MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter heilmannii ASB1.4 main chromosome

Total Repeats: 994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019674	AAACC	2	10	377	386	60 %	0 %	0 %	40 %	480527848
2	NC_019674	CAAGC	2	10	982	991	40 %	0 %	20 %	40 %	480527849
3	NC_019674	CCACG	2	10	1468	1477	20 %	0 %	20 %	60 %	480527850
4	NC_019674	TAGCC	2	10	2090	2099	20 %	20 %	20 %	40 %	480527851
5	NC_019674	GGGTG	2	10	2473	2482	0 %	20 %	80 %	0 %	480527852
6	NC_019674	AAGCG	2	10	4789	4798	40 %	0 %	40 %	20 %	480527853
7	NC_019674	AGCGG	2	10	8071	8080	20 %	0 %	60 %	20 %	480527856
8	NC_019674	AAATT	2	10	11075	11084	60 %	40 %	0 %	0 %	480527859
9	NC_019674	CTTCA	2	10	20320	20329	20 %	40 %	0 %	40 %	480527867
10	NC_019674	GCCCT	2	10	20705	20714	0 %	20 %	20 %	60 %	480527868
11	NC_019674	CTTCA	2	10	22455	22464	20 %	40 %	0 %	40 %	480527870
12	NC_019674	GCCCT	2	10	22840	22849	0 %	20 %	20 %	60 %	480527871
13	NC_019674	GGGCT	2	10	29226	29235	0 %	20 %	60 %	20 %	480527876
14	NC_019674	TGGTT	2	10	29503	29512	0 %	60 %	40 %	0 %	480527877
15	NC_019674	GGCTT	2	10	33634	33643	0 %	40 %	40 %	20 %	480527879
16	NC_019674	CACTA	2	10	33871	33880	40 %	20 %	0 %	40 %	480527880
17	NC_019674	AGGGC	2	10	35738	35747	20 %	0 %	60 %	20 %	480527882
18	NC_019674	GCTCT	2	10	36743	36752	0 %	40 %	20 %	40 %	480527884
19	NC_019674	AGCGG	2	10	38002	38011	20 %	0 %	60 %	20 %	480527885
20	NC_019674	AAAAT	2	10	38357	38366	80 %	20 %	0 %	0 %	480527886
21	NC_019674	CAAGT	2	10	41038	41047	40 %	20 %	20 %	20 %	480527888
22	NC_019674	AAAGC	2	10	41102	41111	60 %	0 %	20 %	20 %	480527888
23	NC_019674	CCCCT	2	10	44130	44139	0 %	20 %	0 %	80 %	480527891
24	NC_019674	TTTGA	2	10	46883	46892	20 %	60 %	20 %	0 %	480527894
25	NC_019674	AAGAT	2	10	48390	48399	60 %	20 %	20 %	0 %	480527895
26	NC_019674	TTCTG	2	10	50235	50244	0 %	60 %	20 %	20 %	480527898
27	NC_019674	TGCTA	2	10	51331	51340	20 %	40 %	20 %	20 %	480527899
28	NC_019674	GCGGG	2	10	52563	52572	0 %	0 %	80 %	20 %	480527901
29	NC_019674	TGCCA	2	10	53057	53066	20 %	20 %	20 %	40 %	480527901
30	NC_019674	GGGGC	2	10	53834	53843	0 %	0 %	80 %	20 %	480527902
31	NC_019674	AATTT	2	10	54123	54132	40 %	60 %	0 %	0 %	480527902
32	NC_019674	CAAAA	2	10	57373	57382	80 %	0 %	0 %	20 %	480527906
33	NC_019674	GCCCA	2	10	57745	57754	20 %	0 %	20 %	60 %	480527907
34	NC_019674	CGTGC	2	10	58891	58900	0 %	20 %	40 %	40 %	480527908
35	NC_019674	GTAGG	2	10	60162	60171	20 %	20 %	60 %	0 %	480527908
36	NC_019674	GCCAC	2	10	60583	60592	20 %	0 %	20 %	60 %	480527908
37	NC_019674	CTCAC	2	10	61215	61224	20 %	20 %	0 %	60 %	480527909
38	NC_019674	GTAGG	2	10	62072	62081	20 %	20 %	60 %	0 %	480527909
39	NC_019674	GCCAC	2	10	62493	62502	20 %	0 %	20 %	60 %	480527909
40	NC_019674	CTCAC	2	10	63125	63134	20 %	20 %	0 %	60 %	480527910
41	NC_019674	AGAGC	2	10	63589	63598	40 %	0 %	40 %	20 %	480527910
