MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.01

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019691	AACT	2	8	21	28	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019691	CGAT	2	8	38	45	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019691	ATCG	2	8	153	160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019691	AAGC	2	8	344	351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019691	TTTG	2	8	514	521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019691	GGAT	2	8	612	619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019691	ATTT	2	8	750	757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019691	TCAT	2	8	1634	1641	25 %	50 %	0 %	25 %	428223390
9	NC_019691	AGGT	2	8	1987	1994	25 %	25 %	50 %	0 %	428223391
10	NC_019691	TTAA	2	8	2022	2029	50 %	50 %	0 %	0 %	428223391
11	NC_019691	GCTA	2	8	2751	2758	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
12	NC_019691	GATC	2	8	2973	2980	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
13	NC_019691	AATC	2	8	3096	3103	50 %	25 %	0 %	25 %	428223393
14	NC_019691	TAGT	2	8	3110	3117	25 %	50 %	25 %	0 %	428223393
15	NC_019691	TAAA	2	8	3453	3460	75 %	25 %	0 %	0 %	428223393
16	NC_019691	GAAT	2	8	4197	4204	50 %	25 %	25 %	0 %	428223393
17	NC_019691	TTGG	2	8	4409	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	428223393
18	NC_019691	AAAT	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	428223393
19	NC_019691	ACTT	2	8	4750	4757	25 %	50 %	0 %	25 %	428223393
20	NC_019691	TAGC	2	8	5018	5025	25 %	25 %	25 %	25 %	428223393
21	NC_019691	CCAC	2	8	5510	5517	25 %	0 %	0 %	75 %	428223393
22	NC_019691	TAAC	2	8	5741	5748	50 %	25 %	0 %	25 %	428223393
23	NC_019691	TCAG	2	8	6445	6452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019691	CTGA	2	8	6733	6740	25 %	25 %	25 %	25 %	428223394
25	NC_019691	ATTT	2	8	6811	6818	25 %	75 %	0 %	0 %	428223394
26	NC_019691	AACT	2	8	7060	7067	50 %	25 %	0 %	25 %	428223394
27	NC_019691	TGAG	2	8	7838	7845	25 %	25 %	50 %	0 %	428223394
28	NC_019691	AGGT	2	8	8238	8245	25 %	25 %	50 %	0 %	428223395
29	NC_019691	CTAG	2	8	8442	8449	25 %	25 %	25 %	25 %	428223395
30	NC_019691	TTGA	2	8	8684	8691	25 %	50 %	25 %	0 %	428223395
31	NC_019691	CGAT	2	8	9441	9448	25 %	25 %	25 %	25 %	428223395
32	NC_019691	GGTA	2	8	9699	9706	25 %	25 %	50 %	0 %	428223395
33	NC_019691	GGCG	2	8	10321	10328	0 %	0 %	75 %	25 %	428223395
34	NC_019691	TAAA	2	8	11095	11102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019691	AATT	2	8	11357	11364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019691	CCTG	2	8	11394	11401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019691	TAGT	2	8	12308	12315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019691	GCTT	2	8	12694	12701	0 %	50 %	25 %	25 %	428223398
39	NC_019691	GTAA	2	8	12783	12790	50 %	25 %	25 %	0 %	428223398
40	NC_019691	CAGC	2	8	12916	12923	25 %	0 %	25 %	50 %	428223398
41	NC_019691	ATCG	2	8	13250	13257	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
42	NC_019691	CAAC	2	8	13277	13284	50 %	0 %	0 %	50 %	428223398
43	NC_019691	AATT	2	8	13327	13334	50 %	50 %	0 %	0 %	428223398
44	NC_019691	TCGA	2	8	13370	13377	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
45	NC_019691	ACGC	2	8	13408	13415	25 %	0 %	25 %	50 %	428223398
