MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 plasmid pNOS7524.02

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019685	AAC	2	6	167	172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019685	TTA	2	6	390	395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019685	GAC	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019685	TAA	2	6	488	493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019685	CTT	2	6	603	608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726361
6	NC_019685	ATC	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726361
7	NC_019685	ATC	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726361
8	NC_019685	TGA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726361
9	NC_019685	TTC	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726361
10	NC_019685	TCC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427726361
11	NC_019685	CAG	2	6	1212	1217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726361
12	NC_019685	CAC	2	6	1245	1250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726361
13	NC_019685	GGC	2	6	1251	1256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726361
14	NC_019685	TGA	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726361
15	NC_019685	CGG	2	6	1455	1460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726361
16	NC_019685	CAC	2	6	1552	1557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726361
17	NC_019685	GAC	2	6	1662	1667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726361
18	NC_019685	CGG	3	9	1795	1803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726362
19	NC_019685	ATT	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726362
20	NC_019685	CTT	2	6	1896	1901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726363
21	NC_019685	CGA	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726364
22	NC_019685	TTC	2	6	2097	2102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427726364
23	NC_019685	ATT	3	9	2142	2150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726364
24	NC_019685	AAT	2	6	2151	2156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726364
25	NC_019685	TGC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726364
26	NC_019685	TCA	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726365
27	NC_019685	ACG	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726365
28	NC_019685	TTG	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726365
29	NC_019685	GTT	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726366
30	NC_019685	AAG	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726366
31	NC_019685	GCA	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726366
32	NC_019685	TTG	2	6	3063	3068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726367
33	NC_019685	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726367
34	NC_019685	TGA	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427726367
35	NC_019685	GCA	2	6	3209	3214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726367
36	NC_019685	GAA	2	6	3372	3377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726368
37	NC_019685	AAC	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427726368
38	NC_019685	TAA	2	6	3566	3571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726368
39	NC_019685	AGA	2	6	3608	3613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427726368
40	NC_019685	GGA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427726368
41	NC_019685	GCC	2	6	3812	3817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_019685	TTC	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019685	ACA	2	6	3864	3869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019685	GAA	2	6	3977	3982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019685	CCA	2	6	3996	4001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019685	CGA	2	6	4099	4104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726369
47	NC_019685	CAC	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726369
48	NC_019685	AAC	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427726369
49	NC_019685	ACC	2	6	4253	4258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427726369
50	NC_019685	CGG	2	6	4389	4394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726369
51	NC_019685	CCG	2	6	4456	4461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427726369
52	NC_019685	TGC	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019685	TTC	2	6	4780	4785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019685	ACA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019685	GTT	2	6	4890	4895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019685	AAG	2	6	4953	4958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019685	TAA	2	6	5052	5057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019685	GAA	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019685	TAC	2	6	5087	5092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019685	TGC	2	6	5152	5157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019685	GCA	2	6	5190	5195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019685	CCG	2	6	5329	5334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427726370
63	NC_019685	TGC	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726370
64	NC_019685	GTT	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726370
65	NC_019685	AAT	2	6	5414	5419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427726370
66	NC_019685	ATT	2	6	5575	5580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726370
67	NC_019685	GCT	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726370
68	NC_019685	GTC	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427726370
69	NC_019685	CGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427726370
70	NC_019685	TTG	2	6	5905	5910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427726370
71	NC_019685	ACT	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726370
72	NC_019685	GCG	2	6	6073	6078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427726370
73	NC_019685	TAC	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427726370
74	NC_019685	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427726370

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.