MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 2474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019680	GTTGG	2	10	2298	2307	0 %	40 %	60 %	0 %	427711181
2	NC_019680	CACAA	2	10	2391	2400	60 %	0 %	0 %	40 %	427711181
3	NC_019680	ACGGA	2	10	2557	2566	40 %	0 %	40 %	20 %	427711181
4	NC_019680	GTTTG	2	10	5190	5199	0 %	60 %	40 %	0 %	427711183
5	NC_019680	ATTGG	2	10	6715	6724	20 %	40 %	40 %	0 %	427711185
6	NC_019680	TTGCC	2	10	8091	8100	0 %	40 %	20 %	40 %	427711187
7	NC_019680	TGACC	2	10	9892	9901	20 %	20 %	20 %	40 %	427711190
8	NC_019680	CCTGG	2	10	10274	10283	0 %	20 %	40 %	40 %	427711190
9	NC_019680	GCAAG	2	10	12042	12051	40 %	0 %	40 %	20 %	427711191
10	NC_019680	TTTTG	2	10	13552	13561	0 %	80 %	20 %	0 %	427711191
11	NC_019680	GGCCT	2	10	14392	14401	0 %	20 %	40 %	40 %	427711192
12	NC_019680	CCTGG	2	10	14948	14957	0 %	20 %	40 %	40 %	427711194
13	NC_019680	TCAAA	2	10	15687	15696	60 %	20 %	0 %	20 %	427711196
14	NC_019680	CATGA	2	10	18457	18466	40 %	20 %	20 %	20 %	427711198
15	NC_019680	CCAAA	2	10	19949	19958	60 %	0 %	0 %	40 %	427711199
16	NC_019680	AGGCA	2	10	20710	20719	40 %	0 %	40 %	20 %	427711199
17	NC_019680	CGGGG	2	10	21815	21824	0 %	0 %	80 %	20 %	427711200
18	NC_019680	AATCC	2	10	23562	23571	40 %	20 %	0 %	40 %	427711200
19	NC_019680	GACTC	2	10	23707	23716	20 %	20 %	20 %	40 %	427711200
20	NC_019680	TTTGA	2	10	23879	23888	20 %	60 %	20 %	0 %	427711200
21	NC_019680	AACAG	2	10	24000	24009	60 %	0 %	20 %	20 %	427711200
22	NC_019680	AATCA	2	10	24725	24734	60 %	20 %	0 %	20 %	427711201
23	NC_019680	GCCAG	2	10	24868	24877	20 %	0 %	40 %	40 %	427711201
24	NC_019680	CACGC	2	10	25112	25121	20 %	0 %	20 %	60 %	427711201
25	NC_019680	CCCGC	2	10	26326	26335	0 %	0 %	20 %	80 %	427711201
26	NC_019680	GGAAT	2	10	30120	30129	40 %	20 %	40 %	0 %	427711202
27	NC_019680	TCCAG	2	10	31300	31309	20 %	20 %	20 %	40 %	427711202
28	NC_019680	CAACG	2	10	32833	32842	40 %	0 %	20 %	40 %	427711204
29	NC_019680	GCCCG	2	10	33370	33379	0 %	0 %	40 %	60 %	427711205
30	NC_019680	GTGGA	2	10	33446	33455	20 %	20 %	60 %	0 %	427711205
31	NC_019680	GGCCA	2	10	37159	37168	20 %	0 %	40 %	40 %	427711210
32	NC_019680	TGGCC	2	10	38719	38728	0 %	20 %	40 %	40 %	427711211
33	NC_019680	CCCGT	2	10	39304	39313	0 %	20 %	20 %	60 %	427711211
34	NC_019680	GGCCA	2	10	42566	42575	20 %	0 %	40 %	40 %	427711214
35	NC_019680	CGCAC	2	10	42819	42828	20 %	0 %	20 %	60 %	427711215
36	NC_019680	GGGAG	2	10	45782	45791	20 %	0 %	80 %	0 %	427711219
37	NC_019680	TTGCG	2	10	46173	46182	0 %	40 %	40 %	20 %	427711219
38	NC_019680	GGCCT	2	10	48215	48224	0 %	20 %	40 %	40 %	427711222
39	NC_019680	CAGGC	2	10	49910	49919	20 %	0 %	40 %	40 %	427711224
40	NC_019680	ACTGT	2	10	50076	50085	20 %	40 %	20 %	20 %	427711225
41	NC_019680	CAGGC	2	10	51234	51243	20 %	0 %	40 %	40 %	427711225
42	NC_019680	GTTAA	2	10	51805	51814	40 %	40 %	20 %	0 %	427711226
43	NC_019680	AGGCC	2	10	52712	52721	20 %	0 %	40 %	40 %	427711226
44	NC_019680	AGTCA	2	10	54607	54616	40 %	20 %	20 %	20 %	427711227
45	NC_019680	GGCCA	2	10	58405	58414	20 %	0 %	40 %	40 %	427711231
