MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	CCTTTA	2	12	3091	3102	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019678	CTCTTT	2	12	10201	10212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019678	AGCTAC	2	12	50463	50474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019678	ATCTAA	2	12	54495	54506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019678	TTCAAT	2	12	58166	58177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019678	TCTAAT	2	12	58224	58235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019678	TAAATT	2	12	59683	59694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019678	TAATTT	2	12	66098	66109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019678	GAAAAT	2	12	79644	79655	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019678	AAACTA	2	12	82526	82537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019678	ACTGAT	2	12	102395	102406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019678	AGTATA	2	12	107836	107847	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019678	CTTAGA	2	12	107849	107860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019678	TTTATT	2	12	118159	118170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019678	AGAAAT	2	12	120324	120335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019678	ATGATT	2	12	149604	149615	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019678	ACCATA	2	12	185576	185587	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019678	AACCTA	2	12	192945	192956	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019678	ATAAAA	2	12	215154	215165	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019678	ATTGTT	2	12	231427	231438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019678	GTATTA	2	12	235022	235033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019678	TAAATT	2	12	270446	270457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019678	ATTTCT	2	12	276606	276617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019678	ATTTCT	2	12	285549	285560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_019678	ACGACC	2	12	285822	285833	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019678	ATACTC	2	12	287306	287317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019678	AAAATA	2	12	288005	288016	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019678	AATTTT	2	12	295655	295666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019678	ATTTCA	2	12	329439	329450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019678	TAACTA	2	12	329677	329688	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019678	AATATA	2	12	340763	340774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019678	AATTTT	2	12	341852	341863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019678	TTTTTG	2	12	375587	375598	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019678	TAATTT	2	12	380542	380553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019678	CCATTT	2	12	385581	385592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019678	ATTTTT	2	12	392123	392134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019678	ACTTTT	2	12	415536	415547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019678	TAAAAA	2	12	422938	422949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019678	GTAAGC	2	12	427277	427288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019678	TAACAT	2	12	433702	433713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_019678	AATGCT	2	12	443758	443769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019678	ATTTTG	2	12	453265	453276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019678	TAATTA	2	12	475660	475671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019678	TAAATA	2	12	475890	475901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019678	ATTTAA	2	12	486043	486054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019678	TTTATT	2	12	488478	488489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019678	TTTATC	2	12	491878	491889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019678	ATCTGA	2	12	508147	508158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019678	CTTATT	2	12	517180	517191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019678	ACTTAA	2	12	529602	529613	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019678	TAATCT	2	12	574250	574261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019678	TTAAAA	2	12	589633	589644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019678	TATCAG	2	12	594839	594850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019678	AAAGTA	2	12	609229	609240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019678	TTTAGC	2	12	613188	613199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019678	AAAAGT	2	12	615508	615519	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019678	GTATTG	2	12	626022	626033	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019678	TGTAGC	2	12	626585	626596	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019678	TTTATG	2	12	646361	646372	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019678	ATTAAT	2	12	654648	654659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019678	TTTAAC	2	12	676996	677007	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019678	ATGATT	2	12	689261	689272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019678	TCTTAC	2	12	696280	696291	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019678	GTCATA	2	12	715894	715905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_019678	CAAAAT	2	12	722281	722292	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019678	ATATTT	2	12	725314	725325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019678	AATTTA	2	12	730160	730171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019678	TGTAGT	2	12	745682	745693	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019678	CAACGT	2	12	752279	752290	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019678	TATTTA	2	12	753198	753209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019678	AAAATA	2	12	767936	767947	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019678	ACTCCT	2	12	770485	770496	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019678	AATAAA	2	12	776373	776384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019678	TTTTAT	2	12	788227	788238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019678	AGGGGA	2	12	794179	794190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019678	TATGTT	2	12	799411	799422	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019678	TTATAG	2	12	799424	799435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019678	AAATAA	2	12	818788	818799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019678	TGGCCT	2	12	840399	840410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019678	ATTTTT	2	12	874994	875005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019678	AATATA	2	12	875655	875666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019678	AAATCA	2	12	895321	895332	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019678	TAAATT	2	12	897401	897412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019678	ATAAGA	2	12	917835	917846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019678	TCTTTA	2	12	919926	919937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019678	TACAAT	2	12	942204	942215	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019678	CAGTTA	2	12	957537	957548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019678	AATTAC	2	12	957712	957723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019678	TAGTTT	2	12	973591	973602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019678	GATATT	2	12	1000675	1000686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019678	TTGGTT	2	12	1005791	1005802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019678	ATTTTT	2	12	1011497	1011508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019678	CCGGTG	2	12	1017633	1017644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019678	CAATAT	2	12	1038704	1038715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019678	TATAAA	2	12	1046569	1046580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019678	ATATTT	2	12	1063481	1063492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019678	AGTAGG	2	12	1082297	1082308	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019678	GCCCCT	2	12	1088685	1088696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019678	GCAAAA	2	12	1122851	1122862	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019678	CAATAT	2	12	1129044	1129055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019678	CCACCT	2	12	1162254	1162265	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019678	AAAAAT	2	12	1164489	1164500	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019678	TAGATT	2	12	1165497	1165508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019678	GTATTT	2	12	1170178	1170189	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019678	AAAGTT	2	12	1175466	1175477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019678	ACAATA	2	12	1177144	1177155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019678	TAATAT	2	12	1179697	1179708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019678	CCCAAT	2	12	1180853	1180864	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019678	TTATGA	2	12	1203303	1203314	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019678	CTGTAT	2	12	1213902	1213913	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019678	TATTTA	2	12	1214305	1214316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019678	AGTTTA	2	12	1233324	1233335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019678	GCTAAC	2	12	1258501	1258512	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019678	ATATTT	2	12	1277649	1277660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019678	TTTCAT	2	12	1312836	1312847	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019678	ATAAAA	2	12	1317869	1317880	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019678	TCCCCT	2	12	1321549	1321560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019678	TAGAAG	2	12	1324472	1324483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019678	TCTTTT	2	12	1326614	1326625	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019678	CGCAAT	2	12	1343593	1343604	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019678	TCAAAA	2	12	1349823	1349834	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_019678	GTTCTT	2	12	1366796	1366807	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_019678	AATTAA	2	12	1377588	1377599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019678	CTGAAA	2	12	1377639	1377650	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019678	AAAACC	2	12	1382508	1382519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019678	AAATTA	2	12	1386804	1386815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019678	TTTATT	2	12	1408995	1409006	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019678	CTTTTT	2	12	1412346	1412357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019678	TATAAA	2	12	1427139	1427150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019678	AAAATT	2	12	1430048	1430059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019678	ATTAAA	2	12	1433006	1433017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_019678	AAATAT	2	12	1474452	1474463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_019678	AATAAA	2	12	1684521	1684532	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_019678	CTGTGA	2	12	2661727	2661738	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_019678	TGTAGC	2	12	2668735	2668746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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252	NC_019678	TGCTAT	2	12	2669998	2670009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_019678	GTGGGA	2	12	2697891	2697902	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019678	GCACCA	2	12	2700142	2700153	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
255	NC_019678	CCATCA	2	12	2700763	2700774	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
256	NC_019678	ATCGTA	2	12	2701176	2701187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_019678	TGGAAT	2	12	2712624	2712635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_019678	AGCTAT	2	12	2719205	2719216	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_019678	CTACTT	2	12	2719395	2719406	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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499	NC_019678	GCTTTT	2	12	5155474	5155485	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
500	NC_019678	ATATTA	2	12	5180200	5180211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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