MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 7483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	TTAA	2	8	1751	1758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019678	TATT	2	8	1831	1838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019678	TGGG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019678	ATTT	2	8	6531	6538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019678	ATTT	2	8	7833	7840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019678	ACTC	2	8	8320	8327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019678	GGTC	2	8	11725	11732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019678	TTGG	2	8	12011	12018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019678	TCAA	2	8	12111	12118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019678	TGCT	2	8	12450	12457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019678	TTTA	2	8	12983	12990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019678	ACTT	2	8	12996	13003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_019678	TAGT	2	8	15182	15189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019678	TAAT	2	8	15529	15536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019678	TAAA	2	8	17035	17042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019678	TTTG	2	8	17061	17068	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019678	GATT	2	8	19255	19262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019678	ATTC	2	8	21440	21447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019678	CTAG	2	8	21569	21576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019678	ACAA	2	8	22093	22100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019678	ATTC	2	8	22142	22149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_019678	AGAA	2	8	22186	22193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019678	ATTA	2	8	22734	22741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019678	TTAG	2	8	22892	22899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019678	TAAA	2	8	22963	22970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019678	CTAA	2	8	23018	23025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019678	AGTA	2	8	25055	25062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019678	TGAT	2	8	27120	27127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019678	TTAT	2	8	27151	27158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019678	TATC	2	8	27354	27361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019678	GGAG	2	8	27542	27549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019678	TAAA	2	8	29126	29133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019678	AAAT	2	8	29155	29162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019678	AAGT	2	8	32560	32567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019678	ATTG	2	8	36456	36463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019678	GTTA	2	8	42295	42302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019678	ATGA	2	8	46465	46472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019678	GATA	2	8	46559	46566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019678	TATT	2	8	47761	47768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019678	ATTA	2	8	47793	47800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019678	GTTT	2	8	49603	49610	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019678	CAAA	2	8	49640	49647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019678	TAAC	2	8	49654	49661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019678	CCTA	2	8	51798	51805	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019678	CATT	2	8	51824	51831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019678	AATT	2	8	54714	54721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019678	ACCA	2	8	55350	55357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019678	TTTA	2	8	56066	56073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019678	GAAA	2	8	58346	58353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019678	AGGC	2	8	60653	60660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019678	CTAA	2	8	63305	63312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_019678	TAAA	3	12	65102	65113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019678	TAAA	2	8	65169	65176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019678	ATTA	2	8	65213	65220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019678	TAGT	2	8	65292	65299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019678	ATTA	2	8	65310	65317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019678	AATC	2	8	65499	65506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019678	TTAA	2	8	65525	65532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019678	TAAT	2	8	65550	65557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019678	TGAT	2	8	66646	66653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019678	ATTT	2	8	66726	66733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019678	GAAT	2	8	66905	66912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019678	ATTG	2	8	70896	70903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019678	GCAA	2	8	74949	74956	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019678	AAAT	2	8	76686	76693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019678	TTAC	2	8	78262	78269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019678	CAGC	2	8	78336	78343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019678	AACA	2	8	78349	78356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019678	ACTA	2	8	79235	79242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019678	TTTC	2	8	82942	82949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019678	TGGA	2	8	82965	82972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019678	TCAA	2	8	84861	84868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019678	AGTC	2	8	84947	84954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019678	TGAT	2	8	86869	86876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019678	TTAA	2	8	86952	86959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019678	AAGA	2	8	90554	90561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019678	GATG	2	8	98064	98071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019678	TCCT	2	8	98715	98722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019678	TTAC	2	8	99995	100002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019678	CAAG	2	8	102186	102193	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019678	TAAT	2	8	107786	107793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019678	GCTT	2	8	108060	108067	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019678	CTGG	2	8	110394	110401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019678	CTGG	2	8	110428	110435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019678	GATA	2	8	112229	112236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019678	GAAG	2	8	112256	112263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019678	GATT	2	8	112504	112511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019678	ATTG	2	8	113389	113396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019678	GATT	2	8	113398	113405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019678	TTAC	2	8	113543	113550	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019678	TTTA	2	8	115669	115676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019678	GATT	2	8	115904	115911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019678	TTAT	2	8	116014	116021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019678	CTGT	2	8	116061	116068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019678	AGCG	2	8	117724	117731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019678	CATC	2	8	117937	117944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019678	ATTA	2	8	118129	118136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019678	ATTT	2	8	119178	119185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019678	GCTC	2	8	121181	121188	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019678	ACTG	2	8	123449	123456	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_019678	GAAC	2	8	123483	123490	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_019678	TCAC	2	8	124884	124891	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019678	TAAT	2	8	125300	125307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019678	ACCA	2	8	125569	125576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019678	GTTT	2	8	125593	125600	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019678	TCAA	2	8	125795	125802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019678	ACTT	2	8	128807	128814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019678	CTAA	2	8	128982	128989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019678	ATTT	2	8	131635	131642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019678	TTTA	2	8	131651	131658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019678	TAAA	2	8	131831	131838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019678	TCAC	2	8	131848	131855	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_019678	TTCT	2	8	132070	132077	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019678	TAAT	2	8	132127	132134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019678	ATCA	2	8	132306	132313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019678	AAAT	2	8	133641	133648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019678	CCAG	2	8	134321	134328	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019678	GATG	2	8	134757	134764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019678	ATCT	2	8	134813	134820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019678	ATTT	2	8	137805	137812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019678	ATTT	2	8	137824	137831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019678	AGTA	2	8	139366	139373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019678	GCAA	2	8	139534	139541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019678	TTAC	2	8	139590	139597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019678	GCAA	2	8	142031	142038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_019678	TCAA	2	8	142079	142086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019678	AAAT	2	8	142177	142184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019678	TTCT	2	8	144945	144952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019678	TAAA	2	8	145139	145146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019678	GATA	2	8	145453	145460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019678	TCTG	2	8	145503	145510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019678	ATTA	2	8	146859	146866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019678	TTAA	2	8	147569	147576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019678	TTTA	2	8	147751	147758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019678	ACCA	2	8	149283	149290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_019678	TAAT	2	8	149386	149393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019678	CTAG	2	8	149661	149668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019678	TAGC	2	8	149691	149698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019678	AGTA	2	8	149800	149807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019678	TAAA	2	8	149816	149823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019678	TACA	2	8	150191	150198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019678	ACAA	2	8	150391	150398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019678	AGCA	2	8	150421	150428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019678	TACT	2	8	150524	150531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019678	AACA	2	8	150559	150566	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019678	AATG	2	8	150927	150934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019678	CTTA	2	8	151043	151050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019678	AAAT	2	8	151272	151279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019678	TCAA	2	8	151333	151340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_019678	ATAA	2	8	153332	153339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019678	AACT	2	8	153341	153348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_019678	AACA	2	8	157078	157085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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