46	NC_019691	GATC	2	8	13456	13463	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
47	NC_019691	CTGA	2	8	13515	13522	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
48	NC_019691	CGAT	2	8	13608	13615	25 %	25 %	25 %	25 %	428223398
49	NC_019691	TCGC	2	8	14303	14310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019691	TCTT	2	8	14339	14346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019691	TATT	2	8	14385	14392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019691	TTTC	2	8	14749	14756	0 %	75 %	0 %	25 %	428223400
53	NC_019691	GGTG	2	8	14782	14789	0 %	25 %	75 %	0 %	428223400
54	NC_019691	ACTG	2	8	15136	15143	25 %	25 %	25 %	25 %	428223400
55	NC_019691	AATT	2	8	15213	15220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019691	CAAT	2	8	15403	15410	50 %	25 %	0 %	25 %	428223401
57	NC_019691	GACT	2	8	15598	15605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019691	CAGA	2	8	16659	16666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019691	CTGC	2	8	16674	16681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019691	AAAG	2	8	16906	16913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019691	TGCA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019691	TTAC	2	8	17467	17474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_019691	TATT	2	8	17553	17560	25 %	75 %	0 %	0 %	428223402
64	NC_019691	ACTA	2	8	17862	17869	50 %	25 %	0 %	25 %	428223402
65	NC_019691	GCAA	2	8	18357	18364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019691	CTAC	2	8	18842	18849	25 %	25 %	0 %	50 %	428223403
67	NC_019691	TAAT	2	8	20009	20016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019691	TGAT	2	8	20621	20628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019691	AGCA	2	8	21341	21348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019691	GTGG	2	8	21703	21710	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019691	TAAT	2	8	21995	22002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019691	GATA	2	8	22675	22682	50 %	25 %	25 %	0 %	428223405
73	NC_019691	AAAC	2	8	23101	23108	75 %	0 %	0 %	25 %	428223405
74	NC_019691	TCCC	2	8	23430	23437	0 %	25 %	0 %	75 %	428223406
75	NC_019691	TTCC	2	8	23539	23546	0 %	50 %	0 %	50 %	428223406
76	NC_019691	TTTC	2	8	23682	23689	0 %	75 %	0 %	25 %	428223406
77	NC_019691	CCAT	2	8	23831	23838	25 %	25 %	0 %	50 %	428223406
78	NC_019691	TCAA	2	8	23856	23863	50 %	25 %	0 %	25 %	428223406
79	NC_019691	ATTT	2	8	24052	24059	25 %	75 %	0 %	0 %	428223406
80	NC_019691	AGCT	2	8	25143	25150	25 %	25 %	25 %	25 %	428223409
81	NC_019691	TAGT	2	8	25608	25615	25 %	50 %	25 %	0 %	428223409
82	NC_019691	AGAA	2	8	26058	26065	75 %	0 %	25 %	0 %	428223409
83	NC_019691	CTTT	2	8	26679	26686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019691	GTCT	2	8	26925	26932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019691	CAAG	2	8	27678	27685	50 %	0 %	25 %	25 %	428223410
86	NC_019691	GGGT	2	8	28044	28051	0 %	25 %	75 %	0 %	428223410
87	NC_019691	TTAA	2	8	28477	28484	50 %	50 %	0 %	0 %	428223410
88	NC_019691	GTTT	2	8	28523	28530	0 %	75 %	25 %	0 %	428223410
89	NC_019691	CCTG	2	8	28546	28553	0 %	25 %	25 %	50 %	428223410
90	NC_019691	ATTA	2	8	30140	30147	50 %	50 %	0 %	0 %	428223411
