MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 18226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019682	ACGA	2	8	310	317	50 %	0 %	25 %	25 %	427715355
2	NC_019682	GTAT	2	8	1222	1229	25 %	50 %	25 %	0 %	427715355
3	NC_019682	TAAT	2	8	1737	1744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019682	CGAC	2	8	1915	1922	25 %	0 %	25 %	50 %	427715356
5	NC_019682	TTGA	2	8	2281	2288	25 %	50 %	25 %	0 %	427715356
6	NC_019682	CCAG	2	8	2473	2480	25 %	0 %	25 %	50 %	427715356
7	NC_019682	AACT	2	8	3284	3291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019682	AGCA	2	8	3385	3392	50 %	0 %	25 %	25 %	427715357
9	NC_019682	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	427715357
10	NC_019682	CTCA	2	8	5683	5690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_019682	AACG	2	8	5843	5850	50 %	0 %	25 %	25 %	427715358
12	NC_019682	GTGA	2	8	5945	5952	25 %	25 %	50 %	0 %	427715358
13	NC_019682	TCAA	2	8	6432	6439	50 %	25 %	0 %	25 %	427715358
14	NC_019682	CCAG	2	8	6765	6772	25 %	0 %	25 %	50 %	427715358
15	NC_019682	ACAT	2	8	7386	7393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019682	TTAA	2	8	7739	7746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019682	TTAA	2	8	7967	7974	50 %	50 %	0 %	0 %	427715359
18	NC_019682	TGGC	2	8	8406	8413	0 %	25 %	50 %	25 %	427715360
19	NC_019682	GAGT	2	8	8414	8421	25 %	25 %	50 %	0 %	427715360
20	NC_019682	AAGC	2	8	8598	8605	50 %	0 %	25 %	25 %	427715360
21	NC_019682	TGGA	2	8	8683	8690	25 %	25 %	50 %	0 %	427715360
22	NC_019682	TGAG	2	8	11637	11644	25 %	25 %	50 %	0 %	427715364
23	NC_019682	AGCT	2	8	11924	11931	25 %	25 %	25 %	25 %	427715365
24	NC_019682	TAGA	2	8	12215	12222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019682	CTGA	2	8	12380	12387	25 %	25 %	25 %	25 %	427715366
26	NC_019682	TAAA	2	8	12389	12396	75 %	25 %	0 %	0 %	427715366
27	NC_019682	ACTC	2	8	12958	12965	25 %	25 %	0 %	50 %	427715366
28	NC_019682	GTTT	2	8	13390	13397	0 %	75 %	25 %	0 %	427715366
29	NC_019682	TGGT	2	8	14031	14038	0 %	50 %	50 %	0 %	427715367
30	NC_019682	GGAC	2	8	14300	14307	25 %	0 %	50 %	25 %	427715367
31	NC_019682	TGAT	2	8	15158	15165	25 %	50 %	25 %	0 %	427715367
32	NC_019682	GACT	2	8	15464	15471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019682	CCAC	2	8	15917	15924	25 %	0 %	0 %	75 %	427715368
34	NC_019682	AGCT	2	8	15963	15970	25 %	25 %	25 %	25 %	427715368
35	NC_019682	TTTA	2	8	16234	16241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019682	CCAG	2	8	17235	17242	25 %	0 %	25 %	50 %	427715369
37	NC_019682	TCAA	2	8	17463	17470	50 %	25 %	0 %	25 %	427715369
38	NC_019682	TTAC	2	8	17661	17668	25 %	50 %	0 %	25 %	427715369
39	NC_019682	TTCA	2	8	17708	17715	25 %	50 %	0 %	25 %	427715369
40	NC_019682	CTTC	2	8	19121	19128	0 %	50 %	0 %	50 %	427715369
41	NC_019682	GCAA	2	8	19717	19724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019682	ATTT	2	8	19895	19902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019682	CAAT	2	8	20029	20036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019682	TGTT	2	8	20197	20204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019682	TGCT	2	8	20499	20506	0 %	50 %	25 %	25 %	427715370
46	NC_019682	GCTT	2	8	21440	21447	0 %	50 %	25 %	25 %	427715371
