MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.01

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019691	AACT	2	8	21	28	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019691	CGAT	2	8	38	45	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019691	ATCG	2	8	153	160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019691	AAGC	2	8	344	351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019691	TTTG	2	8	514	521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019691	GGAT	2	8	612	619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019691	ATTT	2	8	750	757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019691	TCAG	2	8	6445	6452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019691	TAAA	2	8	11095	11102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019691	AATT	2	8	11357	11364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019691	CCTG	2	8	11394	11401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019691	TAGT	2	8	12308	12315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019691	TCGC	2	8	14303	14310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019691	TCTT	2	8	14339	14346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019691	TATT	2	8	14385	14392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019691	AATT	2	8	15213	15220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019691	GACT	2	8	15598	15605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019691	CAGA	2	8	16659	16666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019691	CTGC	2	8	16674	16681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019691	AAAG	2	8	16906	16913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019691	TGCA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019691	TTAC	2	8	17467	17474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019691	GCAA	2	8	18357	18364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019691	TAAT	2	8	20009	20016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019691	TGAT	2	8	20621	20628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019691	AGCA	2	8	21341	21348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019691	GTGG	2	8	21703	21710	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019691	TAAT	2	8	21995	22002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019691	CTTT	2	8	26679	26686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019691	GTCT	2	8	26925	26932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019691	CAGA	2	8	31684	31691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019691	CTGC	2	8	31699	31706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019691	AAAG	2	8	31931	31938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019691	TGCA	2	8	32106	32113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019691	TAAT	2	8	32926	32933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019691	AACT	2	8	34287	34294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019691	TAAA	2	8	40159	40166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019691	TAAT	2	8	40308	40315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019691	TTTA	2	8	42954	42961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019691	TTAG	2	8	46415	46422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019691	TTAT	2	8	46435	46442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019691	CTAT	2	8	46682	46689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019691	ATTG	2	8	46877	46884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019691	TTTG	2	8	49704	49711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019691	TTTG	2	8	50859	50866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019691	ACTT	2	8	52181	52188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019691	TTCT	2	8	52218	52225	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019691	CTGA	2	8	54792	54799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019691	AAAT	2	8	57348	57355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019691	TAAT	2	8	57481	57488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019691	TAAA	2	8	57763	57770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019691	TCTA	2	8	57772	57779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019691	TCCA	2	8	58537	58544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019691	GCTG	2	8	58589	58596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019691	CCTT	2	8	58716	58723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_019691	AAAT	2	8	58900	58907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.