MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chroococcidiopsis thermalis PCC 7203 chromosome

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019695	CAG	2	6	75	80	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019695	GGT	2	6	82	87	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019695	GTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019695	AGT	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019695	CGC	2	6	3922	3927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019695	TGT	2	6	3980	3985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019695	ACT	2	6	4102	4107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019695	AAG	2	6	4224	4229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019695	GTT	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019695	CTG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019695	CAG	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019695	ACT	2	6	4710	4715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019695	GAT	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019695	AGA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019695	TCT	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019695	GTT	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019695	AGC	2	6	6573	6578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019695	ATC	2	6	6679	6684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019695	AAG	2	6	6749	6754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019695	AGA	2	6	6765	6770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019695	TTA	2	6	6925	6930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019695	TAT	2	6	6941	6946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019695	TCC	2	6	7035	7040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019695	GAT	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019695	CTT	2	6	8304	8309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019695	AAT	2	6	8470	8475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019695	CTC	2	6	10867	10872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019695	TAG	2	6	10929	10934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019695	TAG	3	9	10936	10944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019695	TTC	2	6	10947	10952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019695	AGT	2	6	11040	11045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019695	AGC	2	6	14049	14054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019695	GAT	2	6	16633	16638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019695	CCA	2	6	16658	16663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019695	ACT	2	6	16686	16691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019695	GTT	2	6	16770	16775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019695	TAG	2	6	16784	16789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019695	AAG	2	6	16804	16809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019695	TGA	2	6	16881	16886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019695	TTA	2	6	16896	16901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019695	TAA	2	6	16910	16915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019695	GCA	2	6	16997	17002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019695	TAC	2	6	17062	17067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019695	TTA	2	6	18309	18314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019695	TCA	2	6	18325	18330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019695	ATT	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019695	ACA	2	6	18355	18360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019695	CAA	2	6	21988	21993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019695	CAA	2	6	22004	22009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019695	CTG	2	6	23965	23970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019695	CAC	2	6	26725	26730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019695	TGG	2	6	28561	28566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019695	TTC	2	6	28586	28591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019695	TTC	2	6	28636	28641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019695	CAG	2	6	28648	28653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019695	TAA	2	6	29940	29945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019695	TAG	2	6	30264	30269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019695	TCA	2	6	30319	30324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019695	TTA	2	6	34136	34141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019695	TAT	2	6	34145	34150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019695	TAG	2	6	34151	34156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019695	CAA	2	6	34424	34429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019695	GTT	2	6	34469	34474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019695	CAA	2	6	38036	38041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019695	AAC	2	6	38044	38049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019695	CAG	2	6	39244	39249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019695	CAA	3	9	39280	39288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019695	TTC	2	6	39868	39873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019695	CAC	2	6	39877	39882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019695	CAC	2	6	39884	39889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019695	TGC	2	6	39983	39988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019695	TGA	2	6	40017	40022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019695	CTG	2	6	41163	41168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019695	GGT	2	6	41170	41175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019695	TGA	2	6	41648	41653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019695	CAA	2	6	47836	47841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019695	GAA	2	6	47953	47958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019695	TTC	3	9	50830	50838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019695	TCT	2	6	50893	50898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019695	TCA	2	6	50938	50943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019695	GTT	2	6	58391	58396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019695	AGA	2	6	58570	58575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019695	ATA	2	6	58711	58716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019695	CAA	2	6	58754	58759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019695	AGA	2	6	59040	59045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019695	AGT	2	6	59062	59067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019695	TAG	2	6	59080	59085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019695	CTC	2	6	59134	59139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_019695	TTC	2	6	60067	60072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019695	AGG	2	6	60145	60150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019695	CAT	2	6	63860	63865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019695	GAA	2	6	63952	63957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019695	TGC	2	6	64144	64149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019695	CAA	2	6	64246	64251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019695	CAA	2	6	64514	64519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019695	GCT	2	6	64545	64550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019695	CGA	2	6	65253	65258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019695	CAA	2	6	65260	65265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019695	AAC	2	6	65268	65273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019695	TCA	2	6	65284	65289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019695	AAT	2	6	65296	65301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019695	TGG	2	6	66029	66034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019695	CTA	2	6	66101	66106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019695	CCT	2	6	66142	66147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_019695	GTG	2	6	66648	66653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019695	TTC	2	6	66675	66680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019695	TCG	2	6	66714	66719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019695	CTT	2	6	67445	67450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019695	AAT	2	6	67481	67486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019695	AGC	2	6	67524	67529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019695	TGT	2	6	68358	68363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019695	TTG	2	6	68482	68487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019695	CAA	2	6	68603	68608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019695	ATA	2	6	68687	68692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019695	TCT	2	6	68928	68933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019695	CAT	2	6	69171	69176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019695	CTA	2	6	71195	71200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019695	ACT	2	6	72852	72857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019695	ACT	2	6	72859	72864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019695	ATT	2	6	74241	74246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019695	ATT	2	6	75299	75304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019695	TAA	2	6	75339	75344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019695	CAC	2	6	75886	75891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019695	CAG	2	6	75898	75903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019695	GGT	2	6	78424	78429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019695	AGA	2	6	78827	78832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019695	TTG	2	6	79540	79545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019695	GAG	2	6	79576	79581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019695	GAG	2	6	79583	79588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019695	GTG	2	6	79609	79614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019695	GTG	2	6	79631	79636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019695	CTC	2	6	79687	79692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_019695	CTC	2	6	79694	79699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019695	CTC	2	6	79701	79706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019695	GCG	2	6	81979	81984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019695	GAA	2	6	82078	82083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019695	CTA	3	9	82086	82094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019695	GAT	2	6	82123	82128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019695	GCC	2	6	82191	82196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_019695	TGG	2	6	84108	84113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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