MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	AAGA	2	8	79	86	75 %	0 %	25 %	0 %	427740401
2	NC_019679	TTTG	2	8	416	423	0 %	75 %	25 %	0 %	427740401
3	NC_019679	TGTT	2	8	886	893	0 %	75 %	25 %	0 %	427740402
4	NC_019679	TGCG	2	8	1168	1175	0 %	25 %	50 %	25 %	427740403
5	NC_019679	TATT	2	8	1444	1451	25 %	75 %	0 %	0 %	427740404
6	NC_019679	ATTT	2	8	1588	1595	25 %	75 %	0 %	0 %	427740405
7	NC_019679	AAAT	2	8	3119	3126	75 %	25 %	0 %	0 %	427740408
8	NC_019679	TTAT	2	8	3740	3747	25 %	75 %	0 %	0 %	427740409
9	NC_019679	AAGT	2	8	4562	4569	50 %	25 %	25 %	0 %	427740410
10	NC_019679	TACT	2	8	6118	6125	25 %	50 %	0 %	25 %	427740411
11	NC_019679	GGCA	2	8	6353	6360	25 %	0 %	50 %	25 %	427740412
12	NC_019679	GGTA	2	8	6480	6487	25 %	25 %	50 %	0 %	427740412
13	NC_019679	CAAA	2	8	7077	7084	75 %	0 %	0 %	25 %	427740413
14	NC_019679	ATTC	2	8	7790	7797	25 %	50 %	0 %	25 %	427740414
15	NC_019679	TTAT	2	8	8244	8251	25 %	75 %	0 %	0 %	427740415
16	NC_019679	TTCA	2	8	8367	8374	25 %	50 %	0 %	25 %	427740415
17	NC_019679	GGTT	2	8	9011	9018	0 %	50 %	50 %	0 %	427740416
18	NC_019679	CCTG	2	8	9070	9077	0 %	25 %	25 %	50 %	427740416
19	NC_019679	TACA	2	8	9222	9229	50 %	25 %	0 %	25 %	427740416
20	NC_019679	CATC	2	8	9697	9704	25 %	25 %	0 %	50 %	427740416
21	NC_019679	TTTA	2	8	10311	10318	25 %	75 %	0 %	0 %	427740416
22	NC_019679	CAAA	2	8	10370	10377	75 %	0 %	0 %	25 %	427740416
23	NC_019679	TTTC	2	8	10483	10490	0 %	75 %	0 %	25 %	427740416
24	NC_019679	AGAT	2	8	10587	10594	50 %	25 %	25 %	0 %	427740416
25	NC_019679	TGAT	2	8	10842	10849	25 %	50 %	25 %	0 %	427740416
26	NC_019679	TCTT	2	8	10894	10901	0 %	75 %	0 %	25 %	427740416
27	NC_019679	AAAT	2	8	10935	10942	75 %	25 %	0 %	0 %	427740416
28	NC_019679	TTTC	2	8	11384	11391	0 %	75 %	0 %	25 %	427740416
29	NC_019679	TAAA	2	8	11449	11456	75 %	25 %	0 %	0 %	427740416
30	NC_019679	TTCT	2	8	11856	11863	0 %	75 %	0 %	25 %	427740416
31	NC_019679	CCTT	2	8	12537	12544	0 %	50 %	0 %	50 %	427740417
32	NC_019679	GCTT	2	8	14073	14080	0 %	50 %	25 %	25 %	427740419
33	NC_019679	AAAT	2	8	14120	14127	75 %	25 %	0 %	0 %	427740419
34	NC_019679	ATTT	2	8	14431	14438	25 %	75 %	0 %	0 %	427740420
35	NC_019679	GTTA	2	8	14459	14466	25 %	50 %	25 %	0 %	427740420
36	NC_019679	GTCG	2	8	14610	14617	0 %	25 %	50 %	25 %	427740420
37	NC_019679	TTTA	2	8	15235	15242	25 %	75 %	0 %	0 %	427740421
38	NC_019679	TAAA	2	8	15315	15322	75 %	25 %	0 %	0 %	427740421
39	NC_019679	AAAG	2	8	15729	15736	75 %	0 %	25 %	0 %	427740422
40	NC_019679	CTAT	2	8	16464	16471	25 %	50 %	0 %	25 %	427740422
41	NC_019679	ACCA	2	8	16522	16529	50 %	0 %	0 %	50 %	427740422
42	NC_019679	CCAC	2	8	17056	17063	25 %	0 %	0 %	75 %	427740422
43	NC_019679	AATT	2	8	17467	17474	50 %	50 %	0 %	0 %	427740423
44	NC_019679	CTGG	2	8	18966	18973	0 %	25 %	50 %	25 %	427740424
45	NC_019679	CTAG	2	8	19073	19080	25 %	25 %	25 %	25 %	427740424
46	NC_019679	TGTT	2	8	19157	19164	0 %	75 %	25 %	0 %	427740424
47	NC_019679	GTGA	2	8	19210	19217	25 %	25 %	50 %	0 %	427740424
48	NC_019679	TTAC	2	8	20885	20892	25 %	50 %	0 %	25 %	427740428
49	NC_019679	ATCA	2	8	23773	23780	50 %	25 %	0 %	25 %	427740430
50	NC_019679	GTTG	2	8	23989	23996	0 %	50 %	50 %	0 %	427740430
51	NC_019679	AATG	2	8	24754	24761	50 %	25 %	25 %	0 %	427740431
52	NC_019679	AAAG	2	8	24775	24782	75 %	0 %	25 %	0 %	427740431
53	NC_019679	TTGG	2	8	24787	24794	0 %	50 %	50 %	0 %	427740431
54	NC_019679	AAAT	2	8	25165	25172	75 %	25 %	0 %	0 %	427740431
55	NC_019679	TAGT	2	8	25706	25713	25 %	50 %	25 %	0 %	427740431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.