46	NC_019680	CCCGA	2	10	58543	58552	20 %	0 %	20 %	60 %	427711231
47	NC_019680	CCAGG	2	10	59052	59061	20 %	0 %	40 %	40 %	427711231
48	NC_019680	ATCCG	2	10	59689	59698	20 %	20 %	20 %	40 %	427711232
49	NC_019680	CAGGC	2	10	60214	60223	20 %	0 %	40 %	40 %	427711232
50	NC_019680	GGTCA	2	10	61085	61094	20 %	20 %	40 %	20 %	427711233
51	NC_019680	AAATT	2	10	62950	62959	60 %	40 %	0 %	0 %	427711234
52	NC_019680	CCTGG	2	10	64939	64948	0 %	20 %	40 %	40 %	427711235
53	NC_019680	GGCCG	2	10	66981	66990	0 %	0 %	60 %	40 %	427711237
54	NC_019680	ACTGA	2	10	69184	69193	40 %	20 %	20 %	20 %	427711238
55	NC_019680	GCCGA	2	10	70198	70207	20 %	0 %	40 %	40 %	427711238
56	NC_019680	GCCCC	2	10	70930	70939	0 %	0 %	20 %	80 %	427711238
57	NC_019680	CCAGG	2	10	71363	71372	20 %	0 %	40 %	40 %	427711239
58	NC_019680	GCCCC	2	10	72590	72599	0 %	0 %	20 %	80 %	427711240
59	NC_019680	GATCG	2	10	76195	76204	20 %	20 %	40 %	20 %	427711240
60	NC_019680	ACCAG	2	10	76237	76246	40 %	0 %	20 %	40 %	427711240
61	NC_019680	TGAGT	2	10	76659	76668	20 %	40 %	40 %	0 %	427711240
62	NC_019680	CTGTA	2	10	77613	77622	20 %	40 %	20 %	20 %	427711240
63	NC_019680	GGCCT	2	10	78685	78694	0 %	20 %	40 %	40 %	427711240
64	NC_019680	GATCA	2	10	79240	79249	40 %	20 %	20 %	20 %	427711240
65	NC_019680	CGTTG	2	10	80886	80895	0 %	40 %	40 %	20 %	427711240
66	NC_019680	CCTGG	2	10	81051	81060	0 %	20 %	40 %	40 %	427711240
67	NC_019680	GAGGC	2	10	82580	82589	20 %	0 %	60 %	20 %	427711240
68	NC_019680	GGGGA	2	10	83194	83203	20 %	0 %	80 %	0 %	427711240
69	NC_019680	GCTTT	2	10	83520	83529	0 %	60 %	20 %	20 %	427711240
70	NC_019680	GCCAA	2	10	83549	83558	40 %	0 %	20 %	40 %	427711240
71	NC_019680	CCAGG	2	10	86986	86995	20 %	0 %	40 %	40 %	427711243
72	NC_019680	TGGCC	2	10	87751	87760	0 %	20 %	40 %	40 %	427711244
73	NC_019680	GGCCT	2	10	87960	87969	0 %	20 %	40 %	40 %	427711244
74	NC_019680	TTGGG	2	10	89383	89392	0 %	40 %	60 %	0 %	427711246
75	NC_019680	GATTT	2	10	92220	92229	20 %	60 %	20 %	0 %	427711249
76	NC_019680	GCCAG	2	10	92580	92589	20 %	0 %	40 %	40 %	427711249
77	NC_019680	ATTAC	2	10	93190	93199	40 %	40 %	0 %	20 %	427711251
78	NC_019680	GCCTG	2	10	94111	94120	0 %	20 %	40 %	40 %	427711251
79	NC_019680	TGGGT	2	10	96055	96064	0 %	40 %	60 %	0 %	427711253
80	NC_019680	AGCTT	2	10	96105	96114	20 %	40 %	20 %	20 %	427711253
81	NC_019680	CAAAA	2	10	96806	96815	80 %	0 %	0 %	20 %	427711254
82	NC_019680	AAACT	2	10	97696	97705	60 %	20 %	0 %	20 %	427711256
83	NC_019680	ATCGG	2	10	98993	99002	20 %	20 %	40 %	20 %	427711257
84	NC_019680	CCCGA	2	10	100702	100711	20 %	0 %	20 %	60 %	427711259
85	NC_019680	TCACC	2	10	102059	102068	20 %	20 %	0 %	60 %	427711260
86	NC_019680	AAGGC	2	10	102826	102835	40 %	0 %	40 %	20 %	427711260
87	NC_019680	AAAAG	2	10	102931	102940	80 %	0 %	20 %	0 %	427711261
88	NC_019680	CAGTC	2	10	102978	102987	20 %	20 %	20 %	40 %	427711261
89	NC_019680	GTTCC	2	10	109315	109324	0 %	40 %	20 %	40 %	427711267
90	NC_019680	AGTTT	2	10	109755	109764	20 %	60 %	20 %	0 %	427711267
91	NC_019680	GCCAG	2	10	110570	110579	20 %	0 %	40 %	40 %	427711269
