MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 chromosome

Total Repeats: 1039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019684	CAAAA	2	10	6256	6265	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019684	CTGCC	2	10	7577	7586	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_019684	ACTTT	2	10	9006	9015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019684	TAAAA	2	10	10062	10071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019684	TTAAT	2	10	21028	21037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019684	AGCAA	2	10	21338	21347	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019684	TTCAT	2	10	43235	43244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019684	TTTTA	2	10	49792	49801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019684	ATAAA	2	10	50124	50133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019684	TATAG	2	10	60637	60646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019684	TTTAT	2	10	61824	61833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019684	AAACT	2	10	71881	71890	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019684	AGTTT	2	10	71905	71914	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019684	CAATT	2	10	72272	72281	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019684	TAAAT	2	10	72413	72422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019684	TACCC	2	10	75786	75795	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_019684	AATTT	2	10	84844	84853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019684	AGCGG	2	10	86731	86740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019684	AGCGG	2	10	86760	86769	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019684	TATTT	2	10	109278	109287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019684	AAAAT	2	10	114762	114771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019684	TTACT	2	10	127642	127651	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019684	ACTAA	2	10	129282	129291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019684	CCACT	2	10	129993	130002	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_019684	AGTTG	2	10	130357	130366	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019684	TCATC	2	10	136246	136255	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019684	CTTTT	2	10	144592	144601	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019684	AACTA	2	10	145231	145240	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019684	AGTTG	2	10	149234	149243	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019684	TTTGA	2	10	149263	149272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019684	AAAAT	2	10	151226	151235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019684	TCGTT	2	10	167433	167442	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019684	AAATC	2	10	167766	167775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019684	CAAAT	2	10	173879	173888	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019684	ATTAA	2	10	174001	174010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019684	ATCCA	2	10	176219	176228	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019684	CCCAC	2	10	176646	176655	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
38	NC_019684	TCATC	2	10	176715	176724	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_019684	AGTAC	2	10	190832	190841	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019684	CTCAT	2	10	202803	202812	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019684	TTGCC	2	10	203541	203550	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019684	ACTCA	2	10	210906	210915	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_019684	TCAAA	2	10	210921	210930	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019684	TAATT	2	10	222575	222584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019684	TGGGT	2	10	222627	222636	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019684	TTTAC	2	10	227486	227495	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_019684	GGATT	2	10	228682	228691	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019684	AATTA	2	10	242619	242628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019684	ATGAA	2	10	242653	242662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019684	TATTT	2	10	247060	247069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019684	ACATC	2	10	258656	258665	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_019684	CTTAA	2	10	268661	268670	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019684	CCCTC	2	10	268782	268791	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
54	NC_019684	CCCGC	2	10	272477	272486	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
55	NC_019684	GTCTT	2	10	282886	282895	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019684	TCATC	2	10	284995	285004	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019684	GATTT	2	10	291717	291726	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019684	AATCT	2	10	292312	292321	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019684	TCAAT	2	10	293653	293662	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019684	GAAAA	2	10	293749	293758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019684	CCATG	2	10	299082	299091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_019684	ACTTA	2	10	303312	303321	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019684	AAGTT	2	10	303377	303386	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019684	AGATT	2	10	315817	315826	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019684	CTCCC	2	10	322600	322609	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
66	NC_019684	TTGAT	2	10	329950	329959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019684	AAGGG	2	10	344534	344543	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019684	TAAAT	2	10	347027	347036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019684	AGCGG	2	10	348645	348654	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019684	TTTAG	2	10	351794	351803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019684	GGTTT	2	10	353007	353016	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019684	AATAT	2	10	357643	357652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019684	AACTG	2	10	359435	359444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019684	GGCTG	2	10	374792	374801	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019684	TTTCA	2	10	382653	382662	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019684	TCCTT	2	10	388810	388819	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_019684	AGAGA	2	10	390719	390728	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019684	AAATG	2	10	404175	404184	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019684	AATTC	2	10	406604	406613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019684	CTAGC	2	10	408491	408500	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_019684	TAAAT	2	10	415041	415050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019684	AAATT	2	10	415086	415095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019684	AGATT	2	10	415227	415236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019684	AAATG	2	10	418357	418366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019684	AACCT	2	10	422491	422500	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_019684	ATAAA	2	10	427278	427287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019684	AATCA	2	10	427646	427655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019684	GCATT	2	10	435068	435077	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019684	AGGAA	2	10	439169	439178	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019684	ATGAG	3	15	441164	441178	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019684	TTTAA	2	10	443972	443981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019684	AATTG	2	10	444086	444095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019684	CAACT	2	10	454406	454415	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_019684	GGCTT	2	10	460930	460939	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019684	GTTAA	2	10	472262	472271	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019684	AATTG	2	10	477502	477511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019684	TAAAA	2	10	477706	477715	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019684	GTGAT	2	10	491040	491049	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019684	ACTTT	2	10	498757	498766	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019684	ATTTG	2	10	501499	501508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019684	CAACG	2	10	504411	504420	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_019684	CAGGG	2	10	505469	505478	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019684	ATTTG	2	10	512690	512699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019684	GTTAT	2	10	527223	527232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019684	