MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanobium gracile PCC 6307 chromosome

Total Repeats: 1156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019675	CGGG	2	8	8408	8415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019675	GTGG	2	8	13389	13396	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019675	AAGC	2	8	15362	15369	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_019675	TCCG	2	8	16884	16891	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019675	GCCG	2	8	17635	17642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019675	CGGC	2	8	18613	18620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_019675	GATC	2	8	18949	18956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019675	GTGG	2	8	19091	19098	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019675	CCAT	2	8	27879	27886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019675	AGGC	2	8	29987	29994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019675	AGGA	2	8	34833	34840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019675	CCCT	2	8	48434	48441	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_019675	CCGC	2	8	48518	48525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_019675	GCCC	2	8	48550	48557	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_019675	CGGG	2	8	50754	50761	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019675	GCAC	2	8	62297	62304	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019675	CCGC	2	8	62305	62312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_019675	GCGG	2	8	65429	65436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019675	GAGG	2	8	65730	65737	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019675	GACG	2	8	65771	65778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019675	TCCC	2	8	70262	70269	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_019675	ATCC	2	8	78565	78572	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019675	CATC	2	8	78575	78582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019675	CCCG	2	8	78643	78650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_019675	CGCC	2	8	78755	78762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_019675	CCGC	2	8	84274	84281	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_019675	CGGA	2	8	84294	84301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019675	GGGA	2	8	87451	87458	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019675	TCGG	2	8	87559	87566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_019675	CACG	2	8	91185	91192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019675	GGCG	2	8	92287	92294	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019675	TCCT	2	8	96101	96108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019675	GCCT	2	8	96772	96779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019675	GGCT	2	8	96981	96988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019675	GGGC	2	8	97006	97013	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019675	AGGC	2	8	98425	98432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_019675	GCCC	2	8	102161	102168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_019675	TGGG	2	8	102438	102445	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019675	GCCG	2	8	102906	102913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_019675	GGCT	2	8	110600	110607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019675	AATC	3	12	110790	110801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_019675	CAAG	2	8	110864	110871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019675	TGAA	2	8	111180	111187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019675	GCAG	2	8	111379	111386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019675	TTCA	2	8	111438	111445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_019675	CAGC	2	8	112383	112390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019675	CAGC	2	8	112671	112678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019675	AACC	2	8	113559	113566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_019675	AGCT	2	8	113642	113649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019675	GCCA	2	8	113708	113715	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019675	CAGC	2	8	113763	113770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019675	TGGA	2	8	113830	113837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019675	CCAG	2	8	116385	116392	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019675	GGGT	2	8	118864	118871	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019675	TGGA	2	8	119123	119130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019675	ATGG	2	8	122376	122383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019675	ATGA	2	8	123903	123910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019675	AACG	2	8	123930	123937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019675	CTAA	2	8	124026	124033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_019675	GGCC	2	8	124432	124439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019675	TCAG	2	8	124533	124540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019675	CGAC	2	8	125933	125940	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019675	ACCA	2	8	135390	135397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_019675	AGGA	2	8	136979	136986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019675	CACC	2	8	137170	137177	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_019675	GCAG	2	8	137347	137354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019675	CTTA	2	8	137458	137465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019675	CGAT	2	8	137673	137680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019675	TGGG	2	8	138309	138316	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019675	TCAA	2	8	139972	139979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019675	GCAA	2	8	140361	140368	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019675	AGGA	2	8	140546	140553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019675	TCCA	2	8	147511	147518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_019675	CGGG	2	8	148111	148118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019675	CCAT	2	8	148702	148709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019675	GATT	2	8	149936	149943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019675	GTAA	2	8	150054	150061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019675	ACCC	2	8	150441	150448	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_019675	TGGC	2	8	150567	150574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019675	CAGC	2	8	151049	151056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019675	TGCC	2	8	155701	155708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019675	CACC	2	8	157625	157632	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_019675	GGAG	2	8	158093	158100	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019675	TCTT	2	8	158242	158249	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_019675	CAAT	2	8	159613	159620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019675	ATCG	2	8	159634	159641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_019675	TTTC	2	8	161099	161106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019675	CGGA	2	8	161859	161866	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019675	TCGA	2	8	161885	161892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019675	GTTG	2	8	162046	162053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019675	CCCG	3	12	163491	163502	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_019675	CCAG	2	8	164219	164226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019675	CGAT	2	8	166006	166013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_019675	CTTC	2	8	169208	169215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019675	CAGC	2	8	169456	169463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_019675	TATT	2	8	169750	169757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019675	CGGT	2	8	170427	170434	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019675	GGCC	2	8	170590	170597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019675	AGGC	2	8	170617	170624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019675	CACG	2	8	170735	170742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019675	CCGG	2	8	170811	170818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019675	GGGT	2	8	173152	173159	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019675	TGGG	2	8	173204	173211	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019675	CCAT	2	8	173692	173699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_019675	GAGG	2	8	174083	174090	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019675	CCTC	2	8	174404	174411	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_019675	CTGG	2	8	175467	175474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019675	CACC	2	8	175916	175923	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_019675	TCTG	2	8	176094	176101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019675	TGAG	2	8	176172	176179	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019675	CCTG	2	8	177866	177873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_019675	TCGT	2	8	177877	177884	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019675	GCTG	2	8	178697	178704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_019675	GGTT	2	8	180147	180154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019675	TGGC	2	8	184510	184517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019675	CCCG	2	8	188410	188417	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_019675	CGAC	2	8	188481	188488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019675	GGCA	2	8	188541	188548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019675	CAGG	2	8	188594	188601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019675	AAAC	2	8	189443	189450	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_019675	GATC	2	8	191674	191681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019675	CAAC	2	8	195364	195371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019675	GGTT	2	8	202634	202641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019675	GCGA	2	8	209608	209615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019675	GCCC	2	8	218549	218556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_019675	GGAC	2	8	233267	233274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_019675	AGCG	2	8	233719	233726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019675	TCGA	2	8	234013	234020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019675	GCCG	2	8	234158	234165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_019675	AAGG	2	8	234556	234563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019675	GGGC	2	8	235299	235306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019675	GCCG	2	8	235475	235482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019675	CCCT	2	8	236201	236208	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_019675	GCGG	2	8	236336	236343	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019675	AGTC	2	8	236424	236431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_019675	CGAT	2	8	236704	236711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_019675	TTCA	2	8	236890	236897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019675	CGCC	2	8	237710	237717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_019675	AGCA	2	8	241021	241028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019675	CGGT	2	8	241260	241267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_019675	GGCC	2	8	241371	241378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_019675	CGAT	2	8	252063	252070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019675	TCGC	2	8	265084	265091	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019675	CGTG	2	8	267914	267921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_019675	GATG	2	8	267944	267951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019675	CAAG	2	8	270607	270614	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019675	GATG	2	8	272435	272442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019675	CCTT	2	8	272451	272458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019675	AATG	2	8	272473	272480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019675	CCAA	2	8	272544	272551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_019675	GCAG	2	8	272607	272614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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275	NC_019675	TCCT	2	8	801258	801265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_019675	GCCG	2	8	1487642	1487649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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491	NC_019675	CCAG	2	8	1494085	1494092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_019675	AGCG	2	8	1514994	1515001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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