92	NC_019680	GCCAG	2	10	111218	111227	20 %	0 %	40 %	40 %	427711269
93	NC_019680	CATCC	2	10	113704	113713	20 %	20 %	0 %	60 %	427711273
94	NC_019680	GAAAA	2	10	114149	114158	80 %	0 %	20 %	0 %	427711273
95	NC_019680	TTTGT	2	10	115185	115194	0 %	80 %	20 %	0 %	427711275
96	NC_019680	CCAAG	2	10	116074	116083	40 %	0 %	20 %	40 %	427711276
97	NC_019680	GGGCG	2	10	116417	116426	0 %	0 %	80 %	20 %	427711276
98	NC_019680	TCAAA	2	10	119225	119234	60 %	20 %	0 %	20 %	427711281
99	NC_019680	ATCCG	2	10	120469	120478	20 %	20 %	20 %	40 %	427711282
100	NC_019680	GACCC	2	10	122176	122185	20 %	0 %	20 %	60 %	427711284
101	NC_019680	CTGGG	2	10	124681	124690	0 %	20 %	60 %	20 %	427711286
102	NC_019680	CTGGC	2	10	124859	124868	0 %	20 %	40 %	40 %	427711287
103	NC_019680	TGGCC	2	10	127016	127025	0 %	20 %	40 %	40 %	427711291
104	NC_019680	CCAGT	2	10	128442	128451	20 %	20 %	20 %	40 %	427711292
105	NC_019680	TTTAA	2	10	128911	128920	40 %	60 %	0 %	0 %	427711292
106	NC_019680	CCTGG	2	10	130273	130282	0 %	20 %	40 %	40 %	427711294
107	NC_019680	CCTGG	2	10	130595	130604	0 %	20 %	40 %	40 %	427711294
108	NC_019680	GTAAG	2	10	131285	131294	40 %	20 %	40 %	0 %	427711295
109	NC_019680	AGCCA	2	10	131671	131680	40 %	0 %	20 %	40 %	427711295
110	NC_019680	GCCCG	2	10	132031	132040	0 %	0 %	40 %	60 %	427711296
111	NC_019680	ACTGG	2	10	132606	132615	20 %	20 %	40 %	20 %	427711296
112	NC_019680	CCCCT	2	10	134477	134486	0 %	20 %	0 %	80 %	427711298
113	NC_019680	CCTGG	2	10	136435	136444	0 %	20 %	40 %	40 %	427711300
114	NC_019680	TGGTT	2	10	138474	138483	0 %	60 %	40 %	0 %	427711303
115	NC_019680	GCCCC	2	10	139327	139336	0 %	0 %	20 %	80 %	427711303
116	NC_019680	GCCGG	2	10	139955	139964	0 %	0 %	60 %	40 %	427711303
117	NC_019680	TCCAT	2	10	140171	140180	20 %	40 %	0 %	40 %	427711303
118	NC_019680	CAGGC	2	10	140359	140368	20 %	0 %	40 %	40 %	427711303
119	NC_019680	CTGGC	2	10	141357	141366	0 %	20 %	40 %	40 %	427711305
120	NC_019680	GGTTG	2	10	141422	141431	0 %	40 %	60 %	0 %	427711305
121	NC_019680	CTTGC	2	10	141476	141485	0 %	40 %	20 %	40 %	427711305
122	NC_019680	CCTGG	2	10	141530	141539	0 %	20 %	40 %	40 %	427711305
123	NC_019680	TTCTT	2	10	143607	143616	0 %	80 %	0 %	20 %	427711306
124	NC_019680	TTGTC	2	10	147841	147850	0 %	60 %	20 %	20 %	427711308
125	NC_019680	GAATT	2	10	148977	148986	40 %	40 %	20 %	0 %	427711310
126	NC_019680	CTGGC	2	10	149416	149425	0 %	20 %	40 %	40 %	427711311
127	NC_019680	CATGT	2	10	152441	152450	20 %	40 %	20 %	20 %	427711314
128	NC_019680	TCGCC	2	10	156817	156826	0 %	20 %	20 %	60 %	427711319
129	NC_019680	ATCCA	2	10	157229	157238	40 %	20 %	0 %	40 %	427711319
130	NC_019680	CCCCA	2	10	160338	160347	20 %	0 %	0 %	80 %	427711324
131	NC_019680	TCCAA	2	10	160487	160496	40 %	20 %	0 %	40 %	427711324
132	NC_019680	AACTT	2	10	160733	160742	40 %	40 %	0 %	20 %	427711324
133	NC_019680	CTTGG	2	10	162482	162491	0 %	40 %	40 %	20 %	427711325
134	NC_019680	GGTGT	2	10	163391	163400	0 %	40 %	60 %	0 %	427711327
135	NC_019680	TGCAA	2	10	164764	164773	40 %	20 %	20 %	20 %	427711328
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