ATTTA	2	10	545284	545293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019684	TTGCA	2	10	550718	550727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019684	CGATA	2	10	551571	551580	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019684	CTTTT	2	10	564561	564570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_019684	AATTG	2	10	564657	564666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019684	TCAAC	2	10	569116	569125	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_019684	ATAAA	2	10	574792	574801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019684	GATTT	2	10	578190	578199	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019684	AGAAT	2	10	586951	586960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019684	TTCTG	2	10	593046	593055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019684	TAGGA	2	10	603633	603642	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019684	ACTTA	2	10	604915	604924	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019684	TTTGT	2	10	608076	608085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019684	ACAAT	2	10	609737	609746	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019684	ATTGA	3	15	612269	612283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019684	AATTG	2	10	616247	616256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019684	TGTAA	2	10	621010	621019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019684	CGCTC	2	10	627026	627035	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_019684	TTGTA	2	10	628892	628901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019684	AAATC	2	10	632466	632475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_019684	ATTTT	2	10	641274	641283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019684	CCTAA	2	10	645687	645696	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_019684	GGCGT	2	10	648598	648607	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_019684	CAACC	2	10	648656	648665	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_019684	ATTAA	2	10	651394	651403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019684	CCGCT	2	10	651487	651496	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_019684	CCGCT	2	10	651516	651525	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_019684	CGCTC	2	10	651546	651555	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_019684	AATCC	2	10	677162	677171	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_019684	GCTTT	2	10	708205	708214	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019684	TAATT	2	10	711736	711745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019684	GCTAC	2	10	711886	711895	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_019684	CTAAA	2	10	711936	711945	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_019684	GCTGG	2	10	715851	715860	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019684	TTTAC	2	10	719796	719805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019684	CACAT	2	10	727961	727970	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_019684	TAACC	2	10	745946	745955	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_019684	CTCCC	2	10	748643	748652	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
143	NC_019684	ATGAG	2	10	751686	751695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019684	CGTTA	2	10	755865	755874	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019684	TTTAG	2	10	768490	768499	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019684	CTATT	2	10	770403	770412	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019684	ATTTA	2	10	789444	789453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019684	TCCTT	2	10	800115	800124	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_019684	ATGTG	2	10	810096	810105	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019684	TAATT	2	10	817842	817851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019684	TAATT	2	10	817865	817874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019684	AGCGG	2	10	819594	819603	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
153	NC_019684	AGCGG	2	10	819623	819632	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
154	NC_019684	ATTTT	2	10	843282	843291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019684	GATTT	2	10	846675	846684	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019684	AAAGA	2	10	860673	860682	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019684	AAGTT	2	10	872511	872520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019684	AATTT	2	10	874244	874253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019684	GTGTG	2	10	878029	878038	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_019684	AAATC	2	10	896198	896207	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_019684	AGAGA	2	10	898958	898967	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019684	TTAAT	2	10	907990	907999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_019684	TTTTC	2	10	932860	932869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_019684	GATAG	2	10	941548	941557	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019684	AAATT	2	10	942307	942316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019684	ATTGC	2	10	946993	947002	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_019684	AATTA	2	10	958158	958167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019684	AGAGA	2	10	958434	958443	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019684	AACCA	2	10	963273	963282	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
172	NC_019684	TTAAT	2	10	973828	973837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019684	CATTT	2	10	981957	981966	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_019684	ATCTA	2	10	987540	987549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_019684	TGCAA	2	10	997054	997063	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_019684	TTATT	2	10	1004341	1004350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_019684	TCAAT	2	10	1017778	1017787	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_019684	GAAAA	2	10	1017874	1017883	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_019684	TTGCT	2	10	1019896	1019905	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
184	NC_019684	CAGTT	2	10	1026755	1026764	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_019684	AGAAT	2	10	1036249	1036258	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019684	AGTTT	2	10	1040193	1040202	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_019684	CCCAG	2	10	1048354	1048363	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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192	NC_019684	CCCTT	2	10	1098574	1098583	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
193	NC_019684	GAACT	2	10	1110698	1110707	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
194	NC_019684	TAATT	2	10	1110876	1110885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_019684	TAGGG	2	10	1111775	1111784	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
196	NC_019684	TAAGT	2	10	1111845	1111854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_019684	CCGCT	2	10	1111989	1111998	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
198	NC_019684	ATTAA	2	10	1121091	1121100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_019684	TGCCA	2	10	1127697	1127706	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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201	NC_019684	GGTAT	2	10	1152365	1152374	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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215	NC_019684	TCCTT	2	10	1210682	1210691	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_019684	TTAAT	2	10	1710929	1710938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_019684	ATGTA	2	10	1712185	1712194	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_019684	TTTGC	2	10	1749787	1749796	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
282	NC_019684	ACAAA	2	10	1752170	1752179	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_019684	TGTAT	2	10	1757211	1757220	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019684	CAACT	2	10	1758401	1758410	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_019684	ATTAA	2	10	1758897	1758906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_019684	TATAT	2	10	1764658	1764667	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_019684	CTTGT	2	10	1767350	1767359	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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291	NC_019684	ATTTA	2	10	1768605	1768614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_019684	AAATC	2	10	2605961	2605970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
423	NC_019684	TTTCC	2	10	2608999	2609008	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_019684	TGGAT	2	10	3116516	3116525	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

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