47	NC_019682	CAAC	2	8	22207	22214	50 %	0 %	0 %	50 %	427715371
48	NC_019682	CTTT	2	8	22223	22230	0 %	75 %	0 %	25 %	427715371
49	NC_019682	TTAA	2	8	22337	22344	50 %	50 %	0 %	0 %	427715371
50	NC_019682	GTCT	2	8	22693	22700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019682	AGAT	2	8	23115	23122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019682	GTTG	2	8	23621	23628	0 %	50 %	50 %	0 %	427715372
53	NC_019682	ATTA	2	8	24080	24087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019682	AAGC	2	8	24358	24365	50 %	0 %	25 %	25 %	427715373
55	NC_019682	TTCC	2	8	25857	25864	0 %	50 %	0 %	50 %	427715374
56	NC_019682	TCTT	2	8	26004	26011	0 %	75 %	0 %	25 %	427715374
57	NC_019682	CTAG	2	8	26030	26037	25 %	25 %	25 %	25 %	427715374
58	NC_019682	GCTA	2	8	26831	26838	25 %	25 %	25 %	25 %	427715375
59	NC_019682	CAGG	2	8	27124	27131	25 %	0 %	50 %	25 %	427715375
60	NC_019682	TAGT	2	8	27751	27758	25 %	50 %	25 %	0 %	427715375
61	NC_019682	TAGC	2	8	28003	28010	25 %	25 %	25 %	25 %	427715375
62	NC_019682	CTCA	2	8	28184	28191	25 %	25 %	0 %	50 %	427715375
63	NC_019682	ATTA	2	8	28421	28428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019682	TTGA	2	8	28819	28826	25 %	50 %	25 %	0 %	427715376
65	NC_019682	ATTA	2	8	29341	29348	50 %	50 %	0 %	0 %	427715376
66	NC_019682	ACTA	2	8	29620	29627	50 %	25 %	0 %	25 %	427715376
67	NC_019682	AGGG	2	8	30764	30771	25 %	0 %	75 %	0 %	427715377
68	NC_019682	GGGA	2	8	31907	31914	25 %	0 %	75 %	0 %	427715378
69	NC_019682	TAAA	2	8	31942	31949	75 %	25 %	0 %	0 %	427715378
70	NC_019682	AGCC	2	8	32108	32115	25 %	0 %	25 %	50 %	427715378
71	NC_019682	GCTG	2	8	32484	32491	0 %	25 %	50 %	25 %	427715379
72	NC_019682	TTGC	2	8	33397	33404	0 %	50 %	25 %	25 %	427715379
73	NC_019682	TTTA	2	8	33565	33572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019682	CTTA	2	8	34467	34474	25 %	50 %	0 %	25 %	427715380
75	NC_019682	ATTG	2	8	34483	34490	25 %	50 %	25 %	0 %	427715380
76	NC_019682	CAAA	2	8	34858	34865	75 %	0 %	0 %	25 %	427715380
77	NC_019682	CTTT	2	8	35265	35272	0 %	75 %	0 %	25 %	427715380
78	NC_019682	GGTA	2	8	37315	37322	25 %	25 %	50 %	0 %	427715382
79	NC_019682	AATT	2	8	37444	37451	50 %	50 %	0 %	0 %	427715382
80	NC_019682	CCAA	2	8	37455	37462	50 %	0 %	0 %	50 %	427715382
81	NC_019682	AATC	2	8	37916	37923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019682	TTAA	2	8	38384	38391	50 %	50 %	0 %	0 %	427715384
83	NC_019682	GCGT	2	8	38585	38592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019682	CTGG	2	8	38694	38701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019682	GTCT	2	8	39171	39178	0 %	50 %	25 %	25 %	427715385
86	NC_019682	ATCA	2	8	39411	39418	50 %	25 %	0 %	25 %	427715385
87	NC_019682	TCAA	2	8	39886	39893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019682	CTTG	2	8	40014	40021	0 %	50 %	25 %	25 %	427715386
89	NC_019682	CAAA	2	8	40361	40368	75 %	0 %	0 %	25 %	427715386
90	NC_019682	TAAT	2	8	40906	40913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019682	ACTA	2	8	41506	41513	50 %	25 %	0 %	25 %	427715388
92	NC_019682	GATT	2	8	41644	41651	25 %	50 %	25 %	0 %	427715388
93	NC_019682	CAAT	2	8	42895	42902	50 %	25 %	0 %	25 %	427715389
94	NC_019682	CCAC	2	8	43120	43127	25 %	0 %	0 %	75 %	427715389
95	NC_019682	TTGT	2	8	43306	43313	0 %	75 %	25 %	0 %	427715389
