MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	T	6	6	60	65	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019679	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	427740401
3	NC_019679	A	6	6	980	985	100 %	0 %	0 %	0 %	427740402
4	NC_019679	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	427740405
5	NC_019679	A	6	6	2659	2664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019679	A	11	11	3088	3098	100 %	0 %	0 %	0 %	427740408
7	NC_019679	A	8	8	3187	3194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019679	T	6	6	3299	3304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019679	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
10	NC_019679	A	6	6	3459	3464	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
11	NC_019679	A	6	6	3665	3670	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
12	NC_019679	A	6	6	3708	3713	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
13	NC_019679	A	8	8	3728	3735	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
14	NC_019679	A	6	6	4006	4011	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
15	NC_019679	T	7	7	4356	4362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019679	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019679	T	6	6	4418	4423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019679	T	6	6	4458	4463	0 %	100 %	0 %	0 %	427740410
19	NC_019679	T	8	8	4465	4472	0 %	100 %	0 %	0 %	427740410
20	NC_019679	A	6	6	4808	4813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019679	T	6	6	4826	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019679	G	6	6	4968	4973	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019679	A	7	7	5167	5173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019679	A	6	6	5208	5213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019679	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019679	T	7	7	5515	5521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019679	C	6	6	5715	5720	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_019679	A	6	6	5857	5862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019679	T	6	6	5875	5880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019679	A	8	8	6216	6223	100 %	0 %	0 %	0 %	427740411
31	NC_019679	A	6	6	6225	6230	100 %	0 %	0 %	0 %	427740411
32	NC_019679	A	6	6	6265	6270	100 %	0 %	0 %	0 %	427740412
33	NC_019679	T	6	6	6271	6276	0 %	100 %	0 %	0 %	427740412
34	NC_019679	A	7	7	6326	6332	100 %	0 %	0 %	0 %	427740412
35	NC_019679	T	7	7	6526	6532	0 %	100 %	0 %	0 %	427740413
36	NC_019679	T	7	7	6791	6797	0 %	100 %	0 %	0 %	427740413
37	NC_019679	T	8	8	7249	7256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019679	T	6	6	7800	7805	0 %	100 %	0 %	0 %	427740414
39	NC_019679	T	6	6	8169	8174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019679	T	6	6	8412	8417	0 %	100 %	0 %	0 %	427740415
41	NC_019679	T	6	6	8791	8796	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
42	NC_019679	A	6	6	9031	9036	100 %	0 %	0 %	0 %	427740416
43	NC_019679	T	7	7	9515	9521	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
44	NC_019679	A	6	6	9804	9809	100 %	0 %	0 %	0 %	427740416
45	NC_019679	T	6	6	9873	9878	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
46	NC_019679	T	6	6	9897	9902	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
47	NC_019679	T	6	6	10045	10050	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
48	NC_019679	T	6	6	10061	10066	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
49	NC_019679	T	6	6	10515	10520	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
50	NC_019679	T	6	6	11373	11378	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
51	NC_019679	A	6	6	11402	11407	100 %	0 %	0 %	0 %	427740416
52	NC_019679	T	8	8	11507	11514	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
53	NC_019679	T	6	6	11595	11600	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
54	NC_019679	T	6	6	12623	12628	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
55	NC_019679	T	6	6	12636	12641	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
56	NC_019679	T	7	7	12730	12736	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
57	NC_019679	T	6	6	13014	13019	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
58	NC_019679	T	6	6	13046	13051	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
59	NC_019679	T	6	6	13525	13530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019679	A	6	6	13536	13541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019679	A	6	6	13570	13575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019679	T	6	6	13615	13620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019679	T	6	6	15030	15035	0 %	100 %	0 %	0 %	427740421
64	NC_019679	T	6	6	15181	15186	0 %	100 %	0 %	0 %	427740421
65	NC_019679	T	6	6	15546	15551	0 %	100 %	0 %	0 %	427740421
66	NC_019679	A	6	6	15602	15607	100 %	0 %	0 %	0 %	427740421
67	NC_019679	T	6	6	16319	16324	0 %	100 %	0 %	0 %	427740422
68	NC_019679	A	6	6	16335	16340	100 %	0 %	0 %	0 %	427740422
69	NC_019679	T	6	6	16571	16576	0 %	100 %	0 %	0 %	427740422
70	NC_019679	A	6	6	16665	16670	100 %	0 %	0 %	0 %	427740422
71	NC_019679	A	6	6	16854	16859	100 %	0 %	0 %	0 %	427740422
72	NC_019679	T	6	6	18057	18062	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
73	NC_019679	T	6	6	18805	18810	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
74	NC_019679	T	6	6	19231	19236	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
75	NC_019679	T	6	6	19249	19254	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
76	NC_019679	A	6	6	19354	19359	100 %	0 %	0 %	0 %	427740424
77	NC_019679	T	6	6	19614	19619	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
78	NC_019679	A	6	6	20104	20109	100 %	0 %	0 %	0 %	427740425
79	NC_019679	A	7	7	20201	20207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019679	T	6	6	20625	20630	0 %	100 %	0 %	0 %	427740427
81	NC_019679	T	6	6	20802	20807	0 %	100 %	0 %	0 %	427740428
82	NC_019679	A	6	6	20870	20875	100 %	0 %	0 %	0 %	427740428
83	NC_019679	T	7	7	20963	20969	0 %	100 %	0 %	0 %	427740428
84	NC_019679	A	6	6	21175	21180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019679	T	6	6	21480	21485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019679	T	6	6	21490	21495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019679	A	6	6	22694	22699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019679	T	7	7	22969	22975	0 %	100 %	0 %	0 %	427740430
89	NC_019679	T	6	6	23455	23460	0 %	100 %	0 %	0 %	427740430
90	NC_019679	A	6	6	24012	24017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019679	T	6	6	24691	24696	0 %	100 %	0 %	0 %	427740431
92	NC_019679	T	6	6	25199	25204	0 %	100 %	0 %	0 %	427740431
93	NC_019679	T	6	6	25282	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	427740431
94	NC_019679	T	6	6	25324	25329	0 %	100 %	0 %	0 %	427740431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.