MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter heilmannii ASB1.4 main chromosome

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019674	GCCCC	2	10	2000	2009	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2	NC_019674	ATGTG	2	10	5503	5512	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019674	GGCGG	2	10	14118	14127	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019674	CAGCC	2	10	25900	25909	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_019674	TGGTA	2	10	49014	49023	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019674	TTTAT	2	10	51139	51148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019674	TAAAA	2	10	65127	65136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019674	TGCTT	2	10	75785	75794	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_019674	TGGAG	2	10	76124	76133	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019674	GCAAA	2	10	76741	76750	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019674	GGGCT	2	10	77438	77447	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019674	GCGCA	2	10	77492	77501	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019674	GGGGA	2	10	78774	78783	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019674	AGGAC	2	10	91417	91426	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019674	TAGCC	2	10	111808	111817	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_019674	CGCAG	2	10	137202	137211	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_019674	TTAGC	2	10	137353	137362	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019674	ACCGC	2	10	151932	151941	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_019674	TTTAC	2	10	175217	175226	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019674	AGAAA	2	10	187229	187238	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019674	AGCCC	2	10	190509	190518	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_019674	TAGCC	2	10	199055	199064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_019674	GGCAG	2	10	202085	202094	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019674	GTTAT	2	10	217885	217894	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019674	CGATC	2	10	225721	225730	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_019674	CACAA	2	10	228761	228770	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_019674	TAAAA	2	10	247306	247315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019674	TTTTA	2	10	247331	247340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019674	TTCAA	2	10	248441	248450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019674	CTCAT	2	10	248672	248681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_019674	TTCAA	2	10	249460	249469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019674	CTCAT	2	10	249691	249700	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019674	TTCAA	2	10	250920	250929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_019674	CTCAT	2	10	251151	251160	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_019674	TTCAA	2	10	252427	252436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019674	CTCAT	2	10	252658	252667	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_019674	AAAAG	2	10	284351	284360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019674	GGATT	2	10	293069	293078	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019674	ATTAA	2	10	300225	300234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019674	GGGCT	2	10	307147	307156	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019674	GGGCT	2	10	309218	309227	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_019674	AGGGG	2	10	320595	320604	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019674	GGCAT	2	10	325205	325214	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019674	GGGAG	2	10	331902	331911	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019674	AGAAA	2	10	333770	333779	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019674	GGTAA	2	10	334070	334079	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019674	ACCTT	2	10	334090	334099	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_019674	TTAAA	2	10	334427	334436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019674	TAATA	2	10	335555	335564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019674	ACCAA	2	10	340882	340891	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_019674	CTGTG	2	10	348314	348323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_019674	CTGTG	2	10	348403	348412	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019674	TTTTG	2	10	351373	351382	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019674	ACAGA	2	10	358898	358907	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_019674	AAAAT	2	10	361078	361087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019674	AGCCT	2	10	365348	365357	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_019674	TAAAA	2	10	374469	374478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019674	GAGCA	2	10	374876	374885	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019674	AGGCT	2	10	380851	380860	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019674	CCCAA	2	10	384261	384270	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_019674	CCCTA	2	10	410004	410013	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_019674	ATGCA	2	10	412254	412263	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019674	AGCCT	2	10	420024	420033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_019674	CTAAG	2	10	424292	424301	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_019674	TTTAT	2	10	443406	443415	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019674	TGGTT	2	10	451098	451107	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019674	ATTAT	2	10	459734	459743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019674	ACAGG	2	10	465999	466008	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019674	AATTT	2	10	466173	466182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019674	AGCAA	2	10	468356	468365	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019674	CCATG	2	10	473858	473867	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_019674	TTATG	2	10	493299	493308	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019674	GCAGC	2	10	494106	494115	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_019674	GCCAT	2	10	495063	495072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_019674	AGCCA	2	10	499539	499548	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_019674	CGCCA	2	10	501836	501845	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_019674	CGCCA	2	10	501905	501914	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_019674	TTTGA	2	10	503069	503078	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019674	AGATG	2	10	517443	517452	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019674	TTGAA	2	10	517676	517685	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019674	AGATG	2	10	518982	518991	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019674	TTGAA	2	10	519215	519224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019674	AGATG	2	10	520441	520450	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019674	TTGAA	2	10	520674	520683	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019674	AGATG	2	10	521059	521068	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019674	TTGAA	2	10	521292	521301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019674	TAAAA	2	10	522402	522411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019674	TTTTA	2	10	522427	522436	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019674	GCGGG	2	10	530164	530173	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
