MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanobium gracile PCC 6307 chromosome

Total Repeats: 72069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019675	CGT	2	6	42	47	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019675	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701341
3	NC_019675	CTG	2	6	174	179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701341
4	NC_019675	CGG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701341
5	NC_019675	TGG	2	6	334	339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701341
6	NC_019675	CCG	2	6	369	374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
7	NC_019675	GCC	2	6	417	422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
8	NC_019675	GCC	2	6	429	434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
9	NC_019675	CAG	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701341
10	NC_019675	GTG	2	6	501	506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701341
11	NC_019675	GCG	2	6	589	594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701341
12	NC_019675	GCC	2	6	759	764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
13	NC_019675	TGG	2	6	775	780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701341
14	NC_019675	AGG	2	6	817	822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701341
15	NC_019675	TTC	2	6	825	830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427701341
16	NC_019675	AAG	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701341
17	NC_019675	GAG	2	6	1245	1250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701341
18	NC_019675	CGG	2	6	1358	1363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701341
19	NC_019675	GAA	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701341
20	NC_019675	CAG	2	6	1415	1420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701341
21	NC_019675	CGG	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701341
22	NC_019675	GCA	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701341
23	NC_019675	GCC	2	6	1477	1482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701341
24	NC_019675	GAT	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701342
25	NC_019675	GTC	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
26	NC_019675	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427701342
27	NC_019675	GAA	2	6	1695	1700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701342
28	NC_019675	GCG	2	6	1713	1718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701342
29	NC_019675	GGC	3	9	1737	1745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701342
30	NC_019675	CCG	2	6	1772	1777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701342
31	NC_019675	CAG	2	6	1800	1805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701342
32	NC_019675	AGT	2	6	1817	1822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701342
33	NC_019675	GAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427701342
34	NC_019675	AGA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701342
35	NC_019675	CAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701342
36	NC_019675	GTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427701342
37	NC_019675	GCA	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701342
38	NC_019675	GTA	2	6	2007	2012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701342
39	NC_019675	TCG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
40	NC_019675	CGC	2	6	2033	2038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701342
41	NC_019675	CTT	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427701342
42	NC_019675	TCG	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
43	NC_019675	CAC	2	6	2121	2126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701342
44	NC_019675	CGC	2	6	2175	2180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701342
45	NC_019675	CGT	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
46	NC_019675	CAG	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701342
47	NC_019675	GGC	2	6	2286	2291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701342
48	NC_019675	CCT	2	6	2357	2362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701342
49	NC_019675	CGG	2	6	2369	2374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701342
50	NC_019675	CGT	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
51	NC_019675	GCC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701342
52	NC_019675	CCA	2	6	2396	2401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701342
53	NC_019675	CGT	2	6	2403	2408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701342
54	NC_019675	TCC	2	6	2486	2491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701343
55	NC_019675	TCG	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701343
56	NC_019675	CCT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427701343
57	NC_019675	GTC	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701343
58	NC_019675	GCG	2	6	2647	2652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701343
59	NC_019675	TCG	2	6	2723	2728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701344
60	NC_019675	GGC	3	9	2767	2775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
61	NC_019675	GGC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
62	NC_019675	CGC	2	6	2913	2918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
63	NC_019675	CAG	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
64	NC_019675	TGG	2	6	3009	3014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701344
65	NC_019675	CTG	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701344
66	NC_019675	GCG	2	6	3199	3204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
67	NC_019675	CGC	3	9	3241	3249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
68	NC_019675	TGA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427701344
69	NC_019675	CCA	2	6	3273	3278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701344
70	NC_019675	CCG	2	6	3279	3284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
71	NC_019675	TCA	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427701344
72	NC_019675	GTG	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701344
73	NC_019675	GCC	2	6	3431	3436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
74	NC_019675	CGA	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
75	NC_019675	GGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
76	NC_019675	GCC	2	6	3520	3525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701344
77	NC_019675	GCA	2	6	3588	3593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
78	NC_019675	TGG	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701344
79	NC_019675	CCA	2	6	3735	3740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701344
80	NC_019675	CAG	2	6	3769	3774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
81	NC_019675	CAG	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701344
82	NC_019675	CCA	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701344
83	NC_019675	GCT	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701344
84	NC_019675	GGC	2	6	3842	3847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701344
85	NC_019675	GCC	2	6	3898	3903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
86	NC_019675	GGT	2	6	3930	3935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701345
87	NC_019675	GCA	2	6	3968	3973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
88	NC_019675	CCA	2	6	3983	3988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701345
89	NC_019675	CGC	2	6	3989	3994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
90	NC_019675	CCG	2	6	4034	4039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
91	NC_019675	GGC	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701345
92	NC_019675	GAA	2	6	4107	4112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701345
93	NC_019675	CAG	3	9	4125	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
94	NC_019675	CCG	2	6	4142	4147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
95	NC_019675	CCA	2	6	4160	4165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701345
96	NC_019675	CAG	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
97	NC_019675	ATC	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427701345
98	NC_019675	GCA	2	6	4328	4333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