91	NC_019691	AGCA	2	8	30252	30259	50 %	0 %	25 %	25 %	428223411
92	NC_019691	TTCA	2	8	30265	30272	25 %	50 %	0 %	25 %	428223411
93	NC_019691	ATTC	2	8	30300	30307	25 %	50 %	0 %	25 %	428223411
94	NC_019691	TAAA	2	8	30414	30421	75 %	25 %	0 %	0 %	428223412
95	NC_019691	TAAT	2	8	30767	30774	50 %	50 %	0 %	0 %	428223413
96	NC_019691	AAAT	2	8	30860	30867	75 %	25 %	0 %	0 %	428223413
97	NC_019691	ATGG	2	8	30925	30932	25 %	25 %	50 %	0 %	428223413
98	NC_019691	TCAA	2	8	31019	31026	50 %	25 %	0 %	25 %	428223413
99	NC_019691	CTTT	2	8	31029	31036	0 %	75 %	0 %	25 %	428223413
100	NC_019691	CAGA	2	8	31684	31691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019691	CTGC	2	8	31699	31706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019691	AAAG	2	8	31931	31938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019691	TGCA	2	8	32106	32113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_019691	TAAT	2	8	32926	32933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019691	ACAA	2	8	33170	33177	75 %	0 %	0 %	25 %	428223415
106	NC_019691	AAAC	2	8	33623	33630	75 %	0 %	0 %	25 %	428223416
107	NC_019691	TGAT	2	8	34069	34076	25 %	50 %	25 %	0 %	428223418
108	NC_019691	AACT	2	8	34287	34294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019691	TAAT	2	8	34936	34943	50 %	50 %	0 %	0 %	428223421
110	NC_019691	GTTG	2	8	35133	35140	0 %	50 %	50 %	0 %	428223421
111	NC_019691	ACTG	2	8	37250	37257	25 %	25 %	25 %	25 %	428223422
112	NC_019691	GAAG	2	8	37445	37452	50 %	0 %	50 %	0 %	428223422
113	NC_019691	GACT	2	8	37540	37547	25 %	25 %	25 %	25 %	428223422
114	NC_019691	ACCT	2	8	38078	38085	25 %	25 %	0 %	50 %	428223422
115	NC_019691	CCCG	2	8	38256	38263	0 %	0 %	25 %	75 %	428223422
116	NC_019691	CACC	2	8	38602	38609	25 %	0 %	0 %	75 %	428223423
117	NC_019691	AATT	2	8	38627	38634	50 %	50 %	0 %	0 %	428223423
118	NC_019691	ACAG	2	8	38863	38870	50 %	0 %	25 %	25 %	428223423
119	NC_019691	ATTG	2	8	39759	39766	25 %	50 %	25 %	0 %	428223424
120	NC_019691	CTGG	2	8	40059	40066	0 %	25 %	50 %	25 %	428223424
121	NC_019691	AGTT	2	8	40099	40106	25 %	50 %	25 %	0 %	428223424
122	NC_019691	AAAT	2	8	40149	40156	75 %	25 %	0 %	0 %	428223424
123	NC_019691	TAAA	2	8	40159	40166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019691	TAAT	2	8	40308	40315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019691	TTAA	2	8	41052	41059	50 %	50 %	0 %	0 %	428223426
126	NC_019691	ATCT	2	8	41263	41270	25 %	50 %	0 %	25 %	428223426
127	NC_019691	TCCT	2	8	41564	41571	0 %	50 %	0 %	50 %	428223426
128	NC_019691	AAGA	2	8	42839	42846	75 %	0 %	25 %	0 %	428223426
129	NC_019691	TTGC	2	8	42850	42857	0 %	50 %	25 %	25 %	428223426
130	NC_019691	TTTA	2	8	42954	42961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019691	TGGG	2	8	43245	43252	0 %	25 %	75 %	0 %	428223427
132	NC_019691	CTTG	2	8	43269	43276	0 %	50 %	25 %	25 %	428223427
133	NC_019691	TAAT	2	8	43620	43627	50 %	50 %	0 %	0 %	428223427
134	NC_019691	CCCA	2	8	44760	44767	25 %	0 %	0 %	75 %	428223428
135	NC_019691	CTAA	2	8	45754	45761	50 %	25 %	0 %	25 %	428223431
136	NC_019691	ATTA	2	8	46182	46189	50 %	50 %	0 %	0 %	428223431
