MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobium gracile PCC 6307 chromosome

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019675	CGGTCC	2	12	18595	18606	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019675	CGCCGG	2	12	50806	50817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019675	CCTGAG	2	12	112642	112653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019675	AGGTTC	2	12	138039	138050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019675	TCGTAG	2	12	139084	139095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019675	ATCTCG	2	12	141069	141080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019675	CAATAA	2	12	149070	149081	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019675	CTCCTG	2	12	150516	150527	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019675	GGTGAG	2	12	165720	165731	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019675	GTGACT	2	12	165816	165827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019675	CACGGC	2	12	170839	170850	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019675	CGGCTG	2	12	233407	233418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019675	CGGTGG	2	12	235237	235248	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019675	CCAGGA	2	12	235793	235804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019675	TGTGAA	2	12	236060	236071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019675	GAGGGG	2	12	267880	267891	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019675	AACCTG	2	12	282806	282817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019675	CGGTGG	2	12	291560	291571	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019675	CACGGC	2	12	292233	292244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_019675	ACCACT	2	12	320301	320312	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_019675	TTGGCC	2	12	348366	348377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019675	TCCGTC	2	12	572806	572817	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019675	GCTTCG	2	12	656622	656633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019675	ATTCCC	2	12	663473	663484	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019675	CGATGG	2	12	669131	669142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_019675	CCCAGG	2	12	724148	724159	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019675	CCAGCC	2	12	810026	810037	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019675	CGGGCG	2	12	843341	843352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019675	CCAGGG	2	12	850585	850596	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019675	TGGCGG	2	12	855809	855820	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019675	GGACCC	2	12	855913	855924	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019675	CCGGGG	2	12	872646	872657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019675	AGGTCA	2	12	882240	882251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_019675	CACCGA	2	12	885685	885696	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019675	TTCCCT	2	12	889751	889762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019675	GGGGTG	2	12	897233	897244	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019675	GCAAGG	2	12	913750	913761	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019675	GGGCCA	2	12	938672	938683	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019675	GGCGCC	2	12	960041	960052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019675	CGATGC	2	12	965944	965955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019675	CTCCGA	2	12	998280	998291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019675	CAGCGG	2	12	1009240	1009251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019675	GGTGAG	2	12	1047306	1047317	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019675	CCCGAC	2	12	1161987	1161998	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_019675	CGGCCA	2	12	1254177	1254188	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019675	CAGGAA	2	12	1254516	1254527	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019675	CGGGTC	2	12	1329960	1329971	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019675	CGTCCG	2	12	1338826	1338837	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019675	AGCCGC	2	12	1403232	1403243	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019675	GGCGAA	2	12	1442747	1442758	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019675	CACTGT	2	12	1461573	1461584	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019675	GTTGCT	2	12	1518842	1518853	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019675	CCCGGG	2	12	1528807	1528818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019675	GCCCTG	2	12	1529676	1529687	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_019675	TTTCGC	2	12	1583137	1583148	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019675	GCTCTC	2	12	1586700	1586711	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019675	CGGCCG	2	12	1617994	1618005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019675	CGTCCA	2	12	1618858	1618869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019675	GCCCCC	2	12	1697771	1697782	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
60	NC_019675	CGCATG	2	12	1697823	1697834	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019675	CTCATG	2	12	1701300	1701311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019675	TGCCCG	2	12	1701614	1701625	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019675	GCCAGG	2	12	1701963	1701974	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019675	GCCCCC	2	12	1704506	1704517	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
