MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 plasmid pNOS7524.01

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019677	AAAG	2	8	123	130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019677	CCAT	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019677	GCTT	2	8	883	890	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019677	GCTT	2	8	1906	1913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019677	GCTT	2	8	2369	2376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019677	GACA	2	8	2978	2985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019677	ATTT	2	8	3028	3035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019677	TGCT	2	8	3056	3063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019677	GAAC	2	8	3578	3585	50 %	0 %	25 %	25 %	427726396
10	NC_019677	TAAC	2	8	3633	3640	50 %	25 %	0 %	25 %	427726396
11	NC_019677	GGTA	2	8	3677	3684	25 %	25 %	50 %	0 %	427726396
12	NC_019677	TTGG	2	8	4428	4435	0 %	50 %	50 %	0 %	427726397
13	NC_019677	ACTA	2	8	4985	4992	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019677	ATTG	2	8	5684	5691	25 %	50 %	25 %	0 %	427726398
15	NC_019677	TTTG	2	8	5942	5949	0 %	75 %	25 %	0 %	427726398
16	NC_019677	CTAT	2	8	5953	5960	25 %	50 %	0 %	25 %	427726398
17	NC_019677	TTTG	2	8	6487	6494	0 %	75 %	25 %	0 %	427726398
18	NC_019677	TTAC	2	8	6746	6753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019677	AAAG	2	8	6872	6879	75 %	0 %	25 %	0 %	427726399
20	NC_019677	GTTA	2	8	7650	7657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019677	TCCT	2	8	7750	7757	0 %	50 %	0 %	50 %	427726400
22	NC_019677	TTGG	2	8	8477	8484	0 %	50 %	50 %	0 %	427726401
23	NC_019677	AACA	2	8	8661	8668	75 %	0 %	0 %	25 %	427726401
24	NC_019677	CATC	2	8	8741	8748	25 %	25 %	0 %	50 %	427726402
25	NC_019677	GTTA	2	8	8896	8903	25 %	50 %	25 %	0 %	427726402
26	NC_019677	AGTT	2	8	9237	9244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019677	TATT	2	8	9370	9377	25 %	75 %	0 %	0 %	427726403
28	NC_019677	AAAT	2	8	9467	9474	75 %	25 %	0 %	0 %	427726403
29	NC_019677	CTCA	2	8	10912	10919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019677	TTGC	2	8	11558	11565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_019677	TAGC	2	8	13058	13065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019677	TAAA	2	8	13077	13084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019677	AAAT	2	8	13420	13427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019677	CAAT	2	8	14796	14803	50 %	25 %	0 %	25 %	427726409
35	NC_019677	ATGA	2	8	15407	15414	50 %	25 %	25 %	0 %	427726411
36	NC_019677	GAAA	2	8	15645	15652	75 %	0 %	25 %	0 %	427726412
37	NC_019677	TGAA	2	8	15828	15835	50 %	25 %	25 %	0 %	427726412
38	NC_019677	AACT	2	8	16056	16063	50 %	25 %	0 %	25 %	427726413
39	NC_019677	AATC	2	8	16582	16589	50 %	25 %	0 %	25 %	427726414
40	NC_019677	CAAA	2	8	16921	16928	75 %	0 %	0 %	25 %	427726414
41	NC_019677	CTGC	2	8	17288	17295	0 %	25 %	25 %	50 %	427726414
42	NC_019677	GTTG	2	8	17609	17616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019677	TGAG	2	8	17636	17643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019677	TACA	2	8	17765	17772	50 %	25 %	0 %	25 %	427726415
45	NC_019677	TTTG	2	8	17989	17996	0 %	75 %	25 %	0 %	427726415
46	NC_019677	TGGG	2	8	18721	18728	0 %	25 %	75 %	0 %	427726416
