MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 19701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	TATT	2	8	273	280	25 %	75 %	0 %	0 %	427733620
2	NC_019678	AAAG	2	8	313	320	75 %	0 %	25 %	0 %	427733620
3	NC_019678	GTAT	2	8	408	415	25 %	50 %	25 %	0 %	427733620
4	NC_019678	GGAA	2	8	488	495	50 %	0 %	50 %	0 %	427733620
5	NC_019678	AAGA	2	8	839	846	75 %	0 %	25 %	0 %	427733620
6	NC_019678	ATTA	2	8	1020	1027	50 %	50 %	0 %	0 %	427733620
7	NC_019678	CAAG	2	8	2502	2509	50 %	0 %	25 %	25 %	427733621
8	NC_019678	AGAA	2	8	2725	2732	75 %	0 %	25 %	0 %	427733621
9	NC_019678	GATT	2	8	3393	3400	25 %	50 %	25 %	0 %	427733622
10	NC_019678	CATT	2	8	3472	3479	25 %	50 %	0 %	25 %	427733622
11	NC_019678	GCTC	2	8	3768	3775	0 %	25 %	25 %	50 %	427733622
12	NC_019678	AATT	2	8	3953	3960	50 %	50 %	0 %	0 %	427733622
13	NC_019678	TGCT	2	8	4037	4044	0 %	50 %	25 %	25 %	427733622
14	NC_019678	AATT	2	8	4364	4371	50 %	50 %	0 %	0 %	427733622
15	NC_019678	TTGC	2	8	4552	4559	0 %	50 %	25 %	25 %	427733622
16	NC_019678	TATT	2	8	5422	5429	25 %	75 %	0 %	0 %	427733622
17	NC_019678	TTTC	2	8	6040	6047	0 %	75 %	0 %	25 %	427733622
18	NC_019678	GTTT	2	8	6300	6307	0 %	75 %	25 %	0 %	427733622
19	NC_019678	TAAG	2	8	7100	7107	50 %	25 %	25 %	0 %	427733623
20	NC_019678	CATC	2	8	7477	7484	25 %	25 %	0 %	50 %	427733623
21	NC_019678	ATTC	2	8	8136	8143	25 %	50 %	0 %	25 %	427733624
22	NC_019678	TTCT	2	8	8409	8416	0 %	75 %	0 %	25 %	427733625
23	NC_019678	TGCT	2	8	8779	8786	0 %	50 %	25 %	25 %	427733625
24	NC_019678	AATC	2	8	10565	10572	50 %	25 %	0 %	25 %	427733627
25	NC_019678	CAAT	2	8	10679	10686	50 %	25 %	0 %	25 %	427733627
26	NC_019678	TTGC	2	8	10826	10833	0 %	50 %	25 %	25 %	427733627
27	NC_019678	ACCA	2	8	11110	11117	50 %	0 %	0 %	50 %	427733627
28	NC_019678	TCTG	3	12	11515	11526	0 %	50 %	25 %	25 %	427733627
29	NC_019678	CTAA	2	8	13056	13063	50 %	25 %	0 %	25 %	427733629
30	NC_019678	AATC	2	8	14062	14069	50 %	25 %	0 %	25 %	427733629
31	NC_019678	GATC	2	8	14122	14129	25 %	25 %	25 %	25 %	427733629
32	NC_019678	CAAC	2	8	15889	15896	50 %	0 %	0 %	50 %	427733630
33	NC_019678	AATT	2	8	15905	15912	50 %	50 %	0 %	0 %	427733630
34	NC_019678	GTTG	2	8	16037	16044	0 %	50 %	50 %	0 %	427733630
35	NC_019678	AAGC	2	8	16804	16811	50 %	0 %	25 %	25 %	427733630
36	NC_019678	AAAT	2	8	17255	17262	75 %	25 %	0 %	0 %	427733631
37	NC_019678	TAAA	2	8	17992	17999	75 %	25 %	0 %	0 %	427733631
38	NC_019678	AGAT	2	8	18011	18018	50 %	25 %	25 %	0 %	427733631
39	NC_019678	TAGC	2	8	18932	18939	25 %	25 %	25 %	25 %	427733633
40	NC_019678	GAGT	2	8	19439	19446	25 %	25 %	50 %	0 %	427733634
41	NC_019678	TTTA	2	8	19585	19592	25 %	75 %	0 %	0 %	427733634
42	NC_019678	TCGT	2	8	21325	21332	0 %	50 %	25 %	25 %	427733634
43	NC_019678	TGAT	2	8	21724	21731	25 %	50 %	25 %	0 %	427733635
44	NC_019678	TCAA	2	8	23706	23713	50 %	25 %	0 %	25 %	427733637
45	NC_019678	GTTT	2	8	23792	23799	0 %	75 %	25 %	0 %	427733637
46	NC_019678	CAAA	2	8	24256	24263	75 %	0 %	0 %	25 %	427733637
