MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 7280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019680	AATC	2	8	439	446	50 %	25 %	0 %	25 %	427711180
2	NC_019680	ACTT	2	8	2290	2297	25 %	50 %	0 %	25 %	427711181
3	NC_019680	AATC	2	8	2462	2469	50 %	25 %	0 %	25 %	427711181
4	NC_019680	GGTA	2	8	2510	2517	25 %	25 %	50 %	0 %	427711181
5	NC_019680	AGGG	2	8	3885	3892	25 %	0 %	75 %	0 %	427711182
6	NC_019680	TTTG	2	8	4108	4115	0 %	75 %	25 %	0 %	427711182
7	NC_019680	AACC	2	8	4422	4429	50 %	0 %	0 %	50 %	427711182
8	NC_019680	AAAT	2	8	4602	4609	75 %	25 %	0 %	0 %	427711183
9	NC_019680	GTTT	2	8	5276	5283	0 %	75 %	25 %	0 %	427711183
10	NC_019680	ATTA	2	8	6506	6513	50 %	50 %	0 %	0 %	427711185
11	NC_019680	CACC	2	8	6772	6779	25 %	0 %	0 %	75 %	427711185
12	NC_019680	TGGG	2	8	6869	6876	0 %	25 %	75 %	0 %	427711185
13	NC_019680	AAGT	2	8	6894	6901	50 %	25 %	25 %	0 %	427711185
14	NC_019680	TGAT	2	8	8067	8074	25 %	50 %	25 %	0 %	427711187
15	NC_019680	TGTC	2	8	9083	9090	0 %	50 %	25 %	25 %	427711189
16	NC_019680	CGGT	2	8	9673	9680	0 %	25 %	50 %	25 %	427711189
17	NC_019680	ACTT	2	8	9787	9794	25 %	50 %	0 %	25 %	427711190
18	NC_019680	GTAG	2	8	10007	10014	25 %	25 %	50 %	0 %	427711190
19	NC_019680	CGGG	2	8	11193	11200	0 %	0 %	75 %	25 %	427711191
20	NC_019680	GGAA	2	8	11261	11268	50 %	0 %	50 %	0 %	427711191
21	NC_019680	CAAG	2	8	11562	11569	50 %	0 %	25 %	25 %	427711191
22	NC_019680	CAAG	2	8	12180	12187	50 %	0 %	25 %	25 %	427711191
23	NC_019680	TGAT	2	8	12260	12267	25 %	50 %	25 %	0 %	427711191
24	NC_019680	TGAA	2	8	12335	12342	50 %	25 %	25 %	0 %	427711191
25	NC_019680	TAAA	2	8	12440	12447	75 %	25 %	0 %	0 %	427711191
26	NC_019680	TTTG	2	8	12450	12457	0 %	75 %	25 %	0 %	427711191
27	NC_019680	ACTT	2	8	12538	12545	25 %	50 %	0 %	25 %	427711191
28	NC_019680	CTTA	2	8	13304	13311	25 %	50 %	0 %	25 %	427711191
29	NC_019680	ATTT	2	8	13499	13506	25 %	75 %	0 %	0 %	427711191
30	NC_019680	CAAA	2	8	13800	13807	75 %	0 %	0 %	25 %	427711191
31	NC_019680	GCCA	2	8	13813	13820	25 %	0 %	25 %	50 %	427711191
32	NC_019680	CCCA	2	8	14121	14128	25 %	0 %	0 %	75 %	427711191
33	NC_019680	TGAT	2	8	15154	15161	25 %	50 %	25 %	0 %	427711194
34	NC_019680	ACCC	2	8	15546	15553	25 %	0 %	0 %	75 %	427711195
35	NC_019680	ATCA	2	8	16836	16843	50 %	25 %	0 %	25 %	427711197
36	NC_019680	CCAA	2	8	17272	17279	50 %	0 %	0 %	50 %	427711198
37	NC_019680	AGCC	2	8	18468	18475	25 %	0 %	25 %	50 %	427711198
38	NC_019680	AATA	2	8	18500	18507	75 %	25 %	0 %	0 %	427711198
39	NC_019680	GCCA	2	8	19759	19766	25 %	0 %	25 %	50 %	427711199
40	NC_019680	ACCC	2	8	19963	19970	25 %	0 %	0 %	75 %	427711199
41	NC_019680	TAAA	2	8	20162	20169	75 %	25 %	0 %	0 %	427711199
42	NC_019680	AGCC	2	8	20742	20749	25 %	0 %	25 %	50 %	427711199
43	NC_019680	AAGT	2	8	21468	21475	50 %	25 %	25 %	0 %	427711200
44	NC_019680	GTTC	2	8	21917	21924	0 %	50 %	25 %	25 %	427711200
45	NC_019680	TCAA	2	8	22750	22757	50 %	25 %	0 %	25 %	427711200
46	NC_019680	CATC	2	8	22919	22926	25 %	25 %	0 %	50 %	427711200
