MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter heilmannii ASB1.4 main chromosome

Total Repeats: 661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019674	ATTTTG	2	12	146	157	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480527848
2	NC_019674	ATTTAA	2	12	6858	6869	50 %	50 %	0 %	0 %	480527854
3	NC_019674	GTTAGA	2	12	8726	8737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480527857
4	NC_019674	CCAAGG	2	12	9940	9951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480527857
5	NC_019674	AGAAAA	2	12	10123	10134	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	480527858
6	NC_019674	CCACAT	2	12	15050	15061	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	480527862
7	NC_019674	TCCCTA	2	12	16237	16248	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	480527863
8	NC_019674	AGACAA	2	12	18061	18072	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480527865
9	NC_019674	CCATCA	2	12	19803	19814	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	480527867
10	NC_019674	AGGGCT	2	12	20543	20554	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480527868
11	NC_019674	CCATCA	2	12	21938	21949	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	480527870
12	NC_019674	AGGGCT	2	12	22678	22689	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480527871
13	NC_019674	GGATTT	2	12	28395	28406	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480527875
14	NC_019674	CATCGA	2	12	28838	28849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480527876
15	NC_019674	CTTTTC	2	12	32110	32121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480527879
16	NC_019674	AGCCCC	2	12	33488	33499	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	480527879
17	NC_019674	CTCTAG	2	12	33592	33603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480527879
18	NC_019674	AATCTT	2	12	33848	33859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	480527880
19	NC_019674	AGAACA	2	12	34697	34708	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480527881
20	NC_019674	AATTAC	2	12	40732	40743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	480527888
21	NC_019674	GAAAAA	2	12	42389	42400	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	480527890
22	NC_019674	AAAGAA	2	12	47639	47650	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	480527895
23	NC_019674	TTTAGA	2	12	48022	48033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	480527895
24	NC_019674	TTTAGA	2	12	48757	48768	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	480527895
25	NC_019674	TGCCAT	2	12	53808	53819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480527902
26	NC_019674	GCACAC	2	12	55994	56005	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480527904
27	NC_019674	TGGCTT	2	12	56552	56563	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	480527905
28	NC_019674	GGGGCG	2	12	56711	56722	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	480527905
29	NC_019674	CTTTTT	2	12	58814	58825	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	480527908
30	NC_019674	TTTGGG	2	12	58845	58856	0 %	50 %	50 %	0 %	480527908
31	NC_019674	CTCTAG	2	12	59457	59468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480527908
32	NC_019674	CTCTAG	2	12	61367	61378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480527909
33	NC_019674	CCACAC	2	12	63874	63885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480527910
34	NC_019674	ATGCCA	2	12	70145	70156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480527915
35	NC_019674	TGATTG	2	12	71081	71092	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480527917
36	NC_019674	TGATTG	2	12	72979	72990	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480527920
37	NC_019674	GGGGAG	2	12	77820	77831	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	480527922
38	NC_019674	AACAGC	2	12	78676	78687	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	480527923
39	NC_019674	CTTGCT	2	12	87416	87427	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	480527932
40	NC_019674	ACCTAA	2	12	89134	89145	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480527934
41	NC_019674	TCTTGC	2	12	89201	89212	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	480527935
42	NC_019674	GTAGGC	2	12	89541	89552	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480527935
43	NC_019674	GCCAAT	2	12	93251	93262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480527938
44	NC_019674	CGCCCA	2	12	97184	97195	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	480527942
45	NC_019674	CGCTGT	2	12	98832	98843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480527945
46	NC_019674	TAGACA	2	12	100407	100418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480527946
47	NC_019674	CCCCCA	2	12	103475	103486	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	480527950
48	NC_019674	AGCCAA	2	12	104175	104186	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	480527950
49	NC_019674	CATCAA	2	12	107272	107283	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480527953
50	NC_019674	CATGAG	2	12	108865	108876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480527954
51	NC_019674	TGGCTG	2	12	114692	114703	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480527963
52	NC_019674	ATCCCT	2	12	115405	115416	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	480527963
53	NC_019674	GGCGTG	2	12	117547	117558	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	480527967
54	NC_019674	TGCTGA	2	12	124021	124032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480527974
55	NC_019674	AAACAC	2	12	125518	125529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480527975
56	NC_019674	CTAGGG	2	12	128002	128013	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480527979
57	NC_019674	TCCAAG	2	12	129457	129468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480527982
58	NC_019674	GCGTTT	2	12	130709	130720	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	480527984
59	NC_019674	AAAAAG	2	12	132721	132732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	480527988
60	NC_019674	CCCCCG	2	12	138828	138839	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	480527995
61	NC_019674	ATAACT	2	12	144958	144969	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	480527999
62	NC_019674	TCAGTT	2	12	147163	147174	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480528001
63	NC_019674	CGCCCC	2	12	153394	153405	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	480528006
64	NC_019674	GGCGAT	2	12	154583	154594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480528007
