	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205076
33	NC_019695	GTT	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
34	NC_019695	ATC	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205076
35	NC_019695	TGT	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
36	NC_019695	GAA	2	6	2707	2712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205076
37	NC_019695	ATT	2	6	2717	2722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205076
38	NC_019695	CGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205076
39	NC_019695	TAC	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205076
40	NC_019695	CTT	2	6	2952	2957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205076
41	NC_019695	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
42	NC_019695	TAG	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
43	NC_019695	GAT	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
44	NC_019695	CGA	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205076
45	NC_019695	CTT	2	6	3435	3440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205076
46	NC_019695	GTC	2	6	3452	3457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205076
47	NC_019695	GTA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205076
48	NC_019695	AGA	2	6	3504	3509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205076
49	NC_019695	GAG	2	6	3530	3535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205076
50	NC_019695	TTG	2	6	3574	3579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205076
51	NC_019695	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205076
52	NC_019695	CTG	2	6	3733	3738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205076
53	NC_019695	AGT	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019695	CGC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019695	TGT	2	6	3980	3985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019695	ACT	2	6	4102	4107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019695	AAG	2	6	4224	4229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019695	GTT	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019695	CTG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019695	CAG	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019695	ACT	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019695	GAT	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019695	AGA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019695	CAC	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205078
65	NC_019695	GAT	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205078
66	NC_019695	GGT	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205078
67	NC_019695	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205078
68	NC_019695	GGT	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205078
69	NC_019695	AGC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205078
70	NC_019695	AAG	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205078
71	NC_019695	AGA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205078
72	NC_019695	CCG	2	6	5645	5650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205078
73	NC_019695	TCT	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019695	GTT	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019695	CCT	2	6	6144	6149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205079
76	NC_019695	CCA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205079
77	NC_019695	CAG	2	6	6256	6261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205079
78	NC_019695	TGT	2	6	6324	6329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205079
79	NC_019695	GTT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205079
80	NC_019695	CGG	2	6	6406	6411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205079
81	NC_019695	TCC	2	6	6449	6454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205079
82	NC_019695	TGC	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205079
83	NC_019695	TGC	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205079
84	NC_019695	AGC	2	6	6573	6578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019695	ATC	2	6	6679	6684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019695	AAG	2	6	6749	6754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019695	AGA	2	6	6765	6770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019695	TTA	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019695	TAT	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019695	TCC	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019695	GAT	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019695	GCA	2	6	7338	7343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205080
93	NC_019695	ATG	2	6	7389	7394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
94	NC_019695	TAG	2	6	7422	7427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
95	NC_019695	GAA	2	6	7430	7435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
96	NC_019695	TAG	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
97	NC_019695	TTG	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205080
98	NC_019695	GCT	2	6	7706	7711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205080
99	NC_019695	CAC	2	6	7746	7751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205080
100	NC_019695	CAG	4	12	7800	7811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205080
101	NC_019695	GAC	2	6	7841	7846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205080
102	NC_019695	ACC	2	6	7881	7886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205080
103	NC_019695	GAA	2	6	7904	7909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
104	NC_019695	CAA	2	6	7921	7926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205080
105	NC_019695	GAA	2	6	8114	8119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
106	NC_019695	AAG	2	6	8136	8141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
107	NC_019695	AAG	2	6	8154	8159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
108	NC_019695	ATC	2	6	8181	8186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205080
109	NC_019695	GAA	2	6	8201	8206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205080
110	NC_019695	CCG	2	6	8212	8217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205080
111	NC_019695	TGA	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205080
112	NC_019695	CTT	2	6	8304	8309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019695	AAT	2	6	8470	8475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019695	TGG	2	6	8568	8573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205081
115	NC_019695	TCG	2	6	8604	8609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205081
116	NC_019695	CAG	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205081
117	NC_019695	TCT	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205081
118	NC_019695	GAA	2	6	8795	8800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205081
119	NC_019695	ATG	2	6	8861	8866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205081
120	NC_019695	CTA	2	6	8889	8894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205081
121	NC_019695	ACC	2	6	8926	8931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428205081
122	NC_019695	AGA	2	6	9010	9015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205081
123	NC_019695	ATT	2	6	9017	9022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205081
124	NC_019695	AGT	3	9	9040	9048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205081
125	NC_019695	TAT	2	6	9306	9311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205081
126	NC_019695	AAG	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205081
127	NC_019695	CGG	2	6	9643	9648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205082
128	NC_019695	GAA	2	6	9887	9892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205082
129	NC_019695	GCA	2	6	9896	9901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205082
130	NC_019695	AAG	2	6	9909	9914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205082
131	NC_019695	GTT	2	6	10052	10057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205082