47	NC_019680	GCCC	2	8	22939	22946	0 %	0 %	25 %	75 %	427711200
48	NC_019680	TCAT	2	8	23674	23681	25 %	50 %	0 %	25 %	427711200
49	NC_019680	TTGA	2	8	24012	24019	25 %	50 %	25 %	0 %	427711200
50	NC_019680	CCAT	2	8	24318	24325	25 %	25 %	0 %	50 %	427711201
51	NC_019680	AACT	2	8	24578	24585	50 %	25 %	0 %	25 %	427711201
52	NC_019680	CTCA	2	8	24893	24900	25 %	25 %	0 %	50 %	427711201
53	NC_019680	AATC	2	8	25261	25268	50 %	25 %	0 %	25 %	427711201
54	NC_019680	GATA	2	8	25390	25397	50 %	25 %	25 %	0 %	427711201
55	NC_019680	GCTT	2	8	25488	25495	0 %	50 %	25 %	25 %	427711201
56	NC_019680	CCGG	2	8	26579	26586	0 %	0 %	50 %	50 %	427711201
57	NC_019680	ATCA	2	8	26702	26709	50 %	25 %	0 %	25 %	427711201
58	NC_019680	AGCC	2	8	26719	26726	25 %	0 %	25 %	50 %	427711201
59	NC_019680	CACG	2	8	26815	26822	25 %	0 %	25 %	50 %	427711201
60	NC_019680	ATCA	2	8	26996	27003	50 %	25 %	0 %	25 %	427711201
61	NC_019680	GCGA	2	8	28775	28782	25 %	0 %	50 %	25 %	427711202
62	NC_019680	CCAA	2	8	29424	29431	50 %	0 %	0 %	50 %	427711202
63	NC_019680	GCTG	2	8	29595	29602	0 %	25 %	50 %	25 %	427711202
64	NC_019680	TCAT	2	8	29739	29746	25 %	50 %	0 %	25 %	427711202
65	NC_019680	AGGG	2	8	29777	29784	25 %	0 %	75 %	0 %	427711202
66	NC_019680	TGGC	2	8	30547	30554	0 %	25 %	50 %	25 %	427711202
67	NC_019680	CAAA	2	8	31087	31094	75 %	0 %	0 %	25 %	427711202
68	NC_019680	AATT	2	8	31627	31634	50 %	50 %	0 %	0 %	427711202
69	NC_019680	GGCA	2	8	32417	32424	25 %	0 %	50 %	25 %	427711203
70	NC_019680	AATT	2	8	32587	32594	50 %	50 %	0 %	0 %	427711204
71	NC_019680	CACC	2	8	33394	33401	25 %	0 %	0 %	75 %	427711205
72	NC_019680	TCCG	2	8	33723	33730	0 %	25 %	25 %	50 %	427711205
73	NC_019680	GAGG	2	8	34016	34023	25 %	0 %	75 %	0 %	427711205
74	NC_019680	GAAC	2	8	34147	34154	50 %	0 %	25 %	25 %	427711206
75	NC_019680	AGAA	2	8	34181	34188	75 %	0 %	25 %	0 %	427711206
76	NC_019680	AGGC	2	8	34960	34967	25 %	0 %	50 %	25 %	427711208
77	NC_019680	GGCC	2	8	36429	36436	0 %	0 %	50 %	50 %	427711210
78	NC_019680	ATTT	2	8	37150	37157	25 %	75 %	0 %	0 %	427711210
79	NC_019680	GTGG	2	8	38729	38736	0 %	25 %	75 %	0 %	427711211
80	NC_019680	CCGG	2	8	38764	38771	0 %	0 %	50 %	50 %	427711211
81	NC_019680	GTTT	2	8	38807	38814	0 %	75 %	25 %	0 %	427711211
82	NC_019680	CCGG	2	8	39131	39138	0 %	0 %	50 %	50 %	427711211
83	NC_019680	ATAC	2	8	39656	39663	50 %	25 %	0 %	25 %	427711212
84	NC_019680	TTGA	2	8	39780	39787	25 %	50 %	25 %	0 %	427711212
85	NC_019680	GCCC	2	8	39846	39853	0 %	0 %	25 %	75 %	427711212
86	NC_019680	ATCC	2	8	40238	40245	25 %	25 %	0 %	50 %	427711212
87	NC_019680	AACT	2	8	40499	40506	50 %	25 %	0 %	25 %	427711212
88	NC_019680	TGGC	2	8	40781	40788	0 %	25 %	50 %	25 %	427711213
89	NC_019680	ACTC	2	8	41083	41090	25 %	25 %	0 %	50 %	427711213
90	NC_019680	TTGA	2	8	41137	41144	25 %	50 %	25 %	0 %	427711213
91	NC_019680	GGCT	2	8	41784	41791	0 %	25 %	50 %	25 %	427711213
92	NC_019680	AATG	2	8	41815	41822	50 %	25 %	25 %	0 %	427711213
93	NC_019680	AGGA	2	8	42279	42286	50 %	0 %	50 %	0 %	427711214
