MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 chromosome

Total Repeats: 412

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019684	TCTCTT	2	12	9192	9203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019684	GCTTAC	2	12	10683	10694	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019684	AGTGTG	2	12	16217	16228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019684	AATTAT	2	12	76780	76791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019684	ATTTTT	2	12	122868	122879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019684	TATCAT	2	12	129842	129853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019684	TAATTT	2	12	174025	174036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019684	TACACC	2	12	193498	193509	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019684	CAAATC	2	12	203607	203618	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019684	AGGGAG	2	12	204575	204586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019684	TTAAAA	2	12	232242	232253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019684	CTTTGA	2	12	233623	233634	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019684	ATTTCA	2	12	263014	263025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019684	CTTTTT	2	12	295554	295565	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019684	GTAGTT	2	12	316031	316042	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019684	AGATAG	2	12	341893	341904	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019684	AGAGCA	2	12	344381	344392	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019684	CTATAT	2	12	384759	384770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019684	CTAGTT	2	12	406208	406219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019684	ATTTTT	2	12	420387	420398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019684	ATAGGT	2	12	422374	422385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019684	ATATGA	2	12	427350	427361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019684	CGCGAA	2	12	448405	448416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019684	ATTTGA	2	12	467076	467087	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019684	AATATA	2	12	469770	469781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019684	TAGATA	2	12	497958	497969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019684	AACATA	2	12	504260	504271	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019684	CTCCTT	2	12	518622	518633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019684	AGAAAA	2	12	535058	535069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019684	TCAATT	2	12	547906	547917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019684	CTGGTT	2	12	562183	562194	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019684	AAAAAG	2	12	562755	562766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019684	AAACTC	2	12	564776	564787	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019684	AGCCGT	2	12	565471	565482	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019684	AATGAT	2	12	571354	571365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019684	TGCGAT	2	12	581230	581241	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019684	CCCCAT	2	12	596474	596485	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_019684	AAGTGC	2	12	601512	601523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019684	ATAGCT	2	12	627520	627531	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019684	TTTGCA	2	12	627610	627621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019684	GGGATT	2	12	635972	635983	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019684	TCCCCA	2	12	658051	658062	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019684	GTATTA	2	12	664638	664649	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019684	TTTAAA	2	12	666763	666774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019684	GTTTTT	2	12	684475	684486	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019684	TAATAT	2	12	689231	689242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019684	GAGAGT	2	12	704767	704778	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019684	AGCATC	2	12	712456	712467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019684	GATTCA	2	12	716011	716022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019684	TGAGGT	2	12	736321	736332	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019684	AATTAC	2	12	925464	925475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019684	CAATTA	2	12	949332	949343	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019684	CTAAAT	2	12	964881	964892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019684	CTTTTT	2	12	1019679	1019690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019684	GCGTAG	2	12	1020363	1020374	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019684	GTAATA	2	12	1061745	1061756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019684	AATTGC	2	12	1075295	1075306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019684	CTACCG	2	12	1075616	1075627	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019684	GCATAA	2	12	1093078	1093089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019684	CCCAAT	2	12	1114957	1114968	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019684	ATTTTA	2	12	1128106	1128117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019684	ACTTAA	2	12	1134450	1134461	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019684	TAAATT	2	12	1141227	1141238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019684	TAAAAA	2	12	1160706	1160717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019684	CATATT	2	12	1160976	1160987	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019684	GATACT	2	12	1174147	1174158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019684	CTGAGC	2	12	1186545	1186556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019684	AATAGA	2	12	1187769	1187780	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019684	ATAAGT	2	12	1188666	1188677	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019684	CATTAG	2	12	1189855	1189866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_019684	AATTTG	2	12	1228334	1228345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019684	TGAATT	2	12	1231778	1231789	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019684	