65	NC_019675	CGCATG	2	12	1704558	1704569	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019675	AATTCA	2	12	1707561	1707572	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019675	TGGCGG	2	12	1722885	1722896	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019675	TTCCCC	2	12	1766159	1766170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019675	TCAGGA	2	12	1806382	1806393	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019675	CTGTCT	2	12	1819848	1819859	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019675	TGAAGT	2	12	1825282	1825293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019675	GCCTCG	2	12	1836950	1836961	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019675	GGCCCT	2	12	1853995	1854006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019675	GGTACC	2	12	1910792	1910803	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019675	CTTCAA	2	12	1920129	1920140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019675	GGTGAA	2	12	1924231	1924242	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019675	GCCCTG	2	12	1938553	1938564	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019675	GTCTTT	2	12	1942578	1942589	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_019675	CCCTGA	2	12	1942867	1942878	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019675	GTCGCC	2	12	1947861	1947872	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019675	CCAAGC	2	12	2034120	2034131	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019675	TGCCGC	2	12	2058883	2058894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_019675	CAAGTA	2	12	2063747	2063758	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019675	TGGCGG	2	12	2072936	2072947	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019675	CGCCAC	2	12	2099230	2099241	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019675	GCGTCG	2	12	2103032	2103043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019675	GAGCAG	2	12	2107585	2107596	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019675	GGCGAT	2	12	2164946	2164957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019675	GGGAGG	2	12	2167038	2167049	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019675	CCTGGG	2	12	2245460	2245471	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019675	TCCATT	2	12	2299922	2299933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019675	CATGGT	2	12	2400252	2400263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019675	CAGGTG	2	12	2411011	2411022	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019675	GAAGGT	2	12	2416400	2416411	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019675	CTGCTC	2	12	2416563	2416574	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019675	GGCCCC	2	12	2429885	2429896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019675	TCAGGA	2	12	2448425	2448436	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019675	GCAACG	2	12	2479084	2479095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019675	GGGTTC	2	12	2491169	2491180	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_019675	GGCAGG	2	12	2525012	2525023	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019675	GCCAGA	2	12	2531604	2531615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019675	CGGCGC	2	12	2532242	2532253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019675	GCGGTT	2	12	2532860	2532871	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019675	CTCATG	2	12	2539182	2539193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019675	GCCGGC	2	12	2539453	2539464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019675	TGACTA	2	12	2567000	2567011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019675	GGCCGC	2	12	2576628	2576639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_019675	GCTCCT	2	12	2577262	2577273	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_019675	CACACT	7	42	2583367	2583408	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019675	CACACC	2	12	2583409	2583420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_019675	CCCAGG	2	12	2766792	2766803	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019675	GCCCCC	2	12	2780902	2780913	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
113	NC_019675	GCCGTC	2	12	2854730	2854741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019675	CGGCAG	2	12	2854855	2854866	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019675	CTGGTC	2	12	2863729	2863740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019675	TCCCGT	2	12	2867693	2867704	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_019675	CAGGGC	2	12	2896487	2896498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019675	GGAAGC	2	12	2955175	2955186	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019675	TTCGGT	2	12	2993088	2993099	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019675	CGATGG	2	12	3071291	3071302	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_019675	GGCCGG	2	12	3073655	3073666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019675	CTGGCG	2	12	3106900	3106911	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019675	TTCACA	2	12	3130948	3130959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019675	CCGCCA	2	12	3131181	3131192	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019675	CGCCAC	2	12	3155309	3155320	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019675	CCAGCG	2	12	3163525	3163536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019675	GGGGGC	2	12	3169861	3169872	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019675	CGGCCC	2	12	3179656	3179667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_019675	GGAGCG	2	12	3186671	3186682	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019675	CCGCCA	2	12	3190517	3190528	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_019675	GTGCCC	2	12	3203937	3203948	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019675	TCTCCT	2	12	3219316	3219327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019675	GGCAGG	2	12	3229321	3229332	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_019675	GCTGGA	2	12	3229361	3229372	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_019675	CTCACC	2	12	3254849	3254860	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019675	ATAAGT	2	12	3259241	3259252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019675	CATGAA	2	12	3259279	3259290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_019675	CGGCTG	2	12	3279199	3279210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019675	GCCGCA	2	12	3291366	3291377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019675	CGGGGC	2	12	3329996	3330007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.