MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 1924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	AGCGA	2	10	27516	27525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019678	ACAAA	2	10	46605	46614	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_019678	TAATT	2	10	51583	51592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019678	GGTTG	2	10	54741	54750	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019678	GCTTA	2	10	56074	56083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_019678	ATATT	2	10	56865	56874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019678	TATTT	2	10	62825	62834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019678	CTAAG	2	10	68924	68933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019678	GAAAA	2	10	76707	76716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019678	TATTT	2	10	81015	81024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019678	ACTTA	2	10	84898	84907	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019678	TAAAA	2	10	86813	86822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019678	ATTAA	2	10	86832	86841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019678	ATATA	2	10	90570	90579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019678	AAGTA	2	10	92551	92560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019678	TGCCG	2	10	116424	116433	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019678	AAATT	2	10	120361	120370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019678	AAAGA	2	10	123596	123605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019678	AAAAT	2	10	131523	131532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019678	ATATT	2	10	144989	144998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019678	GATTA	2	10	149986	149995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019678	GATTA	2	10	157011	157020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019678	AACTT	2	10	160475	160484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019678	AAAGT	2	10	173529	173538	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019678	TTCAA	2	10	175040	175049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019678	ATTTT	2	10	196040	196049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019678	GCAAA	2	10	211419	211428	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019678	TCTTT	2	10	215263	215272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_019678	ATAGG	2	10	221870	221879	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019678	ATTTT	2	10	221957	221966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019678	AAATT	2	10	222800	222809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019678	AGATT	2	10	224133	224142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019678	TACTT	2	10	225640	225649	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019678	AATTT	2	10	226360	226369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019678	TACAT	2	10	235111	235120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019678	AAATT	2	10	235252	235261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019678	AGTTT	2	10	235462	235471	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019678	TAGAA	2	10	240088	240097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019678	GAAGG	2	10	243447	243456	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019678	TTTTG	2	10	243903	243912	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019678	AATTA	2	10	244977	244986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019678	CAAAT	2	10	245097	245106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_019678	GCAAG	2	10	253589	253598	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019678	TAAAA	2	10	254855	254864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019678	CGAAT	2	10	264188	264197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_019678	TAATT	2	10	267497	267506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019678	CTCAA	2	10	267918	267927	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019678	AGGAG	2	10	276367	276376	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019678	GGTTG	2	10	283391	283400	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019678	TTTTG	2	10	284222	284231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019678	TTTAA	2	10	284234	284243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019678	TTACA	2	10	284302	284311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019678	AGTTG	2	10	287457	287466	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019678	CTATC	2	10	291110	291119	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_019678	AGATA	2	10	296451	296460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019678	CCCTT	2	10	299132	299141	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_019678	ACTTT	2	10	305075	305084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019678	TAATC	2	10	324919	324928	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019678	AAATT	2	10	325243	325252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019678	AATAT	2	10	325884	325893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019678	AAATC	2	10	328979	328988	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019678	AAATA	2	10	329102	329111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019678	CTATT	2	10	329207	329216	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019678	AATTG	2	10	330746	330755	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019678	AAAAT	2	10	342009	342018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019678	TAAAA	2	10	366434	366443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019678	AGTTT	2	10	371861	371870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019678	ATTGA	2	10	372577	372586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019678	AAAAT	2	10	382906	382915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019678	AATAA	2	10	383184	383193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019678	TAAAT	2	10	390321	390330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019678	CTTGT	2	10	393737	393746	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019678	TGCAA	2	10	396270	396279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_019678	TAATT	2	10	398028	398037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019678	GCCAC	2	10	403671	403680	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_019678	AAATC	2	10	406154	406163	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019678	AAATC	2	10	406231	406240	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_019678	TAAAA	2	10	411830	411839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019678	AATAA	2	10	426639	426648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019678	ATTAA	2	10	442592	442601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019678	TAATT	2	10	443293	443302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019678	ACTTT	2	10	443559	443568	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_019678	AGACC	2	10	446021	446030	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_019678	AATTA	2	10	446482	446491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019678	TATTT	2	10	446827	446836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019678	TCTCC	2	10	447823	447832	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_019678	AGATA	2	10	469203	469212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019678	TAAAT	2	10	483122	483131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019678	TTGTA	2	10	483523	483532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019678	ATTTT	2	10	492313	492322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019678	GTAAA	2	10	495430	495439	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019678	AATTA	2	10	495730	495739	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019678	TAAAA	2	10	497915	497924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019678	TTTGC	2	10	505156	505165	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019678	CTTGC	2	10	505936	505945	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_019678	AAAAT	2	10	509711	509720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019678	TAAAT	2	10	512275	512284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019678	GACTC	2	10	515616	515625	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_019678	TTAAA	2	10	516347	516356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019678	CTAAT	2	10	525628	525637	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019678	AAAAG	2	10	526871	526880	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019678	AAATT	2	10	529801	529810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019678	TAGTT	2	10	529919	529928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019678	CAATT	2	10	532291	532300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_019678	GCCTA	2	10	532948	532957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_019678	AGACA	2	10	533239	533248	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_019678	TGTTC	2	10	533571	533580	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019678	TGATT	2	10	533645	533654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019678	AATTT	2	10	533782	533791	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019678	CGTAA	2	10	535562	535571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019678	ACATT	2	10	541350	541359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_019678	ATGTA	2	10	543024	543033	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019678	TTAGT	2	10	546499	546508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019678	ACTTA	2	10	549352	549361	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019678	AGTTA	2	10	549533	549542	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019678	AAAAT	2	10	552403	552412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019678	TATCA	2	10	560471	560480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019678	AAAAG	2	10	566792	566801	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019678	AATTT	2	10	566909	566918	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019678	TTGTT	2	10	572136	572145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019678	TTGTA	2	10	572285	572294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019678	CTTAT	2	10	573336	573345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019678	ATCAC	2	10	575247	575256	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_019678	GGTTT	2	10	589649	589658	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019678	TCCTT	2	10	593853	593862	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_019678	TATAT	2	10	594118	594127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019678	GAGAA	2	10	594560	594569	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019678	ATGAA	2	10	605652	605661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019678	TAGGG	2	10	605690	605699	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019678	TGAGA	2	10	605982	605991	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019678	TTAAG	2	10	611988	611997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019678	CTTTA	2	10	612035	612044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_019678	AATTA	2	10	612192	612201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019678	TTTAA	2	10	618161	618170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019678	TTAAT	2	10	624155	624164	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019678	TATTT	2	10	626836	626845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019678	TTTTA	2	10	638008	638017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019678	TTAAA	2	10	638221	638230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019678	CCAAG	2	10	645987	645996	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_019678	CTTGC	2	10	654476	654485	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_019678	TGATT	2	10	660866	660875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019678	ATTTT	2	10	681070	681079	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019678	GCATA	2	10	684396	684405	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019678	GTATT	2	10	693370	693379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019678	CATTG	2	10	693467	693476	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_019678	AAAAT	2	10	694781	694790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019678	TATTT	2	10	700909	700918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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