MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 plasmid pNOS7524.01

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019677	AAAG	2	8	123	130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019677	CCAT	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019677	GCTT	2	8	883	890	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019677	GCTT	2	8	1906	1913	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019677	GCTT	2	8	2369	2376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_019677	GACA	2	8	2978	2985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019677	ATTT	2	8	3028	3035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019677	TGCT	2	8	3056	3063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019677	ACTA	2	8	4985	4992	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019677	TTAC	2	8	6746	6753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019677	GTTA	2	8	7650	7657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019677	AGTT	2	8	9237	9244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019677	CTCA	2	8	10912	10919	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019677	TTGC	2	8	11558	11565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019677	TAGC	2	8	13058	13065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019677	TAAA	2	8	13077	13084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019677	AAAT	2	8	13420	13427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019677	GTTG	2	8	17609	17616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019677	TGAG	2	8	17636	17643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019677	ACAG	2	8	19655	19662	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019677	TATT	2	8	20579	20586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019677	GCTT	2	8	22083	22090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019677	ATTG	2	8	26203	26210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019677	CCAA	2	8	29012	29019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019677	TTTG	2	8	29617	29624	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019677	CGAT	2	8	29698	29705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019677	AAAT	2	8	30039	30046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019677	ATCT	2	8	30781	30788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019677	ATAA	2	8	32530	32537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019677	AGTT	2	8	41454	41461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019677	CCAA	2	8	41571	41578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019677	ATAA	2	8	45762	45769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019677	AATA	2	8	46650	46657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019677	TAAC	2	8	47445	47452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019677	ACCA	2	8	48771	48778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019677	TACT	2	8	48813	48820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019677	ATTG	2	8	49278	49285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019677	ACTT	2	8	49728	49735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019677	AATC	2	8	50101	50108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019677	AAAG	2	8	50134	50141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019677	TGCT	2	8	53621	53628	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019677	GAGT	2	8	54678	54685	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019677	AGTT	2	8	61693	61700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019677	GTTA	2	8	63984	63991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019677	GTGA	2	8	64098	64105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019677	ATTA	2	8	65506	65513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019677	TCTG	2	8	70971	70978	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_019677	TAAT	3	12	71488	71499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019677	AAGC	2	8	75591	75598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.