94	NC_019680	CTAG	2	8	42671	42678	25 %	25 %	25 %	25 %	427711215
95	NC_019680	TTGG	2	8	42790	42797	0 %	50 %	50 %	0 %	427711215
96	NC_019680	TGCC	2	8	43099	43106	0 %	25 %	25 %	50 %	427711215
97	NC_019680	GAGG	2	8	43729	43736	25 %	0 %	75 %	0 %	427711216
98	NC_019680	TTTC	2	8	43782	43789	0 %	75 %	0 %	25 %	427711216
99	NC_019680	CAAC	2	8	43873	43880	50 %	0 %	0 %	50 %	427711216
100	NC_019680	TCAG	2	8	43958	43965	25 %	25 %	25 %	25 %	427711216
101	NC_019680	ATTT	2	8	44863	44870	25 %	75 %	0 %	0 %	427711217
102	NC_019680	CACC	2	8	44953	44960	25 %	0 %	0 %	75 %	427711217
103	NC_019680	CCGG	2	8	45239	45246	0 %	0 %	50 %	50 %	427711217
104	NC_019680	TGGT	2	8	45992	45999	0 %	50 %	50 %	0 %	427711219
105	NC_019680	GGCG	2	8	46135	46142	0 %	0 %	75 %	25 %	427711219
106	NC_019680	GGCT	2	8	46402	46409	0 %	25 %	50 %	25 %	427711219
107	NC_019680	AGCG	2	8	49314	49321	25 %	0 %	50 %	25 %	427711224
108	NC_019680	TTCC	2	8	49479	49486	0 %	50 %	0 %	50 %	427711224
109	NC_019680	CCAT	2	8	49733	49740	25 %	25 %	0 %	50 %	427711224
110	NC_019680	AACA	2	8	50147	50154	75 %	0 %	0 %	25 %	427711225
111	NC_019680	CATA	2	8	51186	51193	50 %	25 %	0 %	25 %	427711225
112	NC_019680	ATCA	2	8	51424	51431	50 %	25 %	0 %	25 %	427711225
113	NC_019680	AGTC	2	8	51549	51556	25 %	25 %	25 %	25 %	427711225
114	NC_019680	GCCC	2	8	51748	51755	0 %	0 %	25 %	75 %	427711226
115	NC_019680	GGCG	2	8	51854	51861	0 %	0 %	75 %	25 %	427711226
116	NC_019680	CCCA	2	8	52038	52045	25 %	0 %	0 %	75 %	427711226
117	NC_019680	TCGC	2	8	53040	53047	0 %	25 %	25 %	50 %	427711226
118	NC_019680	AAAC	2	8	53280	53287	75 %	0 %	0 %	25 %	427711226
119	NC_019680	CAAT	2	8	53449	53456	50 %	25 %	0 %	25 %	427711226
120	NC_019680	GTCA	2	8	55602	55609	25 %	25 %	25 %	25 %	427711228
121	NC_019680	GTGA	2	8	55758	55765	25 %	25 %	50 %	0 %	427711229
122	NC_019680	CAAG	2	8	55940	55947	50 %	0 %	25 %	25 %	427711229
123	NC_019680	TCGA	2	8	56922	56929	25 %	25 %	25 %	25 %	427711230
124	NC_019680	TCAC	2	8	57167	57174	25 %	25 %	0 %	50 %	427711231
125	NC_019680	AAAC	2	8	57374	57381	75 %	0 %	0 %	25 %	427711231
126	NC_019680	GGAT	2	8	57480	57487	25 %	25 %	50 %	0 %	427711231
127	NC_019680	ACCA	2	8	57603	57610	50 %	0 %	0 %	50 %	427711231
128	NC_019680	CCGA	2	8	58460	58467	25 %	0 %	25 %	50 %	427711231
129	NC_019680	TGAC	2	8	59680	59687	25 %	25 %	25 %	25 %	427711232
130	NC_019680	ACCA	2	8	59719	59726	50 %	0 %	0 %	50 %	427711232
131	NC_019680	TCAT	2	8	59776	59783	25 %	50 %	0 %	25 %	427711232
132	NC_019680	TGGG	2	8	60965	60972	0 %	25 %	75 %	0 %	427711233
133	NC_019680	CTTG	2	8	61306	61313	0 %	50 %	25 %	25 %	427711233
134	NC_019680	TTGA	2	8	61496	61503	25 %	50 %	25 %	0 %	427711233
135	NC_019680	TGAT	2	8	61956	61963	25 %	50 %	25 %	0 %	427711233
136	NC_019680	AGCC	2	8	62236	62243	25 %	0 %	25 %	50 %	427711233
137	NC_019680	AATT	2	8	62722	62729	50 %	50 %	0 %	0 %	427711233
138	NC_019680	GCGG	2	8	63115	63122	0 %	0 %	75 %	25 %	427711234
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