90	NC_019674	CAAAA	2	10	530216	530225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_019674	CCCCT	2	10	530227	530236	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
92	NC_019674	GTTGC	2	10	532266	532275	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_019674	GTTGC	2	10	534052	534061	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_019674	TTGTG	2	10	564193	564202	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019674	GGGCG	2	10	573731	573740	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
96	NC_019674	GGGCG	2	10	573983	573992	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_019674	GAAAG	2	10	574623	574632	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019674	CGGAT	2	10	576818	576827	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_019674	AGAGC	2	10	588406	588415	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_019674	CCCAA	2	10	631364	631373	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
101	NC_019674	AGCGT	2	10	649155	649164	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019674	ATAAA	2	10	650766	650775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019674	TACAT	2	10	654067	654076	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019674	TTTAT	2	10	654228	654237	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019674	TGGAG	2	10	654560	654569	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019674	CAAGC	2	10	654888	654897	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_019674	ACCCA	2	10	655284	655293	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_019674	TTTGG	2	10	656423	656432	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019674	CAAGC	2	10	656675	656684	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_019674	ACCCA	2	10	657071	657080	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_019674	CCCCA	2	10	683218	683227	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
112	NC_019674	TATCA	2	10	712237	712246	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019674	CGCCT	2	10	718267	718276	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_019674	GGGCG	2	10	721915	721924	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
115	NC_019674	AAGCC	2	10	727916	727925	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_019674	AAAAC	2	10	729527	729536	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019674	TCTTG	2	10	735331	735340	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_019674	ATGCA	2	10	735798	735807	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_019674	AAAAG	2	10	736216	736225	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019674	TGGTG	2	10	737648	737657	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019674	TTTGC	2	10	738775	738784	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019674	TTTGC	2	10	738980	738989	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019674	GCGTG	2	10	739140	739149	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019674	CAAGC	2	10	741089	741098	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_019674	AGATC	2	10	757509	757518	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019674	GCCCC	2	10	762402	762411	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
127	NC_019674	TACGC	2	10	776102	776111	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_019674	TATTT	2	10	789439	789448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019674	TTGTT	2	10	791774	791783	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019674	TCTTT	2	10	795409	795418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_019674	ATTTG	2	10	796186	796195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019674	CATCG	2	10	803763	803772	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_019674	TAGGG	2	10	812953	812962	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019674	TAGGG	2	10	814372	814381	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019674	ATAAC	2	10	817290	817299	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019674	GCAAC	2	10	819315	819324	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_019674	AACCA	2	10	819621	819630	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_019674	TTTTA	2	10	846182	846191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019674	TGCAA	2	10	846226	846235	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019674	TTTGA	2	10	857147	857156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019674	CGGGG	2	10	857268	857277	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
142	NC_019674	TATCC	2	10	879474	879483	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_019674	AAAAG	2	10	897315	897324	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019674	TAAAA	2	10	903530	903539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019674	ATCTC	2	10	917296	917305	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_019674	AAATC	2	10	936496	936505	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_019674	GGCTT	2	10	949062	949071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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149	NC_019674	AGGTA	2	10	983187	983196	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_019674	GCGTG	2	10	990176	990185	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
152	NC_019674	TTTTA	2	10	994617	994626	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_019674	TAACT	2	10	998498	998507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_019674	TCGTG	2	10	999540	999549	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_019674	GTCTT	2	10	1006215	1006224	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_019674	GCTAA	2	10	1767893	1767902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
254	NC_019674	TTTGT	2	10	1804514	1804523	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.