132	NC_019695	GTT	2	6	10096	10101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205082
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259	NC_019695	CTG	2	6	19885	19890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205089
260	NC_019695	AGA	2	6	19979	19984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205089
261	NC_019695	ACT	2	6	20010	20015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205089
262	NC_019695	CAT	2	6	20035	20040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205089
263	NC_019695	CGA	3	9	20051	20059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205089
264	NC_019695	TCT	2	6	20062	20067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205089
265	NC_019695	CCT	2	6	20076	20081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428205089
266	NC_019695	TTC	2	6	20095	20100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428205089
267	NC_019695	ATC	2	6	20215	20220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205089
268	NC_019695	TGA	2	6	20263	20268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205089
269	NC_019695	GAA	2	6	20328	20333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205089
270	NC_019695	CAA	2	6	20417	20422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205089
271	NC_019695	AGC	2	6	20635	20640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205089
272	NC_019695	TGC	2	6	20722	20727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205089
273	NC_019695	CTG	2	6	20899	20904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205089
274	NC_019695	GAA	3	9	20925	20933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205089
275	NC_019695	GAC	2	6	20945	20950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205089
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279	NC_019695	TGC	2	6	21370	21375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205089
280	NC_019695	CGG	2	6	21380	21385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205089
281	NC_019695	GTT	2	6	21398	21403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205089
282	NC_019695	CTA	2	6	21487	21492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205089
283	NC_019695	AGA	2	6	21553	21558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205089
284	NC_019695	CAG	2	6	21588	21593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205089
285	NC_019695	GCT	2	6	21611	21616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205089
286	NC_019695	TAG	2	6	21619	21624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205089
287	NC_019695	ATT	2	6	21633	21638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205089
288	NC_019695	CTG	3	9	21688	21696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205089
289	NC_019695	CAA	2	6	21716	21721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205089
290	NC_019695	ATT	2	6	21834	21839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205089
291	NC_019695	TGA	2	6	21860	21865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205089
292	NC_019695	CAA	2	6	21988	21993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_019695	CAA	2	6	22004	22009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_019695	AAC	2	6	22097	22102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205090
295	NC_019695	AAC	2	6	22182	22187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205090
296	NC_019695	AAT	2	6	22308	22313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205090
297	NC_019695	CAG	2	6	22338	22343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205090
298	NC_019695	CAA	2	6	22453	22458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205090
299	NC_019695	AGG	2	6	22483	22488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205090
300	NC_019695	TGA	2	6	22489	22494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205090
301	NC_019695	AAT	2	6	22568	22573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428205090
302	NC_019695	CAG	2	6	22671	22676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205090
303	NC_019695	CAA	2	6	22680	22685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205090
304	NC_019695	ATC	2	6	22708	22713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205090
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320	NC_019695	GCA	2	6	23747	23752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205090
321	NC_019695	GTC	2	6	23754	23759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205090
322	NC_019695	CAA	2	6	23853	23858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205090
323	NC_019695	CTG	2	6	23965	23970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_019695	TTA	2	6	24033	24038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428205091
325	NC_019695	TCA	2	6	24214	24219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205091
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328	NC_019695	TGT	2	6	24597	24602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205092
329	NC_019695	GCT	2	6	24628	24633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205092
330	NC_019695	GTT	2	6	24649	24654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205092
331	NC_019695	CAG	2	6	24804	24809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205092
332	NC_019695	GTT	2	6	24846	24851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428205092
333	NC_019695	AGC	2	6	24983	24988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205092
334	NC_019695	GGT	2	6	25090	25095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205092
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340	NC_019695	AAC	2	6	25749	25754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428205093
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346	NC_019695	GCC	2	6	26321	26326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205094
347	NC_019695	TCA	2	6	26424	26429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205094
348	NC_019695	CAT	2	6	26462	26467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428205094
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350	NC_019695	GCT	2	6	26562	26567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205094
351	NC_019695	CAC	2	6	26725	26730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
352	NC_019695	CGC	2	6	26973	26978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428205095
353	NC_019695	GCG	2	6	27211	27216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428205095
354	NC_019695	TGA	2	6	27269	27274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205095
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361	NC_019695	CTG	2	6	27505	27510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205095
362	NC_019695	GAA	2	6	27546	27551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205095
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365	NC_019695	GAG	3	9	27735	27743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205095
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370	NC_019695	GCA	2	6	28076	28081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428205095
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372	NC_019695	GGA	2	6	28209	28214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428205095
373	NC_019695	TGG	2	6	28253	28258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428205095
374	NC_019695	TGC	2	6	28279	28284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205095
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376	NC_019695	AGA	2	6	28325	28330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428205095
377	NC_019695	CGT	2	6	28343	28348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205095
378	NC_019695	TCG	2	6	28405	28410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428205095
379	NC_019695	ATG	2	6	28458	28463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428205095
380	NC_019695	TGG	2	6	28561	28566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_019695	TTC	2	6	28636	28641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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