MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 97998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733620
2	NC_019678	TTG	2	6	254	259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733620
3	NC_019678	TGC	2	6	456	461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733620
4	NC_019678	TGG	2	6	516	521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733620
5	NC_019678	AGC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733620
6	NC_019678	TAG	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733620
7	NC_019678	AGG	2	6	743	748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733620
8	NC_019678	AAG	2	6	779	784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733620
9	NC_019678	TAG	2	6	1142	1147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733620
10	NC_019678	CGA	2	6	1192	1197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733620
11	NC_019678	TGA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733620
12	NC_019678	ACA	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733620
13	NC_019678	GAA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733620
14	NC_019678	TGG	2	6	1284	1289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733620
15	NC_019678	TAC	2	6	1299	1304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733620
16	NC_019678	TGC	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733621
17	NC_019678	TGA	3	9	2134	2142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
18	NC_019678	GAA	2	6	2237	2242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733621
19	NC_019678	GTA	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
20	NC_019678	ATG	3	9	2460	2468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
21	NC_019678	CAG	2	6	2547	2552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733621
22	NC_019678	AGT	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
23	NC_019678	CAG	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733621
24	NC_019678	AAC	2	6	2706	2711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733621
25	NC_019678	GAT	2	6	2867	2872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733621
26	NC_019678	CAG	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733621
27	NC_019678	ACA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733621
28	NC_019678	GGA	2	6	2987	2992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733621
29	NC_019678	AAG	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733621
30	NC_019678	CAT	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
31	NC_019678	TAT	2	6	3206	3211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
32	NC_019678	CTT	2	6	3295	3300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
33	NC_019678	CTT	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
34	NC_019678	TAA	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
35	NC_019678	TGA	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
36	NC_019678	TCG	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
37	NC_019678	ATC	2	6	3734	3739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
38	NC_019678	TCT	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
39	NC_019678	ATT	2	6	3788	3793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
40	NC_019678	TCT	2	6	3837	3842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
41	NC_019678	TGA	2	6	3849	3854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
42	NC_019678	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
43	NC_019678	TTC	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
44	NC_019678	TGA	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
45	NC_019678	ATA	2	6	4135	4140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
46	NC_019678	CTC	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733622
47	NC_019678	TCA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
48	NC_019678	GAA	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733622
49	NC_019678	TTC	2	6	4355	4360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
50	NC_019678	GCG	2	6	4436	4441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733622
51	NC_019678	ACA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733622
52	NC_019678	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
53	NC_019678	GTG	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733622
54	NC_019678	TAC	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
55	NC_019678	TTA	2	6	4812	4817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
56	NC_019678	TCC	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733622
57	NC_019678	TCT	2	6	4842	4847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
58	NC_019678	CAC	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733622
59	NC_019678	TTG	2	6	4994	4999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
60	NC_019678	ACT	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
61	NC_019678	ATA	2	6	5062	5067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
62	NC_019678	GCT	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
63	NC_019678	TTG	2	6	5087	5092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
64	NC_019678	TTG	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
65	NC_019678	TGA	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
66	NC_019678	TGA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
67	NC_019678	TCT	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
68	NC_019678	CTG	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
69	NC_019678	ATC	2	6	5400	5405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
70	NC_019678	TGC	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
71	NC_019678	TGA	2	6	5466	5471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
72	NC_019678	CAT	2	6	5491	5496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
73	NC_019678	TTG	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
74	NC_019678	GTT	2	6	5575	5580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
75	NC_019678	ACC	2	6	5669	5674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733622
76	NC_019678	AGC	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733622
77	NC_019678	GCT	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733622
78	NC_019678	GTA	2	6	5740	5745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
79	NC_019678	TGT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
80	NC_019678	ATG	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
81	NC_019678	GTT	2	6	5920	5925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733622
82	NC_019678	TGA	2	6	5928	5933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733622
83	NC_019678	AGA	2	6	5951	5956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733622
84	NC_019678	TCT	2	6	6018	6023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733622
85	NC_019678	AAT	2	6	6026	6031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
86	NC_019678	TAA	2	6	6112	6117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
87	NC_019678	ATC	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
88	NC_019678	TAA	2	6	6167	6172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733622
89	NC_019678	TTA	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733622
90	NC_019678	CTA	2	6	6283	6288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733622
91	NC_019678	GAA	2	6	6315	6320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733622
92	NC_019678	ATC	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733623
93	NC_019678	TGC	2	6	6686	6691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733623
94	NC_019678	AAC	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733623
95	NC_019678	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733623
96	NC_019678	TTC	2	6	6929	6934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733623
97	NC_019678	CTT	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733623
98	NC_019678	CTT	2	6	7042	7047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733623
99	NC_019678	AAT	2	6	7052	7057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733623
100	NC_019678	CTA	3	9	7066	7074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733623
101	NC_019678	TCT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733623
102	NC_019678	CGC	2	6	7341	7346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733623
103	NC_019678	CCA	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733623
104	NC_019678	AAT	2	6	7412	7417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733623
105	NC_019678	CAT	3	9	7435	7443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733623
106	NC_019678	CTG	2	6	7631	7636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733623
107	NC_019678	AGC	3	9	7742	7750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733623
108	NC_019678	CAC	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733623
109	NC_019678	AAT	2	6	7911	7916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733624
110	NC_019678	ATC	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733624
111	NC_019678	CAT	2	6	8598	8603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733625
112	NC_019678	CAA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733625
113	NC_019678	ATC	2	6	8737	8742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733625
114	NC_019678	TGT	2	6	8762	8767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733625
115	NC_019678	AAT	2	6	8915	8920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733625
116	NC_019678	ATT	2	6	9134	9139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733626
117	NC_019678	AAT	2	6	9205	9210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733626
118	NC_019678	CTC	2	6	9221	9226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733626
119	NC_019678	CTT	2	6	9242	9247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733626
120	NC_019678	CAT	2	6	9290	9295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733626
121	NC_019678	TAT	2	6	9356	9361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733626
122	NC_019678	TTC	2	6	9530	9535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733626
123	NC_019678	AGA	2	6	9591	9596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733626
124	NC_019678	GCT	2	6	9701	9706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733626
125	NC_019678	CAA	2	6	9714	9719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733626
126	NC_019678	ATC	2	6	9726	9731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733626
127	NC_019678	ATT	2	6	9736	9741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733626
128	NC_019678	AAT	2	6	9748	9753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733626
129	NC_019678	AAT	2	6	9861	9866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733626
130	NC_019678	ATT	2	6	9903	9908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733626
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252	NC_019678	ATC	2	6	20044	20049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733634
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254	NC_019678	TTC	2	6	20182	20187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733634
255	NC_019678	TTC	2	6	20272	20277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733634
256	NC_019678	ACC	2	6	20281	20286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733634
257	NC_019678	TAC	2	6	20409	20414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733634
258	NC_019678	CAT	2	6	20529	20534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733634
259	NC_019678	GTT	2	6	20546	20551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733634
260	NC_019678	TCA	3	9	20552	20560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733634
261	NC_019678	GAG	3	9	20613	20621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733634
262	NC_019678	TAG	2	6	20655	20660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733634
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271	NC_019678	TCT	2	6	21173	21178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733634
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279	NC_019678	TAA	2	6	21815	21820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733635
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