65	NC_019674	CACAAT	2	12	156384	156395	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480528009
66	NC_019674	CCAACA	2	12	156710	156721	50 %	0 %	0 %	50 %	480528009
67	NC_019674	ACCCAC	2	12	157927	157938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480528010
68	NC_019674	TTTGAG	2	12	163024	163035	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480528015
69	NC_019674	CACCCA	3	18	165170	165187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480528017
70	NC_019674	TGCCCG	2	12	170174	170185	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	480528021
71	NC_019674	ATTAAA	2	12	172008	172019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480528023
72	NC_019674	GGATGC	2	12	172675	172686	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480528023
73	NC_019674	TCGCTG	2	12	173478	173489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480528023
74	NC_019674	TGGGTG	2	12	173855	173866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480528024
75	NC_019674	ACTTGC	2	12	181450	181461	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480528035
76	NC_019674	GTTGGA	2	12	188072	188083	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480528048
77	NC_019674	TGGCGG	2	12	192655	192666	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	480528052
78	NC_019674	ATTTTG	2	12	197119	197130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480528055
79	NC_019674	ATTTTG	2	12	198390	198401	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480528057
80	NC_019674	ATGCCT	2	12	200516	200527	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480528060
81	NC_019674	AGCATC	2	12	205463	205474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480528068
82	NC_019674	TGTGAT	2	12	210939	210950	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480528076
83	NC_019674	GGGGGC	2	12	211943	211954	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	480528077
84	NC_019674	GCCAAG	2	12	216381	216392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480528081
85	NC_019674	GTGATC	2	12	216531	216542	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480528081
86	NC_019674	AGGATA	2	12	222754	222765	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480528088
87	NC_019674	TCCCCC	2	12	223118	223129	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	480528088
88	NC_019674	TCCCCC	2	12	223724	223735	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	480528088
89	NC_019674	TCCCCA	2	12	224080	224091	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	480528089
90	NC_019674	CCCAAG	2	12	229334	229345	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480528094
91	NC_019674	CCCAAG	2	12	229354	229365	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480528094
92	NC_019674	CAAAGA	2	12	229571	229582	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480528094
93	NC_019674	ACAAAA	2	12	230450	230461	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	480528096
94	NC_019674	GGACAT	2	12	233926	233937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480528102
95	NC_019674	GCAGAA	2	12	236152	236163	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480528105
96	NC_019674	GCAGAA	2	12	237953	237964	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480528109
97	NC_019674	GCCTCT	2	12	242211	242222	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	480528115
98	NC_019674	AAATCC	2	12	246951	246962	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480528119
99	NC_019674	AGAGGA	2	12	255595	255606	50 %	0 %	50 %	0 %	480528121
100	NC_019674	TAAAAT	2	12	256129	256140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480528122
101	NC_019674	AGATCA	2	12	257835	257846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480528123
102	NC_019674	CCCCAA	2	12	257859	257870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480528123
103	NC_019674	ACCCCA	2	12	258424	258435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480528123
104	NC_019674	ACAATC	2	12	260848	260859	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480528124
105	NC_019674	TGATGG	2	12	266962	266973	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480528128
106	NC_019674	TGGGCT	2	12	269700	269711	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480528131
107	NC_019674	ACACGG	2	12	269724	269735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480528131
108	NC_019674	TGGATT	2	12	270354	270365	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480528132
109	NC_019674	AGAGCA	2	12	272437	272448	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480528134
110	NC_019674	ACACCC	2	12	273093	273104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480528134
111	NC_019674	GCTACG	2	12	275053	275064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480528136
112	NC_019674	CTCAAT	2	12	277359	277370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480528138
113	NC_019674	TTTGGC	2	12	277533	277544	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	480528138
114	NC_019674	GGGGCG	2	12	280674	280685	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	480528142
115	NC_019674	TTTTCT	2	12	288136	288147	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	480528150
116	NC_019674	CAAGCG	2	12	288312	288323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480528150
117	NC_019674	AAAAAG	2	12	296268	296279	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	480528162
118	NC_019674	ATTTGG	2	12	298346	298357	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480528168
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227	NC_019674	TAGGGC	2	12	646028	646039	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480528535
228	NC_019674	CGATGC	2	12	649527	649538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480528539
229	NC_019674	CCAAAA	2	12	653185	653196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480528542
230	NC_019674	CGGTGA	2	12	660684	660695	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480528556
231	NC_019674	TGCGGG	2	12	660832	660843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	480528557
232	NC_019674	TGATGG	2	12	664945	664956	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480528565
233	NC_019674	CAATCA	2	12	666511	666522	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480528569
234	NC_019674	GCCCCC	2	12	666705	666716	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	480528569
235	NC_019674	GGTTTT	2	12	667460	667471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480528572