42	NC_019674	GCTTG	2	10	63642	63651	0 %	40 %	40 %	20 %	480527910
43	NC_019674	ATCTT	2	10	69197	69206	20 %	60 %	0 %	20 %	480527915
44	NC_019674	TTTTG	2	10	69351	69360	0 %	80 %	20 %	0 %	480527915
45	NC_019674	GCTTG	2	10	69530	69539	0 %	40 %	40 %	20 %	480527915
46	NC_019674	TGGTT	2	10	74740	74749	0 %	60 %	40 %	0 %	480527921
47	NC_019674	GGGCT	2	10	78036	78045	0 %	20 %	60 %	20 %	480527922
48	NC_019674	GCGCA	2	10	78090	78099	20 %	0 %	40 %	40 %	480527922
49	NC_019674	TTGCC	2	10	81171	81180	0 %	40 %	20 %	40 %	480527925
50	NC_019674	GGCGT	2	10	81614	81623	0 %	20 %	60 %	20 %	480527925
51	NC_019674	ACTTG	2	10	82115	82124	20 %	40 %	20 %	20 %	480527926
52	NC_019674	GCACT	2	10	84315	84324	20 %	20 %	20 %	40 %	480527930
53	NC_019674	GCGGG	2	10	84563	84572	0 %	0 %	80 %	20 %	480527930
54	NC_019674	CCCCA	2	10	86181	86190	20 %	0 %	0 %	80 %	480527931
55	NC_019674	ACGGC	2	10	90622	90631	20 %	0 %	40 %	40 %	480527936
56	NC_019674	GTGTG	2	10	95603	95612	0 %	40 %	60 %	0 %	480527940
57	NC_019674	AGCCT	2	10	98297	98306	20 %	20 %	20 %	40 %	480527945
58	NC_019674	TTGGC	2	10	99635	99644	0 %	40 %	40 %	20 %	480527945
59	NC_019674	TTTTC	2	10	99900	99909	0 %	80 %	0 %	20 %	480527945
60	NC_019674	TTTGA	2	10	103646	103655	20 %	60 %	20 %	0 %	480527950
61	NC_019674	CATGG	2	10	103964	103973	20 %	20 %	40 %	20 %	480527950
62	NC_019674	TCCAG	2	10	104583	104592	20 %	20 %	20 %	40 %	480527951
63	NC_019674	TAAAT	2	10	107230	107239	60 %	40 %	0 %	0 %	480527953
64	NC_019674	TCCAC	2	10	109980	109989	20 %	20 %	0 %	60 %	480527957
65	NC_019674	TCCAC	2	10	110677	110686	20 %	20 %	0 %	60 %	480527959
66	NC_019674	TGAAG	2	10	114786	114795	40 %	20 %	40 %	0 %	480527963
67	NC_019674	GGGGT	2	10	116559	116568	0 %	20 %	80 %	0 %	480527965
68	NC_019674	CAAAA	2	10	117613	117622	80 %	0 %	0 %	20 %	480527967
69	NC_019674	AGCCT	2	10	120283	120292	20 %	20 %	20 %	40 %	480527969
70	NC_019674	GTTTT	2	10	120705	120714	0 %	80 %	20 %	0 %	480527969
71	NC_019674	AAGCC	2	10	121358	121367	40 %	0 %	20 %	40 %	480527971
72	NC_019674	AAAGC	2	10	122077	122086	60 %	0 %	20 %	20 %	480527972
73	NC_019674	GGGCG	2	10	124723	124732	0 %	0 %	80 %	20 %	480527975
74	NC_019674	CCATC	2	10	124768	124777	20 %	20 %	0 %	60 %	480527975
75	NC_019674	AATCC	2	10	124945	124954	40 %	20 %	0 %	40 %	480527975
76	NC_019674	AGTGT	2	10	127899	127908	20 %	40 %	40 %	0 %	480527979
77	NC_019674	CGATT	2	10	129020	129029	20 %	40 %	20 %	20 %	480527980
78	NC_019674	TCCAA	2	10	129067	129076	40 %	20 %	0 %	40 %	480527980
79	NC_019674	CAGGG	2	10	140014	140023	20 %	0 %	60 %	20 %	480527996
80	NC_019674	GATTT	2	10	141137	141146	20 %	60 %	20 %	0 %	480527997
81	NC_019674	GGGGC	3	15	146334	146348	0 %	0 %	80 %	20 %	480528000
82	NC_019674	TGGTA	2	10	146443	146452	20 %	40 %	40 %	0 %	480528000
83	NC_019674	GCGTG	2	10	146621	146630	0 %	20 %	60 %	20 %	480528000