47	NC_019677	GTCA	2	8	18737	18744	25 %	25 %	25 %	25 %	427726416
48	NC_019677	GATA	2	8	19541	19548	50 %	25 %	25 %	0 %	427726417
49	NC_019677	ACAG	2	8	19655	19662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019677	AGAA	2	8	19753	19760	75 %	0 %	25 %	0 %	427726418
51	NC_019677	CACT	2	8	19902	19909	25 %	25 %	0 %	50 %	427726418
52	NC_019677	TCTA	2	8	19921	19928	25 %	50 %	0 %	25 %	427726418
53	NC_019677	TATT	2	8	20579	20586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019677	AGGT	2	8	21256	21263	25 %	25 %	50 %	0 %	427726419
55	NC_019677	GAAT	2	8	21593	21600	50 %	25 %	25 %	0 %	427726419
56	NC_019677	TAAA	2	8	21728	21735	75 %	25 %	0 %	0 %	427726420
57	NC_019677	GCTT	2	8	22083	22090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_019677	ATCA	2	8	22404	22411	50 %	25 %	0 %	25 %	427726421
59	NC_019677	ACCT	2	8	23738	23745	25 %	25 %	0 %	50 %	427726423
60	NC_019677	ATCA	2	8	23802	23809	50 %	25 %	0 %	25 %	427726423
61	NC_019677	TCTT	2	8	23817	23824	0 %	75 %	0 %	25 %	427726423
62	NC_019677	TTCA	2	8	24086	24093	25 %	50 %	0 %	25 %	427726424
63	NC_019677	CCAA	2	8	24316	24323	50 %	0 %	0 %	50 %	427726424
64	NC_019677	GAAT	2	8	24796	24803	50 %	25 %	25 %	0 %	427726425
65	NC_019677	TAAT	2	8	25209	25216	50 %	50 %	0 %	0 %	427726425
66	NC_019677	ATTG	2	8	26203	26210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019677	AGAA	2	8	26382	26389	75 %	0 %	25 %	0 %	427726427
68	NC_019677	TTAT	2	8	26527	26534	25 %	75 %	0 %	0 %	427726427
69	NC_019677	AAAG	2	8	26701	26708	75 %	0 %	25 %	0 %	427726427
70	NC_019677	TAGC	2	8	26751	26758	25 %	25 %	25 %	25 %	427726427
71	NC_019677	TTAA	2	8	27086	27093	50 %	50 %	0 %	0 %	427726427
72	NC_019677	GAAA	2	8	27165	27172	75 %	0 %	25 %	0 %	427726427
73	NC_019677	TGTA	2	8	27341	27348	25 %	50 %	25 %	0 %	427726428
74	NC_019677	CCAA	2	8	29012	29019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019677	TTTG	2	8	29617	29624	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019677	CGAT	2	8	29698	29705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019677	AAAT	2	8	30039	30046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019677	ATCT	2	8	30781	30788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_019677	ATAA	2	8	32530	32537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019677	AATT	2	8	33055	33062	50 %	50 %	0 %	0 %	427726429
81	NC_019677	AATT	2	8	33424	33431	50 %	50 %	0 %	0 %	427726429
82	NC_019677	TATC	2	8	33483	33490	25 %	50 %	0 %	25 %	427726429
83	NC_019677	GGTT	2	8	33828	33835	0 %	50 %	50 %	0 %	427726429
84	NC_019677	AGAA	2	8	33997	34004	75 %	0 %	25 %	0 %	427726429
85	NC_019677	GATA	2	8	34544	34551	50 %	25 %	25 %	0 %	427726429
86	NC_019677	GTTG	2	8	34593	34600	0 %	50 %	50 %	0 %	427726429
87	NC_019677	ATTA	2	8	34652	34659	50 %	50 %	0 %	0 %	427726429
88	NC_019677	AACT	2	8	34855	34862	50 %	25 %	0 %	25 %	427726429
89	NC_019677	CTCA	2	8	34938	34945	25 %	25 %	0 %	50 %	427726429
90	NC_019677	ACAT	2	8	35258	35265	50 %	25 %	0 %	25 %	427726429
91	NC_019677	TTAA	2	8	35665	35672	50 %	50 %	0 %	0 %	427726429
92	NC_019677	AGGA	2	8	36204	36211	50 %	0 %	50 %	0 %	427726430
93	NC_019677	TACA	2	8	36825	36832	50 %	25 %	0 %	25 %	427726431
94	NC_019677	TTCC	2	8	36900	36907	0 %	50 %	0 %	50 %	427726431
95	NC_019677	ATCT	2	8	37841	37848	25 %	50 %	0 %	25 %	427726432