99	NC_019675	CCA	2	6	4373	4378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701345
100	NC_019675	CAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
101	NC_019675	GCC	5	15	4453	4467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
102	NC_019675	CCA	2	6	4505	4510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701345
103	NC_019675	GCC	2	6	4537	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
104	NC_019675	CCG	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
105	NC_019675	CAG	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
106	NC_019675	GCA	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
107	NC_019675	CAG	2	6	4659	4664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
108	NC_019675	CAG	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
109	NC_019675	CAG	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
110	NC_019675	CAG	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
111	NC_019675	GGT	2	6	4815	4820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701345
112	NC_019675	TGG	2	6	4922	4927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701345
113	NC_019675	GCC	2	6	4947	4952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701345
114	NC_019675	CAG	2	6	4965	4970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
115	NC_019675	AGA	2	6	4997	5002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701345
116	NC_019675	CAG	3	9	5010	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
117	NC_019675	GCG	2	6	5134	5139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701345
118	NC_019675	CAG	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
119	NC_019675	AGC	2	6	5281	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
120	NC_019675	CAG	2	6	5295	5300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
121	NC_019675	GCG	2	6	5308	5313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701345
122	NC_019675	CGG	2	6	5314	5319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701345
123	NC_019675	CAG	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
124	NC_019675	CAG	3	9	5382	5390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701345
125	NC_019675	AGA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701346
126	NC_019675	CAG	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
127	NC_019675	CCA	2	6	5457	5462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
128	NC_019675	ACC	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
129	NC_019675	CAG	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
130	NC_019675	GCA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
131	NC_019675	CAG	2	6	5737	5742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
132	NC_019675	CCG	2	6	5902	5907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701346
133	NC_019675	AGC	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
134	NC_019675	CGG	2	6	5994	5999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701346
135	NC_019675	GAA	2	6	6001	6006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701346
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137	NC_019675	AGC	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
138	NC_019675	CGG	2	6	6084	6089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701346
139	NC_019675	CCA	2	6	6093	6098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
140	NC_019675	GGT	3	9	6106	6114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701346
141	NC_019675	GCC	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701346
142	NC_019675	TGG	3	9	6165	6173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701346
143	NC_019675	AGC	3	9	6230	6238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
144	NC_019675	GCT	2	6	6252	6257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701346
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146	NC_019675	TGG	2	6	6297	6302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427701346
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148	NC_019675	GCC	2	6	6352	6357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701346
149	NC_019675	CAG	2	6	6382	6387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
150	NC_019675	CAG	2	6	6412	6417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
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152	NC_019675	CAC	3	9	6457	6465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
153	NC_019675	CAG	2	6	6577	6582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
154	NC_019675	CAC	2	6	6670	6675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
155	NC_019675	CAG	3	9	6682	6690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
156	NC_019675	GCG	2	6	6728	6733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701346
157	NC_019675	CAC	2	6	6736	6741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
158	NC_019675	CAG	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701346
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160	NC_019675	CAC	2	6	6835	6840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
161	NC_019675	GAA	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701346
162	NC_019675	CCA	2	6	6867	6872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
163	NC_019675	CCA	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701346
164	NC_019675	GCC	2	6	6965	6970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701346
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178	NC_019675	CAG	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701347
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182	NC_019675	GGC	2	6	7520	7525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701347
183	NC_019675	GCA	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701347
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206	NC_019675	CGG	2	6	8275	8280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701348
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208	NC_019675	GCC	2	6	8294	8299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701348
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210	NC_019675	AGG	2	6	8419	8424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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212	NC_019675	GCC	2	6	8484	8489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701349
213	NC_019675	TGC	2	6	8618	8623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701349
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220	NC_019675	GCG	2	6	8841	8846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701350
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240	NC_019675	GGC	2	6	9787	9792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701351
241	NC_019675	CAC	2	6	9835	9840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427701351
242	NC_019675	GTC	2	6	9856	9861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701351
243	NC_019675	GCG	2	6	9892	9897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701351
244	NC_019675	CAG	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427701351
245	NC_019675	CGG	3	9	10089	10097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701351
246	NC_019675	TCG	2	6	10124	10129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701351
247	NC_019675	GAA	2	6	10132	10137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427701351
248	NC_019675	TGC	2	6	10298	10303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701351
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251	NC_019675	CCG	2	6	10569	10574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427701352
252	NC_019675	TGC	2	6	10603	10608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701352
253	NC_019675	TTG	2	6	10626	10631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427701352
254	NC_019675	GCG	3	9	10709	10717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701352
255	NC_019675	CGG	2	6	10786	10791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701352
256	NC_019675	TCG	2	6	10833	10838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427701352
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258	NC_019675	CGG	2	6	10933	10938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427701352
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