TAAGAA	2	12	1243824	1243835	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019684	ACTGGA	2	12	1245137	1245148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019684	TGTTAA	2	12	1250329	1250340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019684	AAGGCA	2	12	1271589	1271600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019684	GCGTAG	2	12	1347456	1347467	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019684	GCGTAG	2	12	1348399	1348410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019684	TTTAGC	2	12	1351259	1351270	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019684	ATATGA	2	12	1373393	1373404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019684	GGGAGA	2	12	1388211	1388222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019684	TCCATT	2	12	1388392	1388403	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019684	AAATAA	2	12	1428653	1428664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019684	CCTACA	2	12	1439376	1439387	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_019684	AAAAAG	2	12	1469981	1469992	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019684	TGAGAA	2	12	1472449	1472460	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019684	AGGGGG	2	12	1510878	1510889	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019684	AGGCAG	2	12	1510894	1510905	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019684	ATGCCC	2	12	1542238	1542249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019684	ATATTC	2	12	1560961	1560972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019684	ACTCTT	2	12	1570419	1570430	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019684	TTTGAT	2	12	1608644	1608655	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019684	ATTAAA	2	12	1724510	1724521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019684	GCCACA	2	12	1726193	1726204	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019684	TAAAGT	2	12	1736492	1736503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019684	AGCCAA	2	12	1757281	1757292	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019684	TCCTAC	2	12	1762569	1762580	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019684	GCTGAA	2	12	1763429	1763440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_019684	GCGTAG	2	12	1768226	1768237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019684	TTTACT	2	12	1783879	1783890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019684	ACACAA	2	12	1799926	1799937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019684	GGGGAT	2	12	1841648	1841659	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019684	AAGCTG	2	12	1846963	1846974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019684	TGGTTT	2	12	1855493	1855504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019684	CGCCTA	2	12	1892800	1892811	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019684	GAATTG	2	12	1918024	1918035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019684	AAATTA	2	12	1920080	1920091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019684	TAGTTT	2	12	1940038	1940049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019684	ATTTTA	2	12	1944674	1944685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019684	AGCCTA	2	12	1968290	1968301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019684	ATATAA	2	12	1979689	1979700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019684	AAATTA	2	12	2011289	2011300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019684	TTATTT	2	12	2045241	2045252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019684	ATCAAT	2	12	2110331	2110342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_019684	CGGGTA	2	12	2135813	2135824	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019684	TCGCTT	2	12	2136710	2136721	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019684	TGTCTG	2	12	2137413	2137424	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_019684	CTTTCG	2	12	2137855	2137866	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019684	ATATTG	2	12	2199509	2199520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019684	AAGCTA	2	12	2214776	2214787	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019684	TTAAAT	2	12	2251466	2251477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019684	CTAACG	2	12	2272052	2272063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019684	ATTTAA	2	12	2352215	2352226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019684	TACCCC	2	12	2391202	2391213	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019684	TTTCTA	2	12	2404516	2404527	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019684	GACCAC	2	12	2412898	2412909	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019684	TAGCTT	2	12	2413378	2413389	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019684	CACCTA	2	12	2427677	2427688	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019684	AATAAG	2	12	2437199	2437210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019684	CTTTTT	2	12	2454092	2454103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_019684	TTAGTA	2	12	2455084	2455095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019684	GCTAAC	2	12	2459934	2459945	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019684	AAATAA	2	12	2470586	2470597	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019684	TTAGTT	2	12	2480337	2480348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_019684	CATTGG	2	12	3898550	3898561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
247	NC_019684	AATTTC	2	12	3913802	3913813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
248	NC_019684	CCGCTA	2	12	3970380	3970391	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
249	NC_019684	TGCAAC	2	12	4021951	4021962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_019684	TATTTT	2	12	4055026	4055037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019684	AAATAT	2	12	4067788	4067799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_019684	AGTCAT	2	12	4102397	4102408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_019684	AGCTAT	2	12	4107350	4107361	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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255	NC_019684	GCTTAA	2	12	4121995	4122006	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.