MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 plasmid pSYN6312.01

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019681	ATTG	2	8	178	185	25 %	50 %	25 %	0 %	427714746
2	NC_019681	TCAA	2	8	400	407	50 %	25 %	0 %	25 %	427714746
3	NC_019681	ATTT	2	8	687	694	25 %	75 %	0 %	0 %	427714747
4	NC_019681	AATT	2	8	1601	1608	50 %	50 %	0 %	0 %	427714748
5	NC_019681	ATCA	2	8	1659	1666	50 %	25 %	0 %	25 %	427714748
6	NC_019681	CAAC	2	8	1965	1972	50 %	0 %	0 %	50 %	427714749
7	NC_019681	CTTT	2	8	1975	1982	0 %	75 %	0 %	25 %	427714749
8	NC_019681	TGGA	2	8	2089	2096	25 %	25 %	50 %	0 %	427714749
9	NC_019681	CAGT	2	8	2353	2360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019681	GAAA	2	8	2739	2746	75 %	0 %	25 %	0 %	427714751
11	NC_019681	TCAA	2	8	2869	2876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019681	ATTT	2	8	3262	3269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019681	CGGG	2	8	3585	3592	0 %	0 %	75 %	25 %	427714754
14	NC_019681	CGAC	2	8	3807	3814	25 %	0 %	25 %	50 %	427714754
15	NC_019681	TGAG	2	8	4084	4091	25 %	25 %	50 %	0 %	427714754
16	NC_019681	TCAC	2	8	4395	4402	25 %	25 %	0 %	50 %	427714754
17	NC_019681	CCAG	2	8	4556	4563	25 %	0 %	25 %	50 %	427714754
18	NC_019681	TTTC	2	8	4936	4943	0 %	75 %	0 %	25 %	427714754
19	NC_019681	CAAA	2	8	5544	5551	75 %	0 %	0 %	25 %	427714755
20	NC_019681	GTCA	2	8	5733	5740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019681	AGCC	2	8	5905	5912	25 %	0 %	25 %	50 %	427714756
22	NC_019681	CCCA	2	8	6494	6501	25 %	0 %	0 %	75 %	427714757
23	NC_019681	GTCT	2	8	7080	7087	0 %	50 %	25 %	25 %	427714758
24	NC_019681	ATCC	2	8	7224	7231	25 %	25 %	0 %	50 %	427714758
25	NC_019681	CGGG	2	8	7356	7363	0 %	0 %	75 %	25 %	427714758
26	NC_019681	GATT	2	8	8394	8401	25 %	50 %	25 %	0 %	427714760
27	NC_019681	TTTC	2	8	8477	8484	0 %	75 %	0 %	25 %	427714760
28	NC_019681	CTGC	2	8	8487	8494	0 %	25 %	25 %	50 %	427714760
29	NC_019681	GGGA	2	8	8671	8678	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019681	TGTC	2	8	8897	8904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019681	AACT	2	8	9178	9185	50 %	25 %	0 %	25 %	427714761
32	NC_019681	CTTT	2	8	9296	9303	0 %	75 %	0 %	25 %	427714761
33	NC_019681	TTCT	2	8	9391	9398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019681	CGGG	2	8	10343	10350	0 %	0 %	75 %	25 %	427714763
35	NC_019681	CCGG	2	8	10695	10702	0 %	0 %	50 %	50 %	427714763
36	NC_019681	ACTG	2	8	11287	11294	25 %	25 %	25 %	25 %	427714763
37	NC_019681	CTGG	2	8	11426	11433	0 %	25 %	50 %	25 %	427714763
38	NC_019681	TTGG	2	8	12421	12428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019681	TGGA	2	8	12598	12605	25 %	25 %	50 %	0 %	427714765
40	NC_019681	CAAT	2	8	12810	12817	50 %	25 %	0 %	25 %	427714765
41	NC_019681	CAAT	2	8	13224	13231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019681	ATTG	2	8	13617	13624	25 %	50 %	25 %	0 %	427714767
43	NC_019681	CTCA	2	8	13785	13792	25 %	25 %	0 %	50 %	427714767
44	NC_019681	TTGA	2	8	13930	13937	25 %	50 %	25 %	0 %	427714767
45	NC_019681	AACA	2	8	15232	15239	75 %	0 %	0 %	25 %	427714770
46	NC_019681	ATTG	2	8	15548	15555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019681	TGGA	2	8	16145	16152	25 %	25 %	50 %	0 %	427714772
48	NC_019681	GTTT	2	8	16702	16709	0 %	75 %	25 %	0 %	427714772
49	NC_019681	GAAA	2	8	16781	16788	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019681	AATT	2	8	17833	17840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019681	ATTT	2	8	18226	18233	25 %	75 %	0 %	0 %	427714774
52	NC_019681	GCAA	2	8	19165	19172	50 %	0 %	25 %	25 %	427714774
53	NC_019681	TTGA	2	8	19854	19861	25 %	50 %	25 %	0 %	427714774
54	NC_019681	CCAA	2	8	19886	19893	50 %	0 %	0 %	50 %	427714774
55	NC_019681	TCAA	2	8	20217	20224	50 %	25 %	0 %	25 %	427714774
56	NC_019681	ATTG	2	8	20516	20523	25 %	50 %	25 %	0 %	427714774
57	NC_019681	CAAT	2	8	20896	20903	50 %	25 %	0 %	25 %	427714774
58	NC_019681	ACTT	2	8	21210	21217	25 %	50 %	0 %	25 %	427714774
59	NC_019681	GTTT	2	8	21956	21963	0 %	75 %	25 %	0 %	427714775
60	NC_019681	TGGA	2	8	22035	22042	25 %	25 %	50 %	0 %	427714775
61	NC_019681	TGCT	2	8	22953	22960	0 %	50 %	25 %	25 %	427714777
62	NC_019681	GTCC	2	8	23204	23211	0 %	25 %	25 %	50 %	427714777

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.