MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 5404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019680	TGA	2	6	6	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019680	ATT	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019680	CTA	4	12	1766	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019680	AAG	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019680	TAG	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019680	GTA	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019680	CTG	2	6	1966	1971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019680	TTG	2	6	2016	2021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019680	TGA	2	6	3045	3050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019680	TCA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019680	TGG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019680	GAG	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019680	TAT	2	6	3286	3291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019680	CAC	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_019680	ATC	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019680	ATG	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019680	CAC	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019680	AAC	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019680	GAT	2	6	7881	7886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019680	TCT	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019680	ATT	2	6	9730	9735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019680	CTG	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019680	CTA	2	6	10578	10583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019680	AGT	2	6	10639	10644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019680	AAT	2	6	10720	10725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019680	GAT	2	6	10829	10834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019680	AGA	2	6	14609	14614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019680	CCT	2	6	15274	15279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019680	AAT	2	6	15395	15400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019680	TAA	2	6	15895	15900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019680	CAG	2	6	15901	15906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019680	TGA	2	6	15922	15927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019680	TCA	2	6	15968	15973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019680	TTC	2	6	16027	16032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019680	ATC	2	6	16110	16115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019680	AAT	2	6	16189	16194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019680	TCA	2	6	16196	16201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019680	ATT	2	6	16214	16219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019680	CAT	2	6	16332	16337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019680	GAA	2	6	21048	21053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019680	CTG	2	6	21121	21126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019680	AAT	2	6	21144	21149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019680	ATT	2	6	21370	21375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019680	CTT	2	6	21407	21412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019680	ATG	3	9	32958	32966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019680	GAA	2	6	33063	33068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019680	CTG	3	9	33275	33283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019680	TCT	2	6	34050	34055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019680	AAC	2	6	34071	34076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019680	CTA	2	6	35554	35559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019680	TGG	2	6	35630	35635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019680	ATT	2	6	35875	35880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019680	TTG	2	6	35886	35891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019680	GTT	2	6	35907	35912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019680	CCT	2	6	37764	37769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019680	CAA	2	6	37866	37871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019680	TGC	2	6	37875	37880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019680	GAT	2	6	38023	38028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019680	AGA	2	6	38207	38212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019680	AGC	2	6	38354	38359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019680	CTC	2	6	38421	38426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_019680	ATC	2	6	38452	38457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019680	ATT	2	6	38478	38483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019680	TTA	2	6	40661	40666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019680	CAG	2	6	41883	41888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019680	TGA	2	6	41896	41901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019680	GGA	2	6	44273	44278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019680	CAG	2	6	45646	45651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019680	CCA	2	6	46987	46992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019680	ATG	2	6	47049	47054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019680	TCA	2	6	49059	49064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019680	ATT	2	6	49073	49078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019680	ATC	2	6	49270	49275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019680	GGT	2	6	49276	49281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019680	TGC	2	6	51613	51618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019680	TAA	2	6	51671	51676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019680	ATT	2	6	53688	53693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019680	ATT	2	6	53805	53810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019680	ATT	2	6	55721	55726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019680	GAA	2	6	59276	59281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019680	TCC	2	6	59295	59300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019680	CGA	2	6	59364	59369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019680	TCA	2	6	59462	59467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019680	GTC	2	6	60415	60420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019680	GCC	2	6	60560	60565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019680	CAT	2	6	63820	63825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019680	AAG	2	6	63918	63923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019680	CTG	2	6	63961	63966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019680	TAA	2	6	65433	65438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019680	TGA	2	6	65476	65481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019680	TGA	2	6	67736	67741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019680	TCC	2	6	67800	67805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_019680	TTG	2	6	67850	67855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019680	ATT	2	6	67898	67903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019680	AAT	2	6	67961	67966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019680	GCT	2	6	72072	72077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019680	GAC	2	6	72122	72127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019680	TGT	2	6	84481	84486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019680	AGA	2	6	85386	85391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019680	CAA	2	6	86579	86584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019680	ATG	2	6	87212	87217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019680	ATA	2	6	87235	87240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019680	CAG	2	6	87250	87255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019680	TGC	2	6	87293	87298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019680	AAT	2	6	87341	87346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019680	TCA	2	6	87402	87407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019680	GCT	2	6	87478	87483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019680	GTT	2	6	89002	89007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019680	AGT	2	6	90990	90995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019680	ATC	2	6	91134	91139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019680	TTC	2	6	91217	91222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019680	GTT	2	6	91472	91477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019680	TAA	2	6	91540	91545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019680	TAA	2	6	92109	92114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019680	GAA	2	6	92667	92672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019680	GGA	2	6	99289	99294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019680	TGG	2	6	99379	99384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019680	ATT	2	6	100293	100298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019680	GCA	2	6	101107	101112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019680	TTC	2	6	101205	101210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019680	CTA	2	6	101230	101235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019680	GCT	2	6	101258	101263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019680	GTG	2	6	102851	102856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019680	GGT	2	6	102862	102867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019680	CCT	2	6	102873	102878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019680	TAT	2	6	107657	107662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019680	TCT	2	6	111362	111367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019680	GCC	2	6	113175	113180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019680	GCC	2	6	114811	114816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019680	ACG	2	6	115373	115378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019680	GGA	2	6	117565	117570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019680	ACC	2	6	120037	120042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_019680	TGA	2	6	120047	120052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019680	TCC	2	6	120854	120859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_019680	TCT	2	6	120863	120868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019680	GAA	2	6	125994	125999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019680	ATC	2	6	128074	128079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019680	AGG	2	6	128123	128128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019680	GTT	2	6	128149	128154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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