96	NC_019682	TTGC	2	8	43438	43445	0 %	50 %	25 %	25 %	427715389
97	NC_019682	AAGC	2	8	43553	43560	50 %	0 %	25 %	25 %	427715389
98	NC_019682	GAAA	2	8	43858	43865	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019682	GCAA	2	8	44469	44476	50 %	0 %	25 %	25 %	427715390
100	NC_019682	AAAT	2	8	44650	44657	75 %	25 %	0 %	0 %	427715390
101	NC_019682	AAGG	2	8	45094	45101	50 %	0 %	50 %	0 %	427715391
102	NC_019682	CAGC	2	8	45744	45751	25 %	0 %	25 %	50 %	427715391
103	NC_019682	GCTT	2	8	46091	46098	0 %	50 %	25 %	25 %	427715392
104	NC_019682	AGCA	2	8	47320	47327	50 %	0 %	25 %	25 %	427715393
105	NC_019682	CAAC	2	8	47543	47550	50 %	0 %	0 %	50 %	427715393
106	NC_019682	AGAA	2	8	47983	47990	75 %	0 %	25 %	0 %	427715394
107	NC_019682	TAGG	2	8	48115	48122	25 %	25 %	50 %	0 %	427715394
108	NC_019682	GTTG	2	8	48689	48696	0 %	50 %	50 %	0 %	427715394
109	NC_019682	GGAG	2	8	48816	48823	25 %	0 %	75 %	0 %	427715394
110	NC_019682	ATCA	2	8	48960	48967	50 %	25 %	0 %	25 %	427715394
111	NC_019682	CGGG	2	8	49336	49343	0 %	0 %	75 %	25 %	427715395
112	NC_019682	TGGT	2	8	50002	50009	0 %	50 %	50 %	0 %	427715396
113	NC_019682	ACTG	2	8	51527	51534	25 %	25 %	25 %	25 %	427715398
114	NC_019682	TCGC	2	8	52170	52177	0 %	25 %	25 %	50 %	427715400
115	NC_019682	TGTT	2	8	52840	52847	0 %	75 %	25 %	0 %	427715400
116	NC_019682	TTCA	2	8	52936	52943	25 %	50 %	0 %	25 %	427715400
117	NC_019682	TGGG	2	8	53030	53037	0 %	25 %	75 %	0 %	427715400
118	NC_019682	CGAT	2	8	53558	53565	25 %	25 %	25 %	25 %	427715400
119	NC_019682	GTTG	2	8	54361	54368	0 %	50 %	50 %	0 %	427715401
120	NC_019682	TTTG	2	8	54444	54451	0 %	75 %	25 %	0 %	427715401
121	NC_019682	TAAA	2	8	55196	55203	75 %	25 %	0 %	0 %	427715401
122	NC_019682	ACTG	2	8	55257	55264	25 %	25 %	25 %	25 %	427715401
123	NC_019682	TGAT	2	8	55337	55344	25 %	50 %	25 %	0 %	427715401
124	NC_019682	GTCC	2	8	56172	56179	0 %	25 %	25 %	50 %	427715402
125	NC_019682	AGCT	2	8	56715	56722	25 %	25 %	25 %	25 %	427715402
126	NC_019682	TTTG	2	8	57022	57029	0 %	75 %	25 %	0 %	427715402
127	NC_019682	AAGC	2	8	57478	57485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019682	GAGC	2	8	58490	58497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019682	TGGA	2	8	58570	58577	25 %	25 %	50 %	0 %	427715405
130	NC_019682	ATTT	2	8	59170	59177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019682	CCTT	2	8	59196	59203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019682	TGTT	2	8	59349	59356	0 %	75 %	25 %	0 %	427715406
133	NC_019682	GTGG	2	8	59663	59670	0 %	25 %	75 %	0 %	427715407
134	NC_019682	GATT	2	8	59762	59769	25 %	50 %	25 %	0 %	427715408
135	NC_019682	ATTA	2	8	60797	60804	50 %	50 %	0 %	0 %	427715408
136	NC_019682	GTTG	2	8	60912	60919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019682	TTCT	2	8	61113	61120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019682	CCAG	2	8	61480	61487	25 %	0 %	25 %	50 %	427715411
139	NC_019682	CTTT	2	8	62107	62114	0 %	75 %	0 %	25 %	427715412
140	NC_019682	AATA	2	8	62205	62212	75 %	25 %	0 %	0 %	427715412
141	NC_019682	GATT	2	8	62625	62632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_019682	AATT	2	8	63932	63939	50 %	50 %	0 %	0 %	427715413
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