MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter heilmannii ASB1.4 main chromosome

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019674	GGTGCT	2	12	26755	26766	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019674	GGGGTT	2	12	46220	46231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019674	ATTTTT	2	12	48987	48998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019674	TGGGCT	2	12	76416	76427	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019674	GAGCGG	2	12	76915	76926	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019674	GCGGGG	2	12	76995	77006	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_019674	GGGGAG	2	12	77222	77233	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019674	GCCAAT	2	12	93005	93016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019674	AGCAAC	2	12	93872	93883	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019674	CAACTT	2	12	94321	94332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019674	TCCCGC	2	12	103255	103266	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019674	TGGGGT	2	12	105360	105371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019674	CAAAGC	2	12	111305	111316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019674	GACATT	2	12	112551	112562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019674	AAACAC	2	12	126813	126824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019674	TCTAGC	2	12	130384	130395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019674	GCGTTT	2	12	130489	130500	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019674	TCTAGC	2	12	130604	130615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019674	AATAAC	2	12	143647	143658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_019674	CTTTTT	2	12	177469	177480	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019674	CTTTTT	2	12	179234	179245	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_019674	TTTCTT	2	12	225781	225792	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019674	CTCATT	2	12	228705	228716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019674	ACCAAA	2	12	230247	230258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019674	CTCCCA	2	12	235503	235514	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_019674	CTCCCA	2	12	237304	237315	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_019674	AGATTT	2	12	245329	245340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019674	CTTAAA	3	18	277753	277770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019674	CAGCTA	2	12	300344	300355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019674	CCCCAT	2	12	318898	318909	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_019674	AAAAAG	2	12	326725	326736	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019674	AAAAAG	2	12	328211	328222	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019674	AAAGAA	2	12	336880	336891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019674	AAAAAC	2	12	337629	337640	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_019674	AGCGAT	2	12	339139	339150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019674	GCTTGG	2	12	341006	341017	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_019674	CAAAGA	2	12	341152	341163	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019674	CTTGGT	2	12	351586	351597	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019674	GGGGGT	2	12	360811	360822	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019674	GGGGTT	2	12	403347	403358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019674	GGGGTT	2	12	403584	403595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019674	GCAAAA	2	12	462426	462437	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019674	GCAAAA	2	12	464396	464407	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_019674	CCTTTA	2	12	467012	467023	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019674	CACCTA	2	12	500747	500758	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019674	AGAGCA	2	12	504837	504848	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019674	GGTTAT	2	12	533303	533314	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019674	GGTTAT	2	12	535089	535100	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019674	AAAAAG	2	12	562372	562383	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019674	TTTCTC	2	12	563238	563249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019674	AATCTC	2	12	574347	574358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019674	GGGGGC	2	12	580718	580729	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019674	GGTTGA	2	12	627400	627411	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019674	TAAAGT	2	12	631461	631472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019674	ATGGTG	2	12	632182	632193	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019674	CTAACG	2	12	641290	641301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019674	AGCCGA	2	12	750683	750694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019674	AGCCGA	2	12	751419	751430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019674	AGCTAA	2	12	753236	753247	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_019674	ACTTCT	2	12	756630	756641	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019674	GGTTTT	2	12	769175	769186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019674	TGCTCT	2	12	790275	790286	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019674	CTTTCT	2	12	791319	791330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019674	GTTTTG	2	12	793106	793117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019674	AATGAG	2	12	795268	795279	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019674	GCTGGA	2	12	796349	796360	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019674	GAAAAT	2	12	810970	810981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019674	TAACCT	2	12	811830	811841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019674	CATAAC	2	12	818275	818286	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019674	AGCCCT	2	12	828517	828528	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_019674	TCGGTG	2	12	833971	833982	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019674	CACCGC	2	12	851501	851512	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019674	TTTTGC	2	12	921937	921948	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_019674	TTAAAA	2	12	936424	936435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019674	ACCCTT	2	12	959068	959079	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019674	ATGCCA	2	12	982864	982875	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019674	ACTTAA	2	12	995486	995497	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019674	GATTTA	2	12	997932	997943	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019674	GATTTA	2	12	1001457	1001468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019674	TTGTGC	2	12	1035641	1035652	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_019674	AGCCGA	2	12	1043128	1043139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019674	CTCAAG	2	12	1045898	1045909	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019674	CTTTTT	2	12	1048287	1048298	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019674	GTAGCG	2	12	1058578	1058589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019674	ATTAAT	2	12	1087701	1087712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019674	CATGAG	2	12	1111010	1111021	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019674	AAACCA	2	12	1189267	1189278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019674	GCTTGG	2	12	1189319	1189330	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019674	TCCACC	2	12	1189477	1189488	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_019674	TGACTT	2	12	1192331	1192342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_019674	TAGAGC	2	12	1198381	1198392	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019674	ATGCCC	2	12	1198475	1198486	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019674	TGGGCG	2	12	1199055	1199066	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019674	AAGAGC	2	12	1199295	1199306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019674	GATGGG	2	12	1249215	1249226	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019674	TGATGG	2	12	1282041	1282052	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019674	GATGTG	2	12	1325915	1325926	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019674	GTTTTG	2	12	1326031	1326042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019674	AAGCAC	2	12	1351781	1351792	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019674	ATATCA	2	12	1361359	1361370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019674	TCTTGC	2	12	1381094	1381105	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019674	AAAATC	2	12	1381303	1381314	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_019674	AAGGGA	2	12	1390310	1390321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019674	AAGGGA	2	12	1393802	1393813	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019674	TTCTGC	2	12	1394851	1394862	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019674	GTGTTG	2	12	1395410	1395421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019674	GTGGCG	2	12	1395995	1396006	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_019674	GCAAGG	2	12	1399821	1399832	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019674	GGCCGT	2	12	1400335	1400346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019674	CTTCTC	2	12	1418479	1418490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_019674	TTAAGT	2	12	1419614	1419625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019674	TTAACT	2	12	1458335	1458346	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_019674	CATCGC	2	12	1461713	1461724	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019674	TTGAAT	2	12	1470589	1470600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019674	TCTTGG	2	12	1481245	1481256	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_019674	AAAAAG	2	12	1481949	1481960	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019674	CGCCAA	2	12	1491436	1491447	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019674	CCAACG	2	12	1522154	1522165	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_019674	AACATG	2	12	1522231	1522242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019674	CCATCA	2	12	1523225	1523236	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019674	CATGTC	2	12	1549370	1549381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019674	CACTTC	2	12	1556176	1556187	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019674	AAAAAG	2	12	1570907	1570918	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019674	TCCAAA	2	12	1571899	1571910	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019674	CTTTGC	2	12	1573475	1573486	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019674	GACAGC	2	12	1616573	1616584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019674	GTCAAA	2	12	1640127	1640138	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_019674	CTTTGG	2	12	1640268	1640279	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_019674	CCCCAA	2	12	1659819	1659830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019674	AAACCT	2	12	1665867	1665878	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019674	AGAGGA	2	12	1666319	1666330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019674	AGATTT	2	12	1679436	1679447	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019674	TTTAGC	2	12	1684604	1684615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_019674	TAGTCT	2	12	1690625	1690636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_019674	CTTTTT	2	12	1713929	1713940	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_019674	CTTTTT	2	12	1714674	1714685	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_019674	GACACC	2	12	1725987	1725998	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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141	NC_019674	CCCCGC	2	12	1782577	1782588	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
142	NC_019674	GATGTG	2	12	1782693	1782704	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.