96	NC_019677	TAAT	2	8	38071	38078	50 %	50 %	0 %	0 %	427726433
97	NC_019677	AATT	2	8	38935	38942	50 %	50 %	0 %	0 %	427726433
98	NC_019677	GTCC	2	8	39057	39064	0 %	25 %	25 %	50 %	427726433
99	NC_019677	ATTA	2	8	39335	39342	50 %	50 %	0 %	0 %	427726433
100	NC_019677	TAGT	2	8	39604	39611	25 %	50 %	25 %	0 %	427726433
101	NC_019677	GTAG	2	8	39762	39769	25 %	25 %	50 %	0 %	427726433
102	NC_019677	ACCA	2	8	40257	40264	50 %	0 %	0 %	50 %	427726434
103	NC_019677	ACAA	2	8	40489	40496	75 %	0 %	0 %	25 %	427726434
104	NC_019677	CAAT	2	8	41057	41064	50 %	25 %	0 %	25 %	427726434
105	NC_019677	TCAA	2	8	41160	41167	50 %	25 %	0 %	25 %	427726434
106	NC_019677	AGTT	2	8	41454	41461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019677	CCAA	2	8	41571	41578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019677	ATAG	2	8	42243	42250	50 %	25 %	25 %	0 %	427726435
109	NC_019677	TTAA	2	8	43086	43093	50 %	50 %	0 %	0 %	427726435
110	NC_019677	ATCC	2	8	44407	44414	25 %	25 %	0 %	50 %	427726438
111	NC_019677	AGCC	2	8	44804	44811	25 %	0 %	25 %	50 %	427726439
112	NC_019677	AGAA	2	8	45239	45246	75 %	0 %	25 %	0 %	427726440
113	NC_019677	TTTA	2	8	45438	45445	25 %	75 %	0 %	0 %	427726440
114	NC_019677	TACT	2	8	45564	45571	25 %	50 %	0 %	25 %	427726440
115	NC_019677	AATT	2	8	45591	45598	50 %	50 %	0 %	0 %	427726440
116	NC_019677	ACCG	2	8	45624	45631	25 %	0 %	25 %	50 %	427726440
117	NC_019677	AATC	2	8	45704	45711	50 %	25 %	0 %	25 %	427726440
118	NC_019677	ATAA	2	8	45762	45769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019677	GAAA	2	8	46174	46181	75 %	0 %	25 %	0 %	427726442
120	NC_019677	AATA	2	8	46650	46657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019677	TTAC	2	8	46949	46956	25 %	50 %	0 %	25 %	427726443
122	NC_019677	TATC	2	8	46994	47001	25 %	50 %	0 %	25 %	427726443
123	NC_019677	TAAC	2	8	47445	47452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_019677	GAAA	2	8	47480	47487	75 %	0 %	25 %	0 %	427726444
125	NC_019677	CAAA	2	8	48604	48611	75 %	0 %	0 %	25 %	427726444
126	NC_019677	ATTG	2	8	48672	48679	25 %	50 %	25 %	0 %	427726444
127	NC_019677	ACCA	2	8	48771	48778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019677	TACT	2	8	48813	48820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019677	ATTG	2	8	49278	49285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019677	TTTC	2	8	49570	49577	0 %	75 %	0 %	25 %	427726446
131	NC_019677	ACTT	2	8	49728	49735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019677	TCTG	2	8	50085	50092	0 %	50 %	25 %	25 %	427726447
133	NC_019677	AATC	2	8	50101	50108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019677	AAAG	2	8	50134	50141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019677	ATTT	2	8	50172	50179	25 %	75 %	0 %	0 %	427726448
136	NC_019677	ATTG	2	8	50241	50248	25 %	50 %	25 %	0 %	427726448
137	NC_019677	TCCA	2	8	50518	50525	25 %	25 %	0 %	50 %	427726448
138	NC_019677	TCAT	2	8	51750	51757	25 %	50 %	0 %	25 %	427726449
139	NC_019677	TGAT	2	8	52226	52233	25 %	50 %	25 %	0 %	427726449
140	NC_019677	TCGC	2	8	52926	52933	0 %	25 %	25 %	50 %	427726450
141	NC_019677	TCGG	2	8	53042	53049	0 %	25 %	50 %	25 %	427726450
142	NC_019677	TGGG	2	8	53123	53130	0 %	25 %	75 %	0 %	427726450
143	NC_019677	TGCT	2	8	53621	53628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.