MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 1521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019682	ACCTA	2	10	5451	5460	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019682	ACCCC	2	10	7397	7406	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_019682	AGGGG	2	10	7703	7712	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019682	CACCC	2	10	19683	19692	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_019682	TCAAT	2	10	33702	33711	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019682	CAAAT	2	10	40853	40862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019682	ACACC	3	15	43646	43660	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_019682	TCTTA	2	10	62898	62907	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019682	CAACC	2	10	63319	63328	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_019682	AAGGG	2	10	68209	68218	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019682	TTATT	2	10	69024	69033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019682	CTAAA	2	10	72149	72158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_019682	AGATT	2	10	73758	73767	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019682	GAATT	2	10	74231	74240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019682	TTAGA	2	10	77133	77142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019682	CTTCT	2	10	87628	87637	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019682	ACAGC	2	10	93524	93533	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_019682	CAGAA	2	10	94205	94214	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_019682	TACAA	2	10	104673	104682	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019682	TTGAA	2	10	106244	106253	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019682	ACGAC	2	10	119880	119889	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_019682	TCATA	2	10	122495	122504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019682	TGCGC	2	10	127850	127859	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019682	TGGTG	2	10	128016	128025	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019682	ATTCC	2	10	134777	134786	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019682	TGATT	2	10	136223	136232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019682	GTGCC	2	10	139369	139378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_019682	TCCCA	2	10	144789	144798	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_019682	GTGCC	2	10	146640	146649	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_019682	GTGCC	2	10	148084	148093	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019682	AAATG	2	10	156816	156825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019682	TTTGG	2	10	161477	161486	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019682	TAAGT	2	10	165493	165502	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019682	TAGGT	2	10	167175	167184	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019682	CTTAA	2	10	167258	167267	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019682	TTTTG	2	10	176198	176207	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019682	CGCTA	2	10	180161	180170	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_019682	GTAAT	2	10	191453	191462	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019682	GTATT	2	10	201336	201345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019682	GGCAC	2	10	218560	218569	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019682	GGCAC	2	10	218590	218599	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_019682	GCCAC	2	10	218718	218727	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_019682	GGTTG	2	10	218766	218775	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019682	ACGAC	2	10	218930	218939	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_019682	ATGAG	2	10	221355	221364	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019682	CTATC	2	10	230993	231002	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_019682	CAAAA	2	10	231090	231099	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019682	AATTA	2	10	231382	231391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019682	AATTC	2	10	231445	231454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019682	CAACC	2	10	249027	249036	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_019682	CTTGA	2	10	254539	254548	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019682	GTGCC	2	10	256989	256998	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_019682	GTGCC	2	10	257043	257052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_019682	TTCAT	2	10	257239	257248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019682	CATGT	2	10	266499	266508	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019682	TACGC	2	10	266589	266598	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019682	AATAA	2	10	271826	271835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019682	AATTA	2	10	281829	281838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019682	GAATT	2	10	283293	283302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019682	CAGTT	2	10	284847	284856	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019682	ACCAA	2	10	287976	287985	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_019682	AACTG	2	10	294159	294168	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019682	CAAAA	2	10	297371	297380	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019682	GGTAG	2	10	298692	298701	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019682	CACCC	2	10	299372	299381	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
66	NC_019682	TCGCT	2	10	310179	310188	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_019682	GATTT	2	10	311012	311021	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019682	GTAGG	2	10	311033	311042	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019682	AAATA	2	10	311112	311121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019682	CAACC	2	10	316591	316600	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_019682	GCCAC	2	10	316639	316648	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_019682	AAGGG	2	10	316768	316777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019682	AAATT	2	10	319489	319498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019682	TAAAT	2	10	322658	322667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019682	AATCA	2	10	326723	326732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_019682	CCACC	2	10	326983	326992	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