137	NC_019691	TTAG	2	8	46415	46422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019691	TTAT	2	8	46435	46442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019691	CTAT	2	8	46682	46689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019691	ATTG	2	8	46877	46884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019691	CCCA	2	8	47124	47131	25 %	0 %	0 %	75 %	428223432
142	NC_019691	TCTT	2	8	47791	47798	0 %	75 %	0 %	25 %	428223433
143	NC_019691	AATT	2	8	48541	48548	50 %	50 %	0 %	0 %	428223433
144	NC_019691	ATTC	2	8	48706	48713	25 %	50 %	0 %	25 %	428223433
145	NC_019691	CCGA	2	8	48872	48879	25 %	0 %	25 %	50 %	428223433
146	NC_019691	CTGA	2	8	49524	49531	25 %	25 %	25 %	25 %	428223434
147	NC_019691	TGAT	2	8	49537	49544	25 %	50 %	25 %	0 %	428223434
148	NC_019691	TTTG	2	8	49704	49711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019691	AATT	2	8	50467	50474	50 %	50 %	0 %	0 %	428223436
150	NC_019691	TTTG	2	8	50859	50866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019691	ATTA	2	8	51311	51318	50 %	50 %	0 %	0 %	428223437
152	NC_019691	TAGC	2	8	51949	51956	25 %	25 %	25 %	25 %	428223437
153	NC_019691	AAAT	2	8	52012	52019	75 %	25 %	0 %	0 %	428223437
154	NC_019691	ACCA	2	8	52048	52055	50 %	0 %	0 %	50 %	428223437
155	NC_019691	ACTT	2	8	52181	52188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_019691	TTCT	2	8	52218	52225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_019691	ATTA	2	8	54037	54044	50 %	50 %	0 %	0 %	428223440
158	NC_019691	AAAT	2	8	54109	54116	75 %	25 %	0 %	0 %	428223440
159	NC_019691	CAAT	2	8	54347	54354	50 %	25 %	0 %	25 %	428223440
160	NC_019691	CCCG	2	8	54551	54558	0 %	0 %	25 %	75 %	428223440
161	NC_019691	CTGA	2	8	54792	54799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_019691	CTTT	2	8	55754	55761	0 %	75 %	0 %	25 %	428223442
163	NC_019691	GGAC	2	8	55940	55947	25 %	0 %	50 %	25 %	428223442
164	NC_019691	AAAT	2	8	57348	57355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019691	TAAT	2	8	57481	57488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_019691	TAAA	2	8	57763	57770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019691	TCTA	2	8	57772	57779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_019691	TTTC	2	8	58067	58074	0 %	75 %	0 %	25 %	428223445
169	NC_019691	TCCA	2	8	58537	58544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_019691	GCTG	2	8	58589	58596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
171	NC_019691	CCTT	2	8	58716	58723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_019691	AAAT	2	8	58900	58907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019691	TAAC	2	8	59167	59174	50 %	25 %	0 %	25 %	428223446
174	NC_019691	GATG	2	8	59852	59859	25 %	25 %	50 %	0 %	428223446
175	NC_019691	TCAT	2	8	60187	60194	25 %	50 %	0 %	25 %	428223446
176	NC_019691	CAAA	2	8	60869	60876	75 %	0 %	0 %	25 %	428223446
177	NC_019691	AACC	2	8	61690	61697	50 %	0 %	0 %	50 %	428223446
178	NC_019691	ATGG	2	8	61908	61915	25 %	25 %	50 %	0 %	428223446
179	NC_019691	GGCA	2	8	62021	62028	25 %	0 %	50 %	25 %	428223446
180	NC_019691	CCTC	2	8	62226	62233	0 %	25 %	0 %	75 %	428223447
181	NC_019691	ATGG	2	8	62282	62289	25 %	25 %	50 %	0 %	428223447
182	NC_019691	ATCA	2	8	62694	62701	50 %	25 %	0 %	25 %	428223447
183	NC_019691	TATT	2	8	62832	62839	25 %	75 %	0 %	0 %	428223447

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.