MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	TGTCG	2	10	345	354	0 %	40 %	40 %	20 %	427740401
2	NC_019679	TAAAC	2	10	3698	3707	60 %	20 %	0 %	20 %	427740409
3	NC_019679	AAAAG	2	10	4162	4171	80 %	0 %	20 %	0 %	427740409
4	NC_019679	CAGTA	2	10	6899	6908	40 %	20 %	20 %	20 %	427740413
5	NC_019679	CAATC	2	10	7760	7769	40 %	20 %	0 %	40 %	427740414
6	NC_019679	ATTTA	2	10	7806	7815	40 %	60 %	0 %	0 %	427740414
7	NC_019679	AAAAT	2	10	11263	11272	80 %	20 %	0 %	0 %	427740416
8	NC_019679	TTAGA	2	10	14325	14334	40 %	40 %	20 %	0 %	427740420
9	NC_019679	CTAGA	2	10	14886	14895	40 %	20 %	20 %	20 %	427740421
10	NC_019679	TAGTT	2	10	15457	15466	20 %	60 %	20 %	0 %	427740421
11	NC_019679	TAGAT	2	10	15818	15827	40 %	40 %	20 %	0 %	427740422
12	NC_019679	TTTGT	2	10	19111	19120	0 %	80 %	20 %	0 %	427740424
13	NC_019679	TGTGG	2	10	19496	19505	0 %	40 %	60 %	0 %	427740424
14	NC_019679	GGTAA	2	10	22861	22870	40 %	20 %	40 %	0 %	427740430
15	NC_019679	CTTTA	2	10	23842	23851	20 %	60 %	0 %	20 %	427740430
16	NC_019679	GCGTA	2	10	25085	25094	20 %	20 %	40 %	20 %	427740431
17	NC_019679	GACTT	2	10	25100	25109	20 %	40 %	20 %	20 %	427740431
18	NC_019679	GACCC	2	10	25110	25119	20 %	0 %	20 %	60 %	427740431
19	NC_019679	ATCGA	2	10	25133	25142	40 %	20 %	20 %	20 %	427740431
20	NC_019679	GAGTA	2	10	25938	25947	40 %	20 %	40 %	0 %	427740431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.