MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 plasmid pSYN6312.01

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019681	GGCCC	2	10	2981	2990	0 %	0 %	40 %	60 %	427714752
2	NC_019681	ATGAC	2	10	6332	6341	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019681	GACCC	2	10	6518	6527	20 %	0 %	20 %	60 %	427714757
4	NC_019681	GGCCA	2	10	6996	7005	20 %	0 %	40 %	40 %	427714758
5	NC_019681	GCATG	2	10	10078	10087	20 %	20 %	40 %	20 %	427714763
6	NC_019681	GGCTG	2	10	10876	10885	0 %	20 %	60 %	20 %	427714763
7	NC_019681	GCTTG	2	10	11638	11647	0 %	40 %	40 %	20 %	427714763
8	NC_019681	GTGTG	2	10	11676	11685	0 %	40 %	60 %	0 %	427714763
9	NC_019681	CCAAT	2	10	11709	11718	40 %	20 %	0 %	40 %	427714763
10	NC_019681	TTTTC	2	10	12122	12131	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019681	ATTTG	2	10	13472	13481	20 %	60 %	20 %	0 %	427714766
12	NC_019681	AGCAA	2	10	15726	15735	60 %	0 %	20 %	20 %	427714771
13	NC_019681	GCCTG	2	10	15927	15936	0 %	20 %	40 %	40 %	427714771
14	NC_019681	TTTGG	2	10	17123	17132	0 %	60 %	40 %	0 %	427714773
15	NC_019681	CAGGC	2	10	18247	18256	20 %	0 %	40 %	40 %	427714774
16	NC_019681	GAACT	2	10	19546	19555	40 %	20 %	20 %	20 %	427714774
17	NC_019681	TTTGT	2	10	22724	22733	0 %	80 %	20 %	0 %	427714776
18	NC_019681	CCGTT	2	10	23127	23136	0 %	40 %	20 %	40 %	427714777

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.