84	NC_019674	CCTGC	2	10	148724	148733	0 %	20 %	20 %	60 %	480528002
85	NC_019674	CCTGC	2	10	150221	150230	0 %	20 %	20 %	60 %	480528004
86	NC_019674	GCCCT	2	10	152171	152180	0 %	20 %	20 %	60 %	480528005
87	NC_019674	ATTTG	2	10	153121	153130	20 %	60 %	20 %	0 %	480528005
88	NC_019674	GCTGC	2	10	153911	153920	0 %	20 %	40 %	40 %	480528006
89	NC_019674	GCAGG	2	10	159110	159119	20 %	0 %	60 %	20 %	480528012
90	NC_019674	GTGGA	2	10	159687	159696	20 %	20 %	60 %	0 %	480528012
91	NC_019674	TCACA	2	10	159698	159707	40 %	20 %	0 %	40 %	480528012
92	NC_019674	ATTTT	2	10	163038	163047	20 %	80 %	0 %	0 %	480528015
93	NC_019674	GCCTT	2	10	165250	165259	0 %	40 %	20 %	40 %	480528017
94	NC_019674	ACAAA	2	10	171510	171519	80 %	0 %	0 %	20 %	480528022
95	NC_019674	GCTTG	2	10	172447	172456	0 %	40 %	40 %	20 %	480528023
96	NC_019674	TTTAG	2	10	177968	177977	20 %	60 %	20 %	0 %	480528027
97	NC_019674	GCCAT	2	10	182417	182426	20 %	20 %	20 %	40 %	480528038
98	NC_019674	GTTTA	2	10	183463	183472	20 %	60 %	20 %	0 %	480528041
99	NC_019674	TTTGA	2	10	185990	185999	20 %	60 %	20 %	0 %	480528046
100	NC_019674	CACTG	2	10	189948	189957	20 %	20 %	20 %	40 %	480528050
101	NC_019674	CCACG	2	10	191041	191050	20 %	0 %	20 %	60 %	480528051
102	NC_019674	CCAAA	2	10	193691	193700	60 %	0 %	0 %	40 %	480528052
103	NC_019674	TTCTT	2	10	195153	195162	0 %	80 %	0 %	20 %	480528053
104	NC_019674	GCTGT	2	10	197309	197318	0 %	40 %	40 %	20 %	480528055
105	NC_019674	GCTGT	2	10	198580	198589	0 %	40 %	40 %	20 %	480528057
106	NC_019674	CTTTG	2	10	198763	198772	0 %	60 %	20 %	20 %	480528058
107	NC_019674	ACAAT	2	10	199770	199779	60 %	20 %	0 %	20 %	480528060
108	NC_019674	GGGCA	2	10	200584	200593	20 %	0 %	60 %	20 %	480528060
109	NC_019674	GGGAG	2	10	201522	201531	20 %	0 %	80 %	0 %	480528061
110	NC_019674	CATTG	2	10	201808	201817	20 %	40 %	20 %	20 %	480528062
111	NC_019674	CCCTC	2	10	203079	203088	0 %	20 %	0 %	80 %	480528066
112	NC_019674	GAGCG	2	10	204778	204787	20 %	0 %	60 %	20 %	480528068
113	NC_019674	GCGGG	2	10	205224	205233	0 %	0 %	80 %	20 %	480528068
114	NC_019674	ACAAA	2	10	206211	206220	80 %	0 %	0 %	20 %	480528069
115	NC_019674	ACACC	2	10	207027	207036	40 %	0 %	0 %	60 %	480528071
116	NC_019674	GGGCA	2	10	210062	210071	20 %	0 %	60 %	20 %	480528075
117	NC_019674	GTGCG	2	10	210987	210996	0 %	20 %	60 %	20 %	480528076
118	NC_019674	TTTGC	2	10	214001	214010	0 %	60 %	20 %	20 %	480528079
119	NC_019674	TGGGA	2	10	214041	214050	20 %	20 %	60 %	0 %	480528079
120	NC_019674	CAAGC	2	10	214122	214131	40 %	0 %	20 %	40 %	480528079
121	NC_019674	ACCAA	2	10	214258	214267	60 %	0 %	0 %	40 %	480528079
122	NC_019674	TACGC	2	10	214272	214281	20 %	20 %	20 %	40 %	480528079
123	NC_019674	TAGCC	2	10	215026	215035	20 %	20 %	20 %	40 %	480528080
124	NC_019674	CATCA	2	10	215417	215426	40 %	20 %	0 %	40 %	480528080
125	NC_019674	TGATG	2	10	216560	216569	20 %	40 %	40 %	0 %	480528081
