MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019683	TAAGAA	2	12	25002	25013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019683	TTAATT	2	12	47382	47393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019683	ATCAAT	2	12	62415	62426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019683	GCAACA	2	12	83782	83793	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019683	AAAAAT	2	12	91878	91889	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019683	TGCCTC	2	12	105838	105849	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019683	TAAAGA	2	12	125550	125561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019683	CAAAGC	2	12	127924	127935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019683	ACTTCT	2	12	140285	140296	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019683	CAATAT	2	12	143125	143136	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019683	TCTATT	2	12	161489	161500	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019683	ATTAGG	2	12	213042	213053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019683	GGCGAT	2	12	236856	236867	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019683	ACAGAC	2	12	322649	322660	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019683	GAAACA	2	12	425507	425518	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019683	AAAAGT	2	12	425582	425593	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019683	TCCAAA	2	12	498671	498682	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019683	ATCACG	2	12	516532	516543	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019683	AAATTT	2	12	538154	538165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019683	TGGGAT	2	12	543622	543633	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019683	AAAAAT	2	12	560701	560712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019683	AAAAAT	2	12	560793	560804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019683	ATCAAA	2	12	560857	560868	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019683	TGCCGT	2	12	566850	566861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019683	AAAATC	2	12	569099	569110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019683	ATGGCA	2	12	569559	569570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_019683	ATATCT	2	12	575856	575867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_019683	CAACGA	2	12	586596	586607	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019683	CTTTCT	2	12	623896	623907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019683	TTACTT	2	12	632394	632405	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019683	AATAGA	2	12	679608	679619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019683	GAAAGA	2	12	679703	679714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019683	AGAAGG	2	12	684704	684715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019683	TTGATT	2	12	726330	726341	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019683	TATTTC	2	12	760499	760510	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019683	GCCATA	2	12	761609	761620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019683	GGCAGA	2	12	768804	768815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019683	TTAACC	2	12	781984	781995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019683	TCATCC	2	12	787434	787445	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019683	AGCCAA	2	12	800451	800462	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019683	AAAGCA	2	12	820599	820610	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019683	CTATCC	2	12	849224	849235	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019683	ATTTTT	2	12	860052	860063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019683	TGGGAA	2	12	881642	881653	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019683	TAATGG	2	12	907078	907089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019683	AAATAA	2	12	911934	911945	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019683	GAGGGA	2	12	928976	928987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019683	TACCAC	2	12	930075	930086	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019683	ATCTCC	2	12	985307	985318	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019683	TGACGG	2	12	989117	989128	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019683	TTTCTT	2	12	1012129	1012140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019683	TTGGGT	2	12	1013965	1013976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019683	AGCAGA	2	12	1014157	1014168	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019683	CACTGG	2	12	1017225	1017236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019683	TCTCTT	2	12	1023966	1023977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019683	CAATAT	2	12	1028721	1028732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_019683	TAATCA	2	12	1036141	1036152	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_019683	AAGAGT	2	12	1040125	1040136	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019683	ACGGTA	2	12	1080534	1080545	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019683	TAAAGC	2	12	1082469	1082480	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_019683	ATTTTG	2	12	1084105	1084116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019683	TTAAGA	2	12	1085457	1085468	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019683	CACCAA	2	12	1088299	1088310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019683	AGAAAA	2	12	1110326	1110337	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019683	TACAAG	2	12	1113935	1113946	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019683	AAATCA	2	12	1126117	1126128	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019683	AGGTTT	2	12	1146003	1146014	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019683	TTTTTA	2	12	1172568	1172579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019683	GATTTA	2	12	1188806	1188817	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019683	GATTTT	2	12	1248155	1248166	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019683	TCTTTT	2	12	1265967	1265978	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019683	TTTTTA	2	12	1324494	1324505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019683	TTGATT	2	12	1331254	1331265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019683	TCAAAT	2	12	1331389	1331400	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019683	CCGCTT	2	12	1375893	1375904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019683	AATGAT	2	12	1400327	1400338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019683	CATCTC	2	12	1415662	1415673	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019683	GGTTGG	2	12	1429197	1429208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019683	GCGACT	2	12	1504317	1504328	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019683	GCTTCT	2	12	1541635	1541646	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019683	GCAAAG	2	12	1541691	1541702	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019683	GAGAGG	2	12	1582119	1582130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019683	TTCTTT	2	12	1607288	1607299	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019683	TAACCG	2	12	1621389	1621400	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019683	CCTTCT	2	12	1737288	1737299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019683	AAGTTA	2	12	1764317	1764328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019683	AGAAGT	2	12	1841245	1841256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019683	ACATCA	2	12	1902552	1902563	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019683	ACTCTA	2	12	1930349	1930360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019683	TTTAGT	2	12	1990231	1990242	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019683	GAGCTA	2	12	2081598	2081609	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019683	GAAACC	2	12	2110457	2110468	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019683	GTCATG	2	12	2116284	2116295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019683	AGAAAA	2	12	2122953	2122964	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019683	CTATGG	2	12	2128410	2128421	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019683	GTATTA	2	12	2142707	2142718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019683	GATCGC	2	12	2154588	2154599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019683	GGGAGA	2	12	2171142	2171153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019683	AACACT	2	12	2188281	2188292	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019683	TCTAAG	2	12	2190949	2190960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019683	TGCCAT	2	12	2221905	2221916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019683	ACTTTT	2	12	2227055	2227066	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_019683	AAAAGT	2	12	2281201	2281212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019683	ATAGTA	2	12	2355351	2355362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019683	GATGCT	2	12	2383702	2383713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019683	AAAAGT	2	12	2413592	2413603	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019683	ATCTTT	2	12	2417201	2417212	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019683	CACAAA	2	12	2432696	2432707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019683	CACCAA	2	12	2443961	2443972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019683	AAAAGG	2	12	2453204	2453215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019683	ACCCGA	2	12	2489493	2489504	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019683	ATTTTC	2	12	2580242	2580253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019683	CCGTAC	2	12	2603443	2603454	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019683	TTTTAT	2	12	2632092	2632103	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019683	GAAAAA	2	12	2634151	2634162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019683	ACAGAA	2	12	2673040	2673051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_019683	ACGTCA	2	12	2696879	2696890	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019683	AAAAGT	2	12	2734549	2734560	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019683	CTGTTG	2	12	2802850	2802861	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019683	TTTAAA	2	12	2835026	2835037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019683	AGTGTG	2	12	2863296	2863307	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019683	ATTTTT	2	12	2869485	2869496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019683	ACTCTT	2	12	2886644	2886655	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019683	TCTTGA	2	12	2893164	2893175	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019683	TAAAAA	2	12	2893875	2893886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019683	GAAAGA	2	12	2894591	2894602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.