MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 plasmid pNOS7524.01

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019677	ACCCC	2	10	305	314	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_019677	CTGCC	2	10	1461	1470	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_019677	AGGGT	2	10	2399	2408	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019677	TGCGC	2	10	4009	4018	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_019677	AATTA	2	10	7348	7357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019677	CACCC	2	10	7534	7543	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_019677	TCAAA	2	10	8229	8238	60 %	20 %	0 %	20 %	427726401
8	NC_019677	TCCCT	2	10	9602	9611	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_019677	TTTAA	2	10	13836	13845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019677	TTGGT	2	10	14200	14209	0 %	60 %	40 %	0 %	427726408
11	NC_019677	GTACC	2	10	16401	16410	20 %	20 %	20 %	40 %	427726414
12	NC_019677	TCGGG	2	10	16629	16638	0 %	20 %	60 %	20 %	427726414
13	NC_019677	AGTTC	2	10	18249	18258	20 %	40 %	20 %	20 %	427726416
14	NC_019677	CCCAC	2	10	18271	18280	20 %	0 %	0 %	80 %	427726416
15	NC_019677	ATGGA	2	10	21516	21525	40 %	20 %	40 %	0 %	427726419
16	NC_019677	ATTTT	2	10	22171	22180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019677	AACCA	2	10	22271	22280	60 %	0 %	0 %	40 %	427726421
18	NC_019677	AAACT	2	10	24627	24636	60 %	20 %	0 %	20 %	427726425
19	NC_019677	TAAAA	2	10	24752	24761	80 %	20 %	0 %	0 %	427726425
20	NC_019677	GGATA	2	10	26085	26094	40 %	20 %	40 %	0 %	427726426
21	NC_019677	ATGCT	2	10	26907	26916	20 %	40 %	20 %	20 %	427726427
22	NC_019677	AATCA	2	10	28488	28497	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019677	CTCGT	2	10	31730	31739	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019677	CTTAA	2	10	31898	31907	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_019677	TACTT	2	10	33533	33542	20 %	60 %	0 %	20 %	427726429
26	NC_019677	GCAGC	2	10	35155	35164	20 %	0 %	40 %	40 %	427726429
27	NC_019677	CCAAA	2	10	35576	35585	60 %	0 %	0 %	40 %	427726429
28	NC_019677	TTAGG	2	10	36324	36333	20 %	40 %	40 %	0 %	427726430
29	NC_019677	AGTTT	2	10	37934	37943	20 %	60 %	20 %	0 %	427726432
30	NC_019677	ACAAA	2	10	39875	39884	80 %	0 %	0 %	20 %	427726433
31	NC_019677	AGATG	2	10	42146	42155	40 %	20 %	40 %	0 %	427726435
32	NC_019677	CACAG	2	10	43730	43739	40 %	0 %	20 %	40 %	427726436
33	NC_019677	GGAAA	2	10	44508	44517	60 %	0 %	40 %	0 %	427726438
34	NC_019677	ATTTT	2	10	48529	48538	20 %	80 %	0 %	0 %	427726444
35	NC_019677	GTTTT	2	10	49709	49718	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019677	CTTTT	2	10	49844	49853	0 %	80 %	0 %	20 %	427726447
37	NC_019677	AATCA	2	10	53650	53659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_019677	TAATA	2	10	53692	53701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019677	CATCT	2	10	54611	54620	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019677	GGTCA	2	10	58382	58391	20 %	20 %	40 %	20 %	427726456
41	NC_019677	GGTTG	2	10	58392	58401	0 %	40 %	60 %	0 %	427726456
42	NC_019677	GTCTG	2	10	59365	59374	0 %	40 %	40 %	20 %	427726458
43	NC_019677	CAGTT	2	10	59487	59496	20 %	40 %	20 %	20 %	427726459
44	NC_019677	AACAA	2	10	60461	60470	80 %	0 %	0 %	20 %	427726462
45	NC_019677	ATTAT	2	10	60847	60856	40 %	60 %	0 %	0 %	427726462
46	NC_019677	CAAGC	2	10	62104	62113	40 %	0 %	20 %	40 %	427726464
47	NC_019677	ACATG	2	10	63741	63750	40 %	20 %	20 %	20 %	427726467
48	NC_019677	TGCGC	2	10	64181	64190	0 %	20 %	40 %	40 %	427726468
49	NC_019677	TGTAA	2	10	64730	64739	40 %	40 %	20 %	0 %	427726468
50	NC_019677	GATTG	2	10	64869	64878	20 %	40 %	40 %	0 %	427726469
51	NC_019677	GATTT	2	10	67012	67021	20 %	60 %	20 %	0 %	427726471
52	NC_019677	TCATC	2	10	67637	67646	20 %	40 %	0 %	40 %	427726471
53	NC_019677	GTTGC	2	10	68724	68733	0 %	40 %	40 %	20 %	427726472
54	NC_019677	ATTGA	2	10	68975	68984	40 %	40 %	20 %	0 %	427726472
55	NC_019677	CTTGG	2	10	69820	69829	0 %	40 %	40 %	20 %	427726473
56	NC_019677	CAATC	2	10	70486	70495	40 %	20 %	0 %	40 %	427726473
57	NC_019677	CGCAC	2	10	73346	73355	20 %	0 %	20 %	60 %	427726475
58	NC_019677	AAAAT	2	10	77098	77107	80 %	20 %	0 %	0 %	427726479

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.