MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 90526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019682	GCA	2	6	20	25	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019682	GGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019682	AAC	2	6	153	158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715355
4	NC_019682	GTA	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
5	NC_019682	TGA	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
6	NC_019682	ATC	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715355
7	NC_019682	ATC	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715355
8	NC_019682	TGG	2	6	512	517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715355
9	NC_019682	AGC	2	6	680	685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
10	NC_019682	TGT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715355
11	NC_019682	TGA	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
12	NC_019682	AAG	2	6	739	744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715355
13	NC_019682	GTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715355
14	NC_019682	GCC	2	6	1091	1096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715355
15	NC_019682	AGC	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
16	NC_019682	CGA	3	9	1188	1196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
17	NC_019682	GAA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715355
18	NC_019682	GGT	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715355
19	NC_019682	AAT	2	6	1411	1416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715355
20	NC_019682	AGC	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019682	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019682	GTG	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019682	GAT	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715356
24	NC_019682	TGG	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715356
25	NC_019682	AAC	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715356
26	NC_019682	AGC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715356
27	NC_019682	CTA	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715356
28	NC_019682	AGT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715356
29	NC_019682	GGT	4	12	2443	2454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715356
30	NC_019682	AGA	2	6	2723	2728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715356
31	NC_019682	ATA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715356
32	NC_019682	CAA	2	6	2764	2769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715356
33	NC_019682	AAT	2	6	3049	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019682	AAT	2	6	3060	3065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019682	CTC	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_019682	CAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019682	AGC	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019682	TAT	2	6	3258	3263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019682	TCT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
40	NC_019682	GTA	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
41	NC_019682	CAA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
42	NC_019682	GTT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715357
43	NC_019682	CGT	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715357
44	NC_019682	TCT	2	6	3608	3613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
45	NC_019682	CTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
46	NC_019682	TAG	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
47	NC_019682	GTA	2	6	3693	3698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
48	NC_019682	GCA	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
49	NC_019682	ATT	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715357
50	NC_019682	GTG	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
51	NC_019682	AGT	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
52	NC_019682	TAC	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715357
53	NC_019682	CAA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
54	NC_019682	TGG	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
55	NC_019682	CAA	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
56	NC_019682	GGC	2	6	4452	4457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715357
57	NC_019682	TGA	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
58	NC_019682	TGG	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
59	NC_019682	GAC	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
60	NC_019682	TGA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
61	NC_019682	ACC	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
62	NC_019682	CCA	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
63	NC_019682	AGC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
64	NC_019682	ACC	2	6	5051	5056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
65	NC_019682	GGT	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
66	NC_019682	TAT	2	6	5188	5193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715357
67	NC_019682	GAT	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019682	GGT	2	6	5738	5743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715358
69	NC_019682	TCA	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715358
70	NC_019682	AGG	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715358
71	NC_019682	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
72	NC_019682	ACA	2	6	5857	5862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715358
73	NC_019682	CGC	3	9	6082	6090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715358
74	NC_019682	GTA	2	6	6098	6103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
75	NC_019682	AAT	2	6	6107	6112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
76	NC_019682	TGC	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
77	NC_019682	ATA	2	6	6141	6146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
78	NC_019682	TCC	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715358
79	NC_019682	AGG	2	6	6168	6173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715358
80	NC_019682	TAG	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
81	NC_019682	TGC	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
82	NC_019682	CAC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715358
83	NC_019682	CAT	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715358
84	NC_019682	GTG	2	6	6702	6707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715358
85	NC_019682	ACG	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715358
86	NC_019682	TCG	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
87	NC_019682	ATA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
88	NC_019682	AAT	2	6	6971	6976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
89	NC_019682	TTC	2	6	7009	7014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715358
90	NC_019682	TCT	2	6	7082	7087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715358
91	NC_019682	GCC	2	6	7120	7125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715358
92	NC_019682	TCC	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715358
93	NC_019682	AGT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
94	NC_019682	TGA	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
95	NC_019682	ATT	2	6	7255	7260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715358
96	NC_019682	ATT	2	6	7839	7844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019682	TAC	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019682	AGT	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715359
99	NC_019682	CTG	2	6	7980	7985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715359
100	NC_019682	TAA	2	6	8017	8022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715359
101	NC_019682	ATT	2	6	8079	8084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715359
102	NC_019682	TAA	2	6	8115	8120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019682	TAA	3	9	8124	8132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019682	GAT	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715360
105	NC_019682	AGA	2	6	8283	8288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715360
106	NC_019682	ATT	2	6	8351	8356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715360
107	NC_019682	AGA	2	6	8397	8402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715360
108	NC_019682	GTC	2	6	8450	8455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715360
109	NC_019682	ACC	2	6	8505	8510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715360
110	NC_019682	ATC	2	6	8732	8737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715360
111	NC_019682	AAG	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715360
112	NC_019682	TAG	2	6	8850	8855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715360
113	NC_019682	ATG	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715360
114	NC_019682	GAT	2	6	9037	9042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715360
115	NC_019682	GTT	2	6	9044	9049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715360
116	NC_019682	GGT	2	6	9109	9114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715360
117	NC_019682	ATC	2	6	9160	9165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019682	GTA	2	6	9271	9276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715361
119	NC_019682	TGG	2	6	9314	9319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715361
120	NC_019682	ACT	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715361
121	NC_019682	AGC	2	6	9527	9532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715361
122	NC_019682	GTT	2	6	9618	9623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715361
123	NC_019682	CAG	3	9	9631	9639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715361
124	NC_019682	GCA	2	6	9794	9799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715361
125	NC_019682	GCT	2	6	9978	9983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715361
126	NC_019682	GCA	2	6	10122	10127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715361
127	NC_019682	AGT	3	9	10163	10171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715361
128	NC_019682	AGA	2	6	10379	10384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715362
129	NC_019682	ACA	2	6	10524	10529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715362
130	NC_019682	GTT	2	6	10530	10535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715362
131	NC_019682	AAC	2	6	10567	10572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715362
132	NC_019682	TTA	2	6	10661	10666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715362
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256	NC_019682	AGT	2	6	19348	19353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715369
257	NC_019682	CAT	2	6	19359	19364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715369
258	NC_019682	TGA	2	6	19378	19383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715369
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260	NC_019682	TCA	3	9	19490	19498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715369
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262	NC_019682	ACT	2	6	19655	19660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_019682	TGA	3	9	19735	19743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019682	TCT	2	6	19819	19824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_019682	TAC	2	6	19828	19833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_019682	ATA	2	6	20140	20145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019682	CTA	2	6	20212	20217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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379	NC_019682	TGG	2	6	28397	28402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715375
380	NC_019682	TCC	2	6	28464	28469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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500	NC_019682	TTA	2	6	37533	37538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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