126	NC_019674	AAGAA	2	10	216868	216877	80 %	0 %	20 %	0 %	480528081
127	NC_019674	CATGG	2	10	218979	218988	20 %	20 %	40 %	20 %	480528083
128	NC_019674	AACCA	2	10	220893	220902	60 %	0 %	0 %	40 %	480528085
129	NC_019674	GCAAG	2	10	222819	222828	40 %	0 %	40 %	20 %	480528088
130	NC_019674	GCTTG	2	10	224206	224215	0 %	40 %	40 %	20 %	480528090
131	NC_019674	CTTTG	2	10	224674	224683	0 %	60 %	20 %	20 %	480528090
132	NC_019674	ATTTT	2	10	227816	227825	20 %	80 %	0 %	0 %	480528091
133	NC_019674	CAACA	2	10	228637	228646	60 %	0 %	0 %	40 %	480528093
134	NC_019674	ACCCC	2	10	229317	229326	20 %	0 %	0 %	80 %	480528094
135	NC_019674	TCAAG	2	10	229785	229794	40 %	20 %	20 %	20 %	480528095
136	NC_019674	ACTTC	2	10	229856	229865	20 %	40 %	0 %	40 %	480528095
137	NC_019674	ATCGA	2	10	234518	234527	40 %	20 %	20 %	20 %	480528102
138	NC_019674	CCTAG	2	10	234566	234575	20 %	20 %	20 %	40 %	480528102
139	NC_019674	GCTTT	2	10	239305	239314	0 %	60 %	20 %	20 %	480528110
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148	NC_019674	ATCTC	2	10	257795	257804	20 %	40 %	0 %	40 %	480528123
149	NC_019674	GGGCA	2	10	258802	258811	20 %	0 %	60 %	20 %	480528123
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152	NC_019674	AAAAT	2	10	263045	263054	80 %	20 %	0 %	0 %	480528125
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245	NC_019674	CAAGC	2	10	417528	417537	40 %	0 %	20 %	40 %	480528314
246	NC_019674	TTTAT	2	10	418006	418015	20 %	80 %	0 %	0 %	480528314
247	NC_019674	TTGAT	2	10	418270	418279	20 %	60 %	20 %	0 %	480528314
248	NC_019674	CGGGG	2	10	419176	419185	0 %	0 %	80 %	20 %	480528317
249	NC_019674	AGCCT	2	10	419195	419204	20 %	20 %	20 %	40 %	480528317
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253	NC_019674	TGGCT	2	10	434421	434430	0 %	40 %	40 %	20 %	480528332
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255	NC_019674	AGAGC	2	10	437481	437490	40 %	0 %	40 %	20 %	480528334
256	NC_019674	GGGCT	2	10	440262	440271	0 %	20 %	60 %	20 %	480528337
257	NC_019674	GTCCT	2	10	441688	441697	0 %	40 %	20 %	40 %	480528338
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260	NC_019674	TGGGC	2	10	445139	445148	0 %	20 %	60 %	20 %	480528342
261	NC_019674	CAAAA	2	10	449348	449357	80 %	0 %	0 %	20 %	480528345
262	NC_019674	TGGTG	2	10	451760	451769	0 %	40 %	60 %	0 %	480528351
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264	NC_019674	TTTTA	2	10	458847	458856	20 %	80 %	0 %	0 %	480528357
265	NC_019674	CTCCA	2	10	460488	460497	20 %	20 %	0 %	60 %	480528359
266	NC_019674	GCGAT	2	10	463062	463071	20 %	20 %	40 %	20 %	480528362
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268	NC_019674	GCGAT	2	10	465032	465041	20 %	20 %	40 %	20 %	480528363
269	NC_019674	CATCG	2	10	465574	465583	20 %	20 %	20 %	40 %	480528363
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