236	NC_019674	CATTCT	2	12	670868	670879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480528579
237	NC_019674	GGCGTG	2	12	676825	676836	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	480528587
238	NC_019674	GCAAGA	2	12	680491	680502	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480528591
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240	NC_019674	GTTGGG	2	12	689757	689768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480528602
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264	NC_019674	AACTCC	2	12	758860	758871	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	480528682
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325	NC_019674	TTAGAG	2	12	907537	907548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480528851
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330	NC_019674	TCACGA	2	12	918364	918375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480528860
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334	NC_019674	TTAAGT	2	12	932608	932619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	480528880
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336	NC_019674	ACAAAA	2	12	935823	935834	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	480528886
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338	NC_019674	GTCTTA	2	12	942230	942241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480528897
339	NC_019674	TCTAGC	2	12	943137	943148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480528898
340	NC_019674	CACGAC	2	12	943214	943225	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480528898
341	NC_019674	TCTAGC	2	12	945362	945373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480528901
342	NC_019674	CACGAC	2	12	945439	945450	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480528901
343	NC_019674	ATGGCA	2	12	950641	950652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480528906
344	NC_019674	AGGCGC	2	12	954871	954882	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	480528909
345	NC_019674	CCACCG	2	12	955489	955500	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	480528910
346	NC_019674	GCCCCC	2	12	956153	956164	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	480528910
347	NC_019674	GGGCTT	2	12	957688	957699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480528912
348	NC_019674	GCCTGC	2	12	960128	960139	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	480528913
349	NC_019674	TGCACT	2	12	963280	963291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480528916
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447	NC_019674	GCTTCT	2	12	1220013	1220024	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	480529173
448	NC_019674	TCCCGC	2	12	1226636	1226647	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	480529178
449	NC_019674	AGAGCA	3	18	1231280	1231297	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480529181
450	NC_019674	AAATTT	2	12	1241006	1241017	50 %	50 %	0 %	0 %	480529192
451	NC_019674	CGACAC	2	12	1243972	1243983	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480529194
452	NC_019674	TGAGAT	2	12	1244155	1244166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480529194
453	NC_019674	GACACC	2	12	1246940	1246951	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480529196
454	NC_019674	GATGGG	2	12	1248812	1248823	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	480529199
455	NC_019674	TTAAAA	2	12	1251269	1251280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480529200
456	NC_019674	AAGGGG	2	12	1253893	1253904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480529202
457	NC_019674	GGTAAT	2	12	1256107	1256118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480529205
458	NC_019674	CAAGAG	2	12	1262637	1262648	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480529212
459	NC_019674	GGGGCG	2	12	1263994	1264005	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	480529214
460	NC_019674	GGGAGT	2	12	1265587	1265598	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	480529216
461	NC_019674	GTGTTG	2	12	1268250	1268261	0 %	50 %	50 %	0 %	480529220
462	NC_019674	GGCTTT	2	12	1269671	1269682	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	480529223
463	NC_019674	CGCGCC	2	12	1274923	1274934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480529228
464	NC_019674	CTTGGG	2	12	1278528	1278539	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480529231
465	NC_019674	TAAAAC	2	12	1281741	1281752	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	480529233
466	NC_019674	AAGGCA	2	12	1288470	1288481	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480529238
467	NC_019674	CTGCAC	2	12	1290307	1290318	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	480529239
468	NC_019674	GGGTGG	2	12	1290873	1290884	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	480529239
469	NC_019674	CATCGG	2	12	1309434	1309445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480529257
470	NC_019674	GGCGAT	2	12	1312321	1312332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480529259
471	NC_019674	ACGGAT	2	12	1318122	1318133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480529263
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474	NC_019674	CGCCAT	2	12	1322160	1322171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	480529268
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477	NC_019674	AGCAAT	2	12	1329175	1329186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480529274
478	NC_019674	ATCGCC	2	12	1331878	1331889	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	480529276
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480	NC_019674	TAGACA	2	12	1333496	1333507	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480529278
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484	NC_019674	CTTCAG	2	12	1339816	1339827	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480529285
485	NC_019674	CGCTCT	2	12	1341187	1341198	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	480529286
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488	NC_019674	GGGCGA	2	12	1343278	1343289	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	480529288
489	NC_019674	CTATAG	2	12	1345267	1345278	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480529291
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493	NC_019674	AAAAGC	2	12	1360505	1360516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480529307
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