MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.01

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019691	ACCAG	2	10	1761	1770	40 %	0 %	20 %	40 %	428223391
2	NC_019691	AACTA	2	10	2111	2120	60 %	20 %	0 %	20 %	428223391
3	NC_019691	AACAG	2	10	5237	5246	60 %	0 %	20 %	20 %	428223393
4	NC_019691	GGGGT	2	10	6120	6129	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019691	GGGGT	2	10	6153	6162	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019691	GGGGT	2	10	6195	6204	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019691	GGGGT	2	10	6299	6308	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019691	GGGGT	2	10	6336	6345	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019691	GGGGT	2	10	6529	6538	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019691	TTTGC	2	10	10829	10838	0 %	60 %	20 %	20 %	428223396
11	NC_019691	GTTAG	2	10	11328	11337	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019691	TGCCC	2	10	11766	11775	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_019691	TGAGG	2	10	12681	12690	20 %	20 %	60 %	0 %	428223398
14	NC_019691	ATGCC	2	10	19654	19663	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_019691	AACTA	2	10	22113	22122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019691	GTTGT	2	10	23157	23166	0 %	60 %	40 %	0 %	428223405
17	NC_019691	ATAGA	2	10	23661	23670	60 %	20 %	20 %	0 %	428223406
18	NC_019691	ATTCC	2	10	24598	24607	20 %	40 %	0 %	40 %	428223407
19	NC_019691	GTTAT	2	10	26086	26095	20 %	60 %	20 %	0 %	428223409
20	NC_019691	TGAGG	2	10	29331	29340	20 %	20 %	60 %	0 %	428223410
21	NC_019691	TGAGT	2	10	29382	29391	20 %	40 %	40 %	0 %	428223410
22	NC_019691	GAATG	2	10	30341	30350	40 %	20 %	40 %	0 %	428223411
23	NC_019691	AACTA	2	10	32883	32892	60 %	20 %	0 %	20 %	428223414
24	NC_019691	TACCC	2	10	32990	32999	20 %	20 %	0 %	60 %	428223415
25	NC_019691	GCAAA	2	10	34177	34186	60 %	0 %	20 %	20 %	428223418
26	NC_019691	AACTA	3	15	34567	34581	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019691	TAATT	2	10	39132	39141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019691	TACTT	2	10	41240	41249	20 %	60 %	0 %	20 %	428223426
29	NC_019691	TTTGG	2	10	42588	42597	0 %	60 %	40 %	0 %	428223426
30	NC_019691	CATCG	2	10	42823	42832	20 %	20 %	20 %	40 %	428223426
31	NC_019691	GCAAT	2	10	44822	44831	40 %	20 %	20 %	20 %	428223428
32	NC_019691	AATTT	2	10	47706	47715	40 %	60 %	0 %	0 %	428223433
33	NC_019691	ATTAA	2	10	48200	48209	60 %	40 %	0 %	0 %	428223433
34	NC_019691	TCAGT	2	10	49464	49473	20 %	40 %	20 %	20 %	428223434
35	NC_019691	ATACC	2	10	52465	52474	40 %	20 %	0 %	40 %	428223438
36	NC_019691	CGAAT	2	10	53873	53882	40 %	20 %	20 %	20 %	428223440
37	NC_019691	GAATA	2	10	54807	54816	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019691	GGTAC	2	10	55013	55022	20 %	20 %	40 %	20 %	428223441

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.