77	NC_019682	GTGCT	2	10	336381	336390	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019682	GTTGA	2	10	354896	354905	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019682	AGTAG	2	10	355835	355844	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019682	ATTTA	2	10	358810	358819	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019682	GTCTT	2	10	385525	385534	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_019682	TAGTT	2	10	405961	405970	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019682	TCAAG	2	10	410696	410705	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019682	AGCAA	2	10	415245	415254	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_019682	TGTAT	2	10	418140	418149	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019682	AAAAT	2	10	421664	421673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019682	TAAGA	2	10	421985	421994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019682	GGCGA	2	10	438493	438502	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_019682	GTTTA	2	10	442821	442830	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019682	GGCAC	2	10	446118	446127	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_019682	GGCAC	2	10	446233	446242	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_019682	CTAGC	2	10	451438	451447	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_019682	ATTTA	2	10	453014	453023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019682	TAGTT	2	10	456771	456780	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019682	TAGTG	2	10	461184	461193	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019682	GAACA	2	10	463818	463827	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019682	GAGCG	2	10	476839	476848	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_019682	ATTGA	2	10	489500	489509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019682	ACCCT	2	10	503196	503205	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_019682	TAAAA	2	10	508614	508623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019682	TTAGA	2	10	526433	526442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019682	ACAGG	2	10	526574	526583	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019682	AATCC	2	10	528552	528561	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_019682	ACAGC	2	10	529391	529400	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_019682	CAGAA	2	10	530072	530081	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019682	ATTCA	2	10	536831	536840	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019682	AGGAG	2	10	540781	540790	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019682	AAATT	2	10	549969	549978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019682	GGCAC	2	10	556386	556395	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_019682	AAATT	2	10	557580	557589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019682	CAAAA	2	10	570687	570696	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019682	CAGAT	2	10	570723	570732	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019682	ACATG	2	10	570839	570848	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019682	AACCA	2	10	581931	581940	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_019682	GATGT	2	10	591831	591840	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019682	CAAGA	2	10	592929	592938	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019682	TGGCA	2	10	593220	593229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019682	CAAAA	2	10	593420	593429	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019682	CACCC	2	10	598484	598493	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
120	NC_019682	CCTCC	2	10	598515	598524	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
121	NC_019682	CAGTT	2	10	601864	601873	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019682	ACCCC	2	10	603873	603882	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
123	NC_019682	TTTTG	2	10	606341	606350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019682	TAAAA	2	10	626322	626331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019682	TAAAT	2	10	626388	626397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019682	GGTAG	2	10	633174	633183	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019682	TAATT	2	10	638212	638221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019682	GGTTA	2	10	641257	641266	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019682	ATTTG	2	10	644395	644404	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019682	CTTTC	2	10	649334	649343	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_019682	TAAAT	2	10	655682	655691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019682	TATTT	2	10	655845	655854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019682	TTTTG	2	10	656486	656495	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019682	AATTA	2	10	661549	661558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019682	GGCAC	2	10	667870	667879	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_019682	TGAAA	2	10	690367	690376	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019682	TCGCC	2	10	702809	702818	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_019682	TTTAC	2	10	714011	714020	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_019682	CAAAA	2	10	719461	719470	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019682	TGGGT	2	10	720383	720392	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019682	GGGGT	2	10	721610	721619	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019682	GTATT	2	10	727020	727029	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019682	ATTTT	2	10	727039	727048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019682	TGGGG	2	10	734383	734392	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019682	TGTTT	2	10	734403	734412	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019682	TCTGC	2	10	735291	735300	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_019682	GAAAA	2	10	742777	742786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019682	ACTTA	2	10	749542	749551	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_019682	CAAAA	2	10	751038	751047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_019682	TTTTA	2	10	754773	754782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019682	TCCTC	2	10	755029	755038	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
152	NC_019682	TGATA	2	10	761704	761713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_019682	ACTCT	2	10	798985	798994	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_019682	CTGAT	2	10	818845	818854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_019682	TTTTA	2	10	918343	918352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019682	TAACT	2	10	920062	920071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_019682	GCATT	2	10	920907	920916	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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269	NC_019682	AGTTA	2	10	1313923	1313932	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019682	CAACC	2	10	1313946	1313955	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
271	NC_019682	AACTG	2	10	1313969	1313978	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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273	NC_019682	CCCTT	2	10	1335039	1335048	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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276	NC_019682	TCCCA	2	10	1356413	1356422	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
277	NC_019682	TTTTG	2	10	1358450	1358459	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_019682	TCACA	2	10	1394732	1394741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
285	NC_019682	AAACC	2	10	1395722	1395731	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
286	NC_019682	AAGAT	2	10	1399391	1399400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_019682	TGATT	2	10	1422262	1422271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_019682	ACCCC	2	10	1948707	1948716	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
429	NC_019682	TCCCC	2	10	1948721	1948730	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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482	NC_019682	GTAAG	2	10	2165674	2165683	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_019682	GACTT	2	10	2223409	2223418	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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492	NC_019682	CTTAT	2	10	2234212	2234221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_019682	ACCCC	2	10	2247876	2247885	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding

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