MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	T	6	6	801	806	0 %	100 %	0 %	0 %	427740401
2	NC_019679	A	6	6	980	985	100 %	0 %	0 %	0 %	427740402
3	NC_019679	T	6	6	1572	1577	0 %	100 %	0 %	0 %	427740405
4	NC_019679	A	11	11	3088	3098	100 %	0 %	0 %	0 %	427740408
5	NC_019679	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
6	NC_019679	A	6	6	3459	3464	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
7	NC_019679	A	6	6	3665	3670	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
8	NC_019679	A	6	6	3708	3713	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
9	NC_019679	A	8	8	3728	3735	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
10	NC_019679	A	6	6	4006	4011	100 %	0 %	0 %	0 %	427740409
11	NC_019679	T	6	6	4458	4463	0 %	100 %	0 %	0 %	427740410
12	NC_019679	T	8	8	4465	4472	0 %	100 %	0 %	0 %	427740410
13	NC_019679	A	8	8	6216	6223	100 %	0 %	0 %	0 %	427740411
14	NC_019679	A	6	6	6225	6230	100 %	0 %	0 %	0 %	427740411
15	NC_019679	A	6	6	6265	6270	100 %	0 %	0 %	0 %	427740412
16	NC_019679	T	6	6	6271	6276	0 %	100 %	0 %	0 %	427740412
17	NC_019679	A	7	7	6326	6332	100 %	0 %	0 %	0 %	427740412
18	NC_019679	T	7	7	6526	6532	0 %	100 %	0 %	0 %	427740413
19	NC_019679	T	7	7	6791	6797	0 %	100 %	0 %	0 %	427740413
20	NC_019679	T	6	6	7800	7805	0 %	100 %	0 %	0 %	427740414
21	NC_019679	T	6	6	8412	8417	0 %	100 %	0 %	0 %	427740415
22	NC_019679	T	6	6	8791	8796	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
23	NC_019679	A	6	6	9031	9036	100 %	0 %	0 %	0 %	427740416
24	NC_019679	T	7	7	9515	9521	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
25	NC_019679	A	6	6	9804	9809	100 %	0 %	0 %	0 %	427740416
26	NC_019679	T	6	6	9873	9878	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
27	NC_019679	T	6	6	9897	9902	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
28	NC_019679	T	6	6	10045	10050	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
29	NC_019679	T	6	6	10061	10066	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
30	NC_019679	T	6	6	10515	10520	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
31	NC_019679	T	6	6	11373	11378	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
32	NC_019679	A	6	6	11402	11407	100 %	0 %	0 %	0 %	427740416
33	NC_019679	T	8	8	11507	11514	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
34	NC_019679	T	6	6	11595	11600	0 %	100 %	0 %	0 %	427740416
35	NC_019679	T	6	6	12623	12628	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
36	NC_019679	T	6	6	12636	12641	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
37	NC_019679	T	7	7	12730	12736	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
38	NC_019679	T	6	6	13014	13019	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
39	NC_019679	T	6	6	13046	13051	0 %	100 %	0 %	0 %	427740417
40	NC_019679	T	6	6	15030	15035	0 %	100 %	0 %	0 %	427740421
41	NC_019679	T	6	6	15181	15186	0 %	100 %	0 %	0 %	427740421
42	NC_019679	T	6	6	15546	15551	0 %	100 %	0 %	0 %	427740421
43	NC_019679	A	6	6	15602	15607	100 %	0 %	0 %	0 %	427740421
44	NC_019679	T	6	6	16319	16324	0 %	100 %	0 %	0 %	427740422
45	NC_019679	A	6	6	16335	16340	100 %	0 %	0 %	0 %	427740422
46	NC_019679	T	6	6	16571	16576	0 %	100 %	0 %	0 %	427740422
47	NC_019679	A	6	6	16665	16670	100 %	0 %	0 %	0 %	427740422
48	NC_019679	A	6	6	16854	16859	100 %	0 %	0 %	0 %	427740422
49	NC_019679	T	6	6	18057	18062	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
50	NC_019679	T	6	6	18805	18810	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
51	NC_019679	T	6	6	19231	19236	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
52	NC_019679	T	6	6	19249	19254	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
53	NC_019679	A	6	6	19354	19359	100 %	0 %	0 %	0 %	427740424
54	NC_019679	T	6	6	19614	19619	0 %	100 %	0 %	0 %	427740424
55	NC_019679	A	6	6	20104	20109	100 %	0 %	0 %	0 %	427740425
56	NC_019679	T	6	6	20625	20630	0 %	100 %	0 %	0 %	427740427
57	NC_019679	T	6	6	20802	20807	0 %	100 %	0 %	0 %	427740428
58	NC_019679	A	6	6	20870	20875	100 %	0 %	0 %	0 %	427740428
59	NC_019679	T	7	7	20963	20969	0 %	100 %	0 %	0 %	427740428
60	NC_019679	T	7	7	22969	22975	0 %	100 %	0 %	0 %	427740430
61	NC_019679	T	6	6	23455	23460	0 %	100 %	0 %	0 %	427740430
62	NC_019679	T	6	6	24691	24696	0 %	100 %	0 %	0 %	427740431
63	NC_019679	T	6	6	25199	25204	0 %	100 %	0 %	0 %	427740431
64	NC_019679	T	6	6	25282	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	427740431
65	NC_019679	T	6	6	25324	25329	0 %	100 %	0 %	0 %	427740431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.