MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.01

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019691	AAT	2	6	52	57	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019691	TAA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019691	AGG	2	6	317	322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019691	TGG	2	6	409	414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019691	ATG	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019691	GCA	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019691	TGG	2	6	768	773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019691	GAA	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019691	TCA	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019691	ATT	2	6	967	972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019691	GTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019691	ATT	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019691	TGT	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019691	AAT	2	6	6365	6370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019691	AGC	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019691	TGA	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019691	TAT	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019691	CTA	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019691	TGG	2	6	11289	11294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019691	GGC	2	6	11346	11351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019691	GCA	2	6	11549	11554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019691	GTC	2	6	11633	11638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019691	AAT	2	6	11665	11670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019691	AGT	3	9	11700	11708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019691	GCC	2	6	12249	12254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019691	TAC	2	6	13743	13748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019691	TGT	2	6	13907	13912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019691	TCC	2	6	14287	14292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019691	ATA	2	6	14366	14371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019691	ATT	2	6	14399	14404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019691	TTA	2	6	14446	14451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019691	GAG	2	6	15715	15720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019691	TTC	2	6	15788	15793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019691	GGT	2	6	15812	15817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019691	TGA	2	6	15818	15823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019691	GCC	2	6	15896	15901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_019691	CCG	2	6	15978	15983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_019691	AGA	2	6	16443	16448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019691	GTC	2	6	16757	16762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019691	ATG	2	6	17030	17035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019691	GTA	2	6	17135	17140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019691	TGG	2	6	17159	17164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019691	CAT	2	6	17347	17352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019691	ATA	2	6	17364	17369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019691	ATA	2	6	17449	17454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019691	CTA	2	6	18303	18308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019691	TAC	2	6	18411	18416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019691	ATA	2	6	18497	18502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019691	TTC	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019691	AAT	2	6	18577	18582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019691	ACC	2	6	19360	19365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019691	ACG	2	6	19559	19564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019691	CCA	2	6	19683	19688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019691	TGA	2	6	19776	19781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019691	TAC	2	6	19802	19807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019691	AGT	2	6	20047	20052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019691	TCA	2	6	20076	20081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019691	TCA	2	6	20198	20203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019691	GAA	2	6	20286	20291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019691	AGC	2	6	20299	20304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019691	TTG	2	6	20488	20493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019691	TTG	2	6	20671	20676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019691	AAT	2	6	20772	20777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019691	CAA	2	6	20787	20792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019691	ATT	2	6	20894	20899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019691	GAT	2	6	20932	20937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019691	AAT	2	6	21024	21029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019691	AAC	2	6	21034	21039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019691	AAC	2	6	21164	21169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019691	GCT	2	6	21211	21216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019691	GAT	2	6	21305	21310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019691	TGG	2	6	21462	21467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019691	AGC	2	6	21537	21542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019691	GAA	2	6	21634	21639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019691	CTG	2	6	21673	21678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019691	TGG	4	12	21708	21719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019691	AGA	2	6	21726	21731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019691	TTG	2	6	21836	21841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019691	CCG	4	12	21866	21877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_019691	AAG	2	6	21973	21978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019691	ATT	2	6	22207	22212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019691	CCG	2	6	22272	22277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_019691	TCA	2	6	24995	25000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019691	ATT	2	6	25098	25103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019691	ATG	2	6	26240	26245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019691	ACC	2	6	26427	26432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019691	TAC	2	6	26452	26457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019691	ATC	2	6	26555	26560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019691	GAC	2	6	26830	26835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019691	GGT	2	6	27308	27313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019691	TAA	2	6	27332	27337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019691	AGG	2	6	30065	30070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019691	TAT	2	6	30654	30659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019691	GTC	2	6	31782	31787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019691	ATG	2	6	32055	32060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019691	GTA	2	6	32160	32165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019691	TGG	2	6	32184	32189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019691	CAT	2	6	32372	32377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019691	ATA	2	6	32389	32394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019691	CAG	2	6	34519	34524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019691	AGC	3	9	34553	34561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019691	TTC	2	6	39112	39117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019691	CAA	2	6	39150	39155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019691	TTG	2	6	39162	39167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019691	CTA	2	6	39277	39282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019691	GTT	2	6	39338	39343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019691	AGA	2	6	40224	40229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019691	TAA	3	9	40350	40358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019691	ATA	2	6	40369	40374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019691	TTA	2	6	40831	40836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019691	AGT	2	6	40921	40926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019691	TAT	2	6	42945	42950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019691	AAG	2	6	44401	44406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019691	ATT	2	6	44411	44416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019691	ATT	2	6	44537	44542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019691	GAC	2	6	44627	44632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019691	GGA	2	6	44661	44666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019691	TTC	2	6	44957	44962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019691	CTT	2	6	45301	45306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019691	TAA	2	6	45665	45670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019691	TAG	2	6	46317	46322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019691	GAG	2	6	46345	46350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019691	CTT	2	6	46460	46465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019691	CGC	2	6	46521	46526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019691	GAC	2	6	46534	46539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019691	ATG	2	6	46754	46759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019691	GTG	2	6	46807	46812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019691	TTA	2	6	46814	46819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019691	TTA	2	6	46824	46829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019691	GAT	2	6	46896	46901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019691	ATA	2	6	46954	46959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019691	ATC	2	6	49206	49211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019691	CCG	2	6	49265	49270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_019691	TTC	2	6	49318	49323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019691	GTT	2	6	49328	49333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019691	TTA	2	6	49656	49661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019691	TGA	2	6	49715	49720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019691	TAA	2	6	50045	50050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019691	AGA	2	6	50106	50111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019691	CTA	2	6	50126	50131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_019691	GAG	2	6	59055	59060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.