47	NC_019678	ATTA	2	8	24605	24612	50 %	50 %	0 %	0 %	427733637
48	NC_019678	AACG	2	8	24625	24632	50 %	0 %	25 %	25 %	427733637
49	NC_019678	TATT	2	8	25426	25433	25 %	75 %	0 %	0 %	427733638
50	NC_019678	TCAA	2	8	26473	26480	50 %	25 %	0 %	25 %	427733640
51	NC_019678	CTGA	2	8	26568	26575	25 %	25 %	25 %	25 %	427733640
52	NC_019678	AGTT	2	8	26629	26636	25 %	50 %	25 %	0 %	427733640
53	NC_019678	AGTT	2	8	27997	28004	25 %	50 %	25 %	0 %	427733641
54	NC_019678	GTAA	2	8	28065	28072	50 %	25 %	25 %	0 %	427733641
55	NC_019678	TTTC	2	8	28288	28295	0 %	75 %	0 %	25 %	427733641
56	NC_019678	GGAA	2	8	29789	29796	50 %	0 %	50 %	0 %	427733642
57	NC_019678	GATT	2	8	30532	30539	25 %	50 %	25 %	0 %	427733642
58	NC_019678	CTAC	2	8	31071	31078	25 %	25 %	0 %	50 %	427733642
59	NC_019678	AATT	2	8	31183	31190	50 %	50 %	0 %	0 %	427733642
60	NC_019678	AATT	2	8	31336	31343	50 %	50 %	0 %	0 %	427733642
61	NC_019678	AGCA	2	8	31585	31592	50 %	0 %	25 %	25 %	427733642
62	NC_019678	AGCA	2	8	31838	31845	50 %	0 %	25 %	25 %	427733642
63	NC_019678	TTCC	2	8	32096	32103	0 %	50 %	0 %	50 %	427733642
64	NC_019678	GGTT	2	8	32141	32148	0 %	50 %	50 %	0 %	427733642
65	NC_019678	TTGT	2	8	33446	33453	0 %	75 %	25 %	0 %	427733643
66	NC_019678	TACT	2	8	34287	34294	25 %	50 %	0 %	25 %	427733644
67	NC_019678	ATTA	2	8	34484	34491	50 %	50 %	0 %	0 %	427733644
68	NC_019678	TCTT	2	8	34961	34968	0 %	75 %	0 %	25 %	427733644
69	NC_019678	TTCT	2	8	35481	35488	0 %	75 %	0 %	25 %	427733645
70	NC_019678	TTGC	2	8	35676	35683	0 %	50 %	25 %	25 %	427733645
71	NC_019678	CAAA	2	8	35790	35797	75 %	0 %	0 %	25 %	427733645
72	NC_019678	CAAC	2	8	35849	35856	50 %	0 %	0 %	50 %	427733645
73	NC_019678	TGAT	2	8	36369	36376	25 %	50 %	25 %	0 %	427733645
74	NC_019678	CTTG	2	8	36527	36534	0 %	50 %	25 %	25 %	427733646
75	NC_019678	TTGA	2	8	37652	37659	25 %	50 %	25 %	0 %	427733647
76	NC_019678	CCAA	2	8	37684	37691	50 %	0 %	0 %	50 %	427733647
77	NC_019678	TCTT	2	8	37701	37708	0 %	75 %	0 %	25 %	427733647
78	NC_019678	GCGA	2	8	37852	37859	25 %	0 %	50 %	25 %	427733647
79	NC_019678	AACT	2	8	37876	37883	50 %	25 %	0 %	25 %	427733647
80	NC_019678	ATAA	2	8	37952	37959	75 %	25 %	0 %	0 %	427733647
81	NC_019678	GCTT	2	8	38115	38122	0 %	50 %	25 %	25 %	427733647
82	NC_019678	ACCA	2	8	38154	38161	50 %	0 %	0 %	50 %	427733647
83	NC_019678	TTCT	2	8	38170	38177	0 %	75 %	0 %	25 %	427733647
84	NC_019678	TCCT	2	8	38201	38208	0 %	50 %	0 %	50 %	427733647
85	NC_019678	TAAC	2	8	38305	38312	50 %	25 %	0 %	25 %	427733647
86	NC_019678	TAAC	2	8	38671	38678	50 %	25 %	0 %	25 %	427733647
87	NC_019678	CGTT	2	8	38804	38811	0 %	50 %	25 %	25 %	427733647
88	NC_019678	CAAG	2	8	38814	38821	50 %	0 %	25 %	25 %	427733647
89	NC_019678	CATT	2	8	39607	39614	25 %	50 %	0 %	25 %	427733649
90	NC_019678	GTAG	2	8	40267	40274	25 %	25 %	50 %	0 %	427733649
91	NC_019678	ATCT	2	8	40577	40584	25 %	50 %	0 %	25 %	427733649
92	NC_019678	CAAA	2	8	40864	40871	75 %	0 %	0 %	25 %	427733651
93	NC_019678	TTTC	2	8	41228	41235	0 %	75 %	0 %	25 %	427733651
