MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	TAG	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019679	CAT	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019679	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019679	TAA	2	6	1746	1751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019679	CAG	2	6	1809	1814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019679	AGT	2	6	1928	1933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019679	ACT	2	6	1957	1962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019679	CCA	2	6	2545	2550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019679	GGT	2	6	2613	2618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019679	AAT	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019679	TAC	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019679	TAC	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019679	AAT	2	6	3311	3316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019679	TGG	2	6	4253	4258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019679	TGG	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019679	TAC	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019679	ATA	2	6	4441	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019679	TAT	2	6	4632	4637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019679	GGA	2	6	4670	4675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019679	CAT	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019679	ATT	2	6	4798	4803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019679	TAA	2	6	4897	4902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019679	GGA	2	6	4907	4912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019679	GGA	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019679	ATT	2	6	5266	5271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019679	TAA	2	6	5416	5421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019679	TGT	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019679	TCC	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019679	TCC	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019679	ATT	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019679	ATA	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019679	ATG	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019679	CTC	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019679	ATA	2	6	6051	6056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019679	TTG	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019679	GTA	2	6	7975	7980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019679	AGT	2	6	8008	8013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019679	TTA	2	6	8023	8028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019679	ATT	3	9	8109	8117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019679	TAA	2	6	8181	8186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019679	GTT	2	6	8211	8216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019679	GAG	2	6	8521	8526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019679	AAT	2	6	8552	8557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019679	TTG	2	6	12314	12319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019679	CTC	2	6	12332	12337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019679	GTT	2	6	12338	12343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019679	GTT	2	6	13121	13126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019679	AAC	2	6	13459	13464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019679	TGT	2	6	13631	13636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019679	CAC	2	6	13778	13783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019679	ACT	2	6	13813	13818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019679	TAC	2	6	13846	13851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019679	AGA	2	6	13912	13917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019679	TTG	2	6	14317	14322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019679	CTT	2	6	20444	20449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019679	GTA	2	6	21039	21044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019679	GAA	2	6	21062	21067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019679	TAC	2	6	21332	21337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019679	TGT	2	6	21349	21354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019679	TAA	2	6	21878	21883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019679	GTC	2	6	22136	22141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019679	AAT	2	6	22723	22728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019679	AAT	2	6	22751	22756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019679	AAT	2	6	24317	24322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019679	TAG	2	6	24395	24400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019679	GTT	2	6	24444	24449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019679	AAT	2	6	24454	24459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.