MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.02

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019692	TCA	2	6	177	182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019692	CTT	2	6	258	263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019692	TTG	2	6	441	446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019692	AGT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019692	CTA	2	6	588	593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019692	ACT	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019692	GTC	2	6	641	646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019692	AAG	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019692	CTA	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223449
10	NC_019692	TAT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019692	CGC	2	6	1069	1074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019692	ATT	2	6	1098	1103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019692	AGA	2	6	1141	1146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019692	TCT	2	6	1302	1307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223450
15	NC_019692	TAA	2	6	1359	1364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223450
16	NC_019692	AGT	2	6	1395	1400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223450
17	NC_019692	ATT	2	6	1409	1414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223450
18	NC_019692	GTA	2	6	1677	1682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223450
19	NC_019692	CTT	2	6	1693	1698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223450
20	NC_019692	CTA	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223450
21	NC_019692	ACC	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223451
22	NC_019692	ATT	3	9	2468	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223451
23	NC_019692	ATC	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223451
24	NC_019692	CGT	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
25	NC_019692	CTT	2	6	3371	3376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223451
26	NC_019692	TTG	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223451
27	NC_019692	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223451
28	NC_019692	GCT	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
29	NC_019692	GCT	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
30	NC_019692	TGA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223451
31	NC_019692	TCG	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
32	NC_019692	CAT	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223451
33	NC_019692	ACA	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223451
34	NC_019692	ATT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223451
35	NC_019692	CCG	2	6	4036	4041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223451
36	NC_019692	ATT	2	6	4184	4189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223451
37	NC_019692	GTC	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223451
38	NC_019692	GAT	3	9	4376	4384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223451
39	NC_019692	CTA	2	6	4453	4458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223451
40	NC_019692	TTA	2	6	4504	4509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223451
41	NC_019692	GAT	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223451
42	NC_019692	ACT	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223451
43	NC_019692	TGA	2	6	4802	4807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223451
44	NC_019692	TGA	2	6	5170	5175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223452
45	NC_019692	AAT	2	6	5388	5393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019692	AAT	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223453
47	NC_019692	GAC	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223453
48	NC_019692	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223453
49	NC_019692	CAC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223453
50	NC_019692	ATT	2	6	6075	6080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223453
51	NC_019692	TTA	2	6	6091	6096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223453
52	NC_019692	ATT	2	6	6153	6158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223453
53	NC_019692	AAG	2	6	6428	6433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223454
54	NC_019692	AAT	2	6	6464	6469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223454
55	NC_019692	TCC	2	6	6631	6636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223454
56	NC_019692	TTA	2	6	6836	6841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019692	AGA	2	6	6899	6904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223455
58	NC_019692	ATT	2	6	6926	6931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223455
59	NC_019692	GAT	2	6	6949	6954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223455
60	NC_019692	ATG	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223455
61	NC_019692	TCA	2	6	7297	7302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223455
62	NC_019692	TCT	2	6	7357	7362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019692	ATC	2	6	7387	7392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019692	AAT	2	6	7416	7421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019692	CAA	2	6	7562	7567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019692	CGC	2	6	7727	7732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223456
67	NC_019692	CAA	2	6	7739	7744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223456
68	NC_019692	TAA	2	6	7897	7902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223456
69	NC_019692	ATG	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223456
70	NC_019692	GAA	2	6	7940	7945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223456
71	NC_019692	ATC	2	6	8702	8707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223458
72	NC_019692	ACT	2	6	9021	9026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019692	ATT	2	6	9179	9184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223459
74	NC_019692	GCG	2	6	9370	9375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223459
75	NC_019692	TGA	2	6	9447	9452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223459
76	NC_019692	ATG	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223459
77	NC_019692	ACT	2	6	9934	9939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223460
78	NC_019692	GTT	2	6	10188	10193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223460

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.