MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 336

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	TAG	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019679	TGT	2	6	241	246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
3	NC_019679	TCT	2	6	265	270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740401
4	NC_019679	CTA	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
5	NC_019679	CTA	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
6	NC_019679	GTT	2	6	450	455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
7	NC_019679	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740401
8	NC_019679	CCT	2	6	538	543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740401
9	NC_019679	ATC	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740401
10	NC_019679	GCC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427740401
11	NC_019679	ACC	3	9	642	650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740401
12	NC_019679	TTG	2	6	741	746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740401
13	NC_019679	CTT	3	9	1041	1049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740403
14	NC_019679	TCG	2	6	1076	1081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740403
15	NC_019679	CTT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740403
16	NC_019679	TCC	2	6	1316	1321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740404
17	NC_019679	AAT	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740404
18	NC_019679	TCT	2	6	1423	1428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740404
19	NC_019679	GTT	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740405
20	NC_019679	CAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019679	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019679	TAA	2	6	1746	1751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019679	CAG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019679	AGT	2	6	1928	1933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019679	ACT	2	6	1957	1962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019679	GAA	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740406
27	NC_019679	ACA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740407
28	NC_019679	AGC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740407
29	NC_019679	TGA	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740407
30	NC_019679	TGA	2	6	2425	2430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740407
31	NC_019679	AGA	2	6	2446	2451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740407
32	NC_019679	CCA	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019679	GGT	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019679	AAT	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019679	TTC	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740408
36	NC_019679	GAA	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
37	NC_019679	CAT	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740408
38	NC_019679	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
39	NC_019679	AAT	2	6	2950	2955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
40	NC_019679	TAA	2	6	2959	2964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
41	NC_019679	AAG	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
42	NC_019679	AGA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740408
43	NC_019679	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
44	NC_019679	TAT	2	6	3026	3031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740408
45	NC_019679	AAT	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740408
46	NC_019679	TGA	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740408
47	NC_019679	TAC	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019679	TAC	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019679	AAT	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019679	ATT	3	9	3438	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740409
51	NC_019679	TAG	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
52	NC_019679	GTA	2	6	3678	3683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
53	NC_019679	TAG	2	6	3767	3772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740409
54	NC_019679	AAT	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
55	NC_019679	TAA	2	6	4042	4047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
56	NC_019679	GGA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740409
57	NC_019679	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740409
58	NC_019679	ATA	2	6	4194	4199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740409
59	NC_019679	TGG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019679	TGG	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019679	TAC	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019679	ATA	2	6	4441	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019679	GTA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740410
64	NC_019679	TAC	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740410
65	NC_019679	TAT	2	6	4632	4637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019679	GGA	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019679	CAT	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019679	ATT	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019679	TAA	2	6	4897	4902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019679	GGA	2	6	4907	4912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019679	GGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019679	ATT	2	6	5266	5271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019679	TAA	2	6	5416	5421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019679	TGT	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019679	TCC	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_019679	TCC	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_019679	ATT	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019679	ATA	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019679	ATG	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019679	CTC	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_019679	ATA	2	6	6051	6056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019679	GTA	2	6	6163	6168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740411
83	NC_019679	TAC	2	6	6193	6198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740411
84	NC_019679	ATT	2	6	6240	6245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740411
85	NC_019679	GTA	2	6	6401	6406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740412
86	NC_019679	CCA	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740412
87	NC_019679	CAA	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740412
88	NC_019679	TAA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
89	NC_019679	GCA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740413
90	NC_019679	GCT	2	6	6678	6683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427740413
91	NC_019679	AAG	2	6	6733	6738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740413
92	NC_019679	TAA	2	6	6812	6817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
93	NC_019679	AAT	2	6	6883	6888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740413
94	NC_019679	TAT	2	6	6932	6937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740413
95	NC_019679	AAG	2	6	6952	6957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427740413
96	NC_019679	CAT	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740413
97	NC_019679	GAT	2	6	7050	7055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427740413
98	NC_019679	GTT	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740413
99	NC_019679	TTC	2	6	7205	7210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740413
100	NC_019679	TTG	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019679	ATC	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740414
102	NC_019679	GAG	2	6	7511	7516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740414
103	NC_019679	AGC	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
104	NC_019679	AAT	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740414
105	NC_019679	CAG	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
106	NC_019679	GGA	2	6	7816	7821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427740414
107	NC_019679	TTA	2	6	7825	7830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427740414
108	NC_019679	AGC	2	6	7863	7868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
109	NC_019679	AGC	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740414
110	NC_019679	CAA	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740414
111	NC_019679	GTA	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019679	AGT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019679	TTA	2	6	8023	8028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019679	ATT	3	9	8109	8117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019679	TAA	2	6	8181	8186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019679	GTT	2	6	8211	8216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019679	CAC	2	6	8261	8266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740415
118	NC_019679	CTT	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740415
119	NC_019679	CAG	2	6	8405	8410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740415
120	NC_019679	GAG	2	6	8521	8526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019679	AAT	2	6	8552	8557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019679	CTT	2	6	8615	8620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
123	NC_019679	CCA	2	6	8723	8728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740416
124	NC_019679	AAT	2	6	8921	8926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
125	NC_019679	TTG	2	6	8988	8993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427740416
126	NC_019679	TTC	2	6	9038	9043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427740416
127	NC_019679	ACC	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427740416
128	NC_019679	TGG	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427740416
129	NC_019679	AAT	2	6	9191	9196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
130	NC_019679	CAG	2	6	9332	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427740416
131	NC_019679	CCT	2	6	9574	9579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427740416
132	NC_019679	AAC	2	6	9672	9677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427740416
133	NC_019679	AAT	2	6	9853	9858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427740416
134	NC_019679	CTA	2	6	9908	9913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740416
135	NC_019679	CTA	2	6	9923	9928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427740416
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.