94	NC_019678	TAAA	2	8	41596	41603	75 %	25 %	0 %	0 %	427733651
95	NC_019678	TTGC	2	8	41812	41819	0 %	50 %	25 %	25 %	427733651
96	NC_019678	AATT	2	8	41908	41915	50 %	50 %	0 %	0 %	427733651
97	NC_019678	TTTA	2	8	42431	42438	25 %	75 %	0 %	0 %	427733652
98	NC_019678	CATT	2	8	42669	42676	25 %	50 %	0 %	25 %	427733652
99	NC_019678	CAAG	2	8	43023	43030	50 %	0 %	25 %	25 %	427733652
100	NC_019678	AAAT	2	8	43378	43385	75 %	25 %	0 %	0 %	427733653
101	NC_019678	GCTG	2	8	43453	43460	0 %	25 %	50 %	25 %	427733653
102	NC_019678	TTGG	2	8	43466	43473	0 %	50 %	50 %	0 %	427733653
103	NC_019678	AATC	2	8	44529	44536	50 %	25 %	0 %	25 %	427733654
104	NC_019678	AATT	2	8	45118	45125	50 %	50 %	0 %	0 %	427733654
105	NC_019678	GGAT	2	8	45776	45783	25 %	25 %	50 %	0 %	427733654
106	NC_019678	AATT	2	8	45981	45988	50 %	50 %	0 %	0 %	427733654
107	NC_019678	CAAT	2	8	45991	45998	50 %	25 %	0 %	25 %	427733654
108	NC_019678	AGCA	2	8	47528	47535	50 %	0 %	25 %	25 %	427733655
109	NC_019678	TTTA	2	8	47630	47637	25 %	75 %	0 %	0 %	427733655
110	NC_019678	AATA	2	8	47926	47933	75 %	25 %	0 %	0 %	427733656
111	NC_019678	AGTT	2	8	48871	48878	25 %	50 %	25 %	0 %	427733656
112	NC_019678	ACCT	2	8	49047	49054	25 %	25 %	0 %	50 %	427733656
113	NC_019678	AAAT	2	8	49201	49208	75 %	25 %	0 %	0 %	427733656
114	NC_019678	AATT	2	8	50092	50099	50 %	50 %	0 %	0 %	427733657
115	NC_019678	AATT	2	8	50185	50192	50 %	50 %	0 %	0 %	427733657
116	NC_019678	CGAG	2	8	50312	50319	25 %	0 %	50 %	25 %	427733657
117	NC_019678	TACT	2	8	51085	51092	25 %	50 %	0 %	25 %	427733658
118	NC_019678	ATTT	2	8	51857	51864	25 %	75 %	0 %	0 %	427733659
119	NC_019678	ATAC	2	8	52015	52022	50 %	25 %	0 %	25 %	427733659
120	NC_019678	TTCT	2	8	52135	52142	0 %	75 %	0 %	25 %	427733659
121	NC_019678	ATCC	2	8	52603	52610	25 %	25 %	0 %	50 %	427733660
122	NC_019678	AACC	2	8	52631	52638	50 %	0 %	0 %	50 %	427733660
123	NC_019678	ATTA	2	8	52657	52664	50 %	50 %	0 %	0 %	427733660
124	NC_019678	AATT	2	8	52801	52808	50 %	50 %	0 %	0 %	427733660
125	NC_019678	TTTA	2	8	53092	53099	25 %	75 %	0 %	0 %	427733660
126	NC_019678	GCAC	2	8	53177	53184	25 %	0 %	25 %	50 %	427733660
127	NC_019678	TCCA	2	8	53219	53226	25 %	25 %	0 %	50 %	427733660
128	NC_019678	AAGT	2	8	53513	53520	50 %	25 %	25 %	0 %	427733660
129	NC_019678	GTAA	2	8	53791	53798	50 %	25 %	25 %	0 %	427733660
130	NC_019678	CTTT	2	8	54890	54897	0 %	75 %	0 %	25 %	427733661
131	NC_019678	ATTT	2	8	54902	54909	25 %	75 %	0 %	0 %	427733661
132	NC_019678	TTGT	2	8	55595	55602	0 %	75 %	25 %	0 %	427733662
133	NC_019678	CAAG	2	8	55667	55674	50 %	0 %	25 %	25 %	427733662
134	NC_019678	GGAA	2	8	55865	55872	50 %	0 %	50 %	0 %	427733662
135	NC_019678	GTGG	2	8	55953	55960	0 %	25 %	75 %	0 %	427733662
136	NC_019678	TTAC	2	8	57792	57799	25 %	50 %	0 %	25 %	427733663
137	NC_019678	ATTT	2	8	58693	58700	25 %	75 %	0 %	0 %	427733664
138	NC_019678	TTTA	2	8	58889	58896	25 %	75 %	0 %	0 %	427733664
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