MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7524 plasmid pNOS7524.01

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019677	TTG	2	6	167	172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019677	CCA	2	6	198	203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019677	CCT	2	6	217	222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_019677	TGG	2	6	263	268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019677	GGA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019677	AGA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019677	CAG	2	6	611	616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019677	GCT	2	6	1082	1087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019677	GGC	2	6	1155	1160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019677	TGG	2	6	1199	1204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019677	GCC	2	6	1423	1428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019677	TCT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019677	GTC	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019677	GAC	2	6	1727	1732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019677	CTA	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019677	GCT	2	6	1975	1980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019677	GCC	2	6	1985	1990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_019677	GGC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019677	AGC	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019677	CGG	2	6	2426	2431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019677	AAC	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019677	GTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019677	GAT	2	6	2945	2950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019677	TAC	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019677	TAC	2	6	3137	3142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019677	TCG	2	6	3181	3186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019677	AAG	2	6	3796	3801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019677	TTG	2	6	3994	3999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019677	TGG	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019677	GTA	2	6	4059	4064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019677	AAT	2	6	4086	4091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019677	GTA	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019677	ATA	2	6	4588	4593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019677	ACT	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019677	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019677	CTT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019677	CAT	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019677	TTG	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019677	TTG	2	6	4911	4916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019677	ACT	2	6	6652	6657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019677	TTG	2	6	6720	6725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019677	AGG	2	6	6754	6759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019677	CAC	2	6	6809	6814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019677	TTA	2	6	7295	7300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019677	AAG	2	6	7312	7317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019677	GAA	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019677	TGG	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019677	AGC	2	6	7384	7389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019677	AGC	2	6	7394	7399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019677	CAG	2	6	7422	7427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019677	TAT	2	6	7431	7436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019677	AAT	2	6	7460	7465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019677	TCT	2	6	7508	7513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019677	ACC	2	6	7676	7681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019677	TGT	2	6	7693	7698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019677	ATG	2	6	9098	9103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019677	ATC	2	6	9487	9492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019677	TAA	2	6	9511	9516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019677	TAT	2	6	9529	9534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019677	CCA	2	6	9661	9666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019677	TGG	2	6	9678	9683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019677	AGG	2	6	9693	9698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019677	CCT	2	6	9736	9741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_019677	CTT	2	6	9751	9756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019677	GAT	2	6	9773	9778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019677	AAT	2	6	10104	10109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019677	AAT	2	6	10730	10735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019677	GGT	2	6	10746	10751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019677	CTG	2	6	10765	10770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019677	ATT	2	6	10773	10778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019677	CTG	2	6	10786	10791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019677	TTG	2	6	10839	10844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019677	TTC	2	6	10860	10865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019677	GAT	2	6	11281	11286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019677	GCA	2	6	11338	11343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019677	ATC	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019677	TGT	2	6	11350	11355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019677	AAT	2	6	11395	11400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019677	GAG	2	6	11611	11616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019677	TTG	2	6	11641	11646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019677	CAC	2	6	11713	11718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_019677	TTC	2	6	11905	11910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019677	GAA	2	6	11979	11984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019677	TCA	2	6	12052	12057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019677	TTA	2	6	12061	12066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019677	TAT	2	6	12120	12125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019677	AGC	2	6	12211	12216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019677	CAC	2	6	12791	12796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_019677	CTT	2	6	13213	13218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019677	CAT	2	6	13436	13441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019677	CAC	2	6	13556	13561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_019677	CAC	2	6	13651	13656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_019677	GAT	2	6	13830	13835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019677	TTA	2	6	14006	14011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019677	AGG	2	6	14048	14053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019677	CAA	2	6	14065	14070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019677	TTA	2	6	14546	14551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019677	GCT	2	6	14590	14595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019677	TCA	2	6	15238	15243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019677	CAC	2	6	15952	15957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_019677	TCA	5	15	16327	16341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019677	ACT	2	6	16356	16361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019677	TCT	2	6	18793	18798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019677	ATG	2	6	18919	18924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019677	TGT	2	6	18943	18948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019677	CTC	2	6	18994	18999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_019677	AGA	2	6	19015	19020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019677	ATG	2	6	19158	19163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019677	ATT	2	6	19634	19639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019677	ATA	2	6	20737	20742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019677	TGA	2	6	20782	20787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019677	TAG	2	6	20793	20798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019677	GCG	2	6	20850	20855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019677	CAG	2	6	21021	21026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019677	TCA	2	6	21058	21063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019677	AAT	2	6	21089	21094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019677	CTG	2	6	22127	22132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019677	TAA	2	6	22242	22247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019677	TAA	2	6	22249	22254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019677	CGG	2	6	22630	22635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019677	CAT	2	6	23300	23305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019677	TGA	2	6	23343	23348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019677	GCT	2	6	23392	23397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019677	TAA	2	6	25827	25832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019677	CAT	2	6	25888	25893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019677	TGA	2	6	26237	26242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019677	TCA	2	6	26319	26324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019677	TTG	2	6	27679	27684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019677	GGT	2	6	27732	27737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019677	GAT	2	6	27866	27871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019677	AGA	2	6	27939	27944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019677	AGG	2	6	28068	28073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019677	AGC	2	6	28079	28084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019677	CAG	2	6	28657	28662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019677	GTT	2	6	28726	28731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019677	GTA	2	6	28796	28801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019677	CTT	2	6	28863	28868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019677	TTA	2	6	28871	28876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019677	ATC	2	6	29173	29178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019677	AAT	2	6	29300	29305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019677	TGC	2	6	29319	29324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019677	CTC	2	6	29462	29467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.