MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 22844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	ACG	2	6	16	21	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019678	GGT	2	6	35	40	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019678	AAT	2	6	1580	1585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019678	AAT	2	6	1625	1630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019678	CTT	2	6	1787	1792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019678	TTG	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019678	AGC	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019678	CTT	2	6	6495	6500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019678	TAG	2	6	6518	6523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019678	ATC	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019678	TAT	2	6	6589	6594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019678	AAT	2	6	7803	7808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019678	TTG	2	6	8255	8260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019678	GTT	2	6	8261	8266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019678	GTT	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019678	CAT	2	6	8997	9002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019678	TAA	2	6	10182	10187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019678	GCT	2	6	10280	10285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019678	TGC	2	6	10324	10329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019678	AAT	2	6	10361	10366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019678	GAG	2	6	10372	10377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019678	TCA	2	6	10403	10408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019678	CTA	2	6	10419	10424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019678	CCT	2	6	11682	11687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019678	GAA	2	6	11699	11704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019678	CTT	2	6	11904	11909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019678	TAC	2	6	11948	11953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019678	AAC	2	6	12235	12240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019678	TCT	2	6	12264	12269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019678	AGT	2	6	12273	12278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019678	AGA	2	6	12323	12328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019678	GTA	2	6	12336	12341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019678	ATT	2	6	15294	15299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019678	ATA	2	6	15465	15470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019678	ATT	2	6	15508	15513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019678	CTG	2	6	15518	15523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019678	ATT	2	6	17029	17034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019678	GTT	2	6	18359	18364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019678	GTT	2	6	18366	18371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019678	GTT	2	6	18373	18378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019678	ATT	2	6	19209	19214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019678	ATT	2	6	19237	19242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019678	TTA	2	6	19295	19300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019678	ATT	2	6	19337	19342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019678	ATC	2	6	21501	21506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019678	AAT	2	6	21517	21522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019678	CGC	2	6	21557	21562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019678	GCG	2	6	21584	21589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019678	ATA	2	6	22114	22119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019678	ATA	2	6	22216	22221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019678	GGT	2	6	22256	22261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019678	AGG	2	6	22277	22282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019678	CAC	2	6	22358	22363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_019678	ACC	2	6	22440	22445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019678	ATT	2	6	22518	22523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019678	CAG	2	6	22526	22531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019678	CTG	2	6	22562	22567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019678	CTA	2	6	22609	22614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019678	AAT	2	6	22660	22665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019678	GAA	2	6	22675	22680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019678	TAC	2	6	22698	22703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019678	TAA	2	6	22717	22722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019678	TAT	2	6	22809	22814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019678	GAA	2	6	22922	22927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019678	ATT	2	6	25081	25086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019678	ATT	2	6	25812	25817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019678	TAT	2	6	25834	25839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019678	AGA	2	6	27250	27255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019678	TCC	2	6	27499	27504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019678	AAT	2	6	29269	29274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019678	AGA	2	6	32573	32578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019678	CAA	2	6	33591	33596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019678	ATA	2	6	33615	33620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019678	ATT	2	6	36486	36491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019678	CAG	2	6	39504	39509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019678	ATC	2	6	40804	40809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019678	TCT	2	6	40832	40837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019678	TAA	2	6	40839	40844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019678	TAG	2	6	42262	42267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019678	TAG	2	6	42269	42274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019678	AGT	2	6	42345	42350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019678	GCT	2	6	42373	42378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019678	GCT	2	6	42408	42413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019678	GAG	3	9	43145	43153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019678	GTT	2	6	43723	43728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019678	TAA	2	6	43936	43941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019678	ATC	2	6	43987	43992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019678	AAG	2	6	46320	46325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019678	ATA	2	6	46388	46393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019678	ATA	2	6	46414	46419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019678	AGG	2	6	46452	46457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019678	CAA	2	6	46498	46503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019678	TAA	2	6	46571	46576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019678	TGC	2	6	46592	46597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019678	TAA	2	6	47774	47779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019678	GAG	2	6	50558	50563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019678	TTC	2	6	50598	50603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019678	TAA	2	6	51640	51645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019678	ATC	2	6	51702	51707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019678	GAT	2	6	51775	51780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019678	TAA	2	6	51845	51850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019678	TAT	2	6	52227	52232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019678	ATT	2	6	52260	52265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019678	ATA	2	6	52379	52384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019678	TAA	2	6	54533	54538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019678	AGT	2	6	54701	54706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019678	TAA	2	6	54828	54833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019678	TGA	2	6	56222	56227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019678	TAA	2	6	56248	56253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019678	CGA	2	6	56377	56382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019678	AAG	2	6	56385	56390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019678	AAT	2	6	56428	56433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019678	GTT	2	6	56485	56490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019678	GGA	2	6	56553	56558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019678	CTG	2	6	56684	56689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019678	CCA	2	6	56697	56702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_019678	GAT	2	6	56719	56724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019678	AAG	2	6	56856	56861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019678	GTT	2	6	56924	56929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019678	ATT	2	6	57099	57104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019678	AAT	2	6	57176	57181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019678	TTG	2	6	57215	57220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019678	GCT	2	6	57243	57248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019678	AGT	2	6	57341	57346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019678	TAA	2	6	57951	57956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019678	TTC	2	6	58031	58036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019678	CTT	2	6	58060	58065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019678	TAA	2	6	58067	58072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019678	TTA	2	6	58122	58127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019678	TCA	2	6	58146	58151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019678	CCA	2	6	58181	58186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019678	ATT	2	6	58205	58210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019678	TGT	2	6	58281	58286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019678	TTC	2	6	58334	58339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019678	CTG	2	6	58377	58382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019678	AGC	2	6	58461	58466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019678	AAT	2	6	59717	59722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019678	ACA	2	6	60522	60527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019678	ATA	2	6	60705	60710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019678	TTA	2	6	60810	60815